脊髄性筋萎縮症における遺伝子型と表現型の関係についての研究

脊髓性肌萎缩症基因型与表型关系的研究

• 批准号: 20K16610
• 负责人: 加藤 環
• 金额: $ 2.25万
• 依托单位: Tokyo Women's Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K16610/
• 关键词: 脊髄性筋萎縮症; 遺伝子型と表現型; SMN1; 点変異; SNV; 次世代シークエンサー; long range PCR法; イントロン領域; 遺伝学的診断; 表現型; long range PCR

2017年1月から2019年3月までに当研究室でMultiplex Ligation-dependent Probe Amplification（MLPA）法が実施された323例を候補とした。このうち、SMN1のエクソン8が削除されている158例を除外した。残りの165例の主治医に説明用同意文書と運動機能質問票を送付した。62症例が解析対象例とされた。彼らから採取したDNAサンプルは、LR-PCRとNGSで解析された。NGSデータはillumine variant studioとintegrative genomics viewer(IGV)を用いて解析した。採取した62のDNAサンプルすべてについてNGSが完了した。2例で病原性変異が同定された。1例はSMN1が2コピーでホモ接合体変異が検出され、両親はいとこ婚であった。全体では、SMN1のエクソン7のコピーが0、1、2、3であった患者はそれぞれ7、7、45、3人であった。イントロン領域で同定されたSNVの数は、イントロン1が18、イントロン2aが6、イントロン2bが3、イントロン4が12、イントロン5が2、イントロン6が23である。臨床的にSMAと診断された患者62名のDNAサンプルのゲノム解析において、SNVはイントロン6に集中し、2名の患者が5q-SMAと遺伝的に診断された。2022年度の日本人類遺伝学会学術集会にて発表し、現在論文化を進めている。

From January 2017 to March 2019, 323 cases of Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) method have been implemented in the research laboratory. Except for 158 cases, SMN1 and 8 were eliminated. 165 cases of disability and attending doctors with written consent and motion function questions were sent 62 cases were analyzed. DNA analysis by PCR and NGS. NGS is an illumination variant studio and an integral genetics viewer(IGV). The NGS was completed when DNA was extracted from 62 samples. 2 cases of pathogenic variation were identified. 1 case SMN1 2 The whole body, SMN1 The number of SNVs in the domain is equal to 18, 2a to 6, 2b to 3, 4 to 12, 5 to 2, 6 to 23. Clinical diagnosis of SMA 62 patients DNA analysis, SNV analysis 6, 2 patients 5q-SMA diagnosis 2022 Japan Society of Human Heritage Academic Conference on the development of culture, the present discussion on the development of culture

项目成果

Genomic analysis study of the SMN1 gene region in patients with clinically diagnosed SMA

临床诊断的SMA患者SMN1基因区域的基因组分析研究

• 发表时间: 2022
• 作者: Kitani-Morii Fukiko;Kasai Takashi;Horiguchi Go;Teramukai Satoshi;Ohmichi Takuma;Shinomoto Makiko;Fujino Yuzo;Mizuno Toshiki;松原 崇一朗;Tamaki Kato
• 通讯作者: Tamaki Kato

今後導入が予定・期待される新生児スクリーニング

计划并预计在未来推出新生儿筛查

• 发表时间: 2021
• 期刊: 周産期医学
• 作者: Soichiro Matsubara;Makoto Nakajima;齋藤 加代子 加藤 環 松尾 真理
• 通讯作者: 齋藤 加代子 加藤 環 松尾 真理

SMN遺伝子領域のゲノム解析によるSMA患者の遺伝子型と表現型の研究

通过SMN基因区域基因组分析研究SMA患者的基因型和表型

• 发表时间: 2021
• 作者: 山口剛史;浜田俊幸;飯島典生;加藤環
• 通讯作者: 加藤環