Development of a highly sensitive sex determination method using the novel primer set
Development of a highly sensitive sex determination method using the novel primer set
批准号:
20K18803
负责人:
藤本 佳那
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
身元不明遺体における個人識別や自然人類学における古人骨の鑑定では、性別判定は重要な鑑定事項である。特に、DNA解析による性別判定は、形態人類学的特徴を利用できない試料にも適用でき、有用性が高い。法医DNA型鑑定で取り扱う試料は環境要因や微生物の影響をうけ容易に分解されるため、高度に変性した微量な試料から正確に判定を行うことが求められている。従来の報告では、主にアメロゲニン遺伝子のIntron領域の男女差を用いた判定が行われている。しかし、この領域は多型性が非常に高く、判定領域の遺伝子変異によって正確な判定が行えない事例が存在する。DNA鑑定による性別判定を確実なものとするためには、男女差以外の多型が可能な限り少ない座位を用いる必要がある。そこで、ヒトアメロゲニン遺伝子のExon領域の全長配列について、BLAST:Basic Local Alignment Search Toolを用いた塩基配列の相同性検索を行った。その結果、遺伝的保存性の高いExon 1領域に着目して、性別判定用プライマーセットを開発した。現在広く法医DNA型鑑定に用いられているGlobalFiler PCR Amplification Kit (GF)との比較を行い、正確な性別判定を安定しておこなうために必要なDNA量を検討する。そして、高度に断片化した古人骨試料を用いて本法とGFを用いて、比較実験を行い本法の有用性を検討する。本法はPCR産物の鎖長が短く、高度断片化試料についても適用可能、かつ手技が簡便で迅速、安価であり、法医学及び自然人類学に貢献できると考える。
英文摘要
身元不明遺体における個人識別や自然人類学における古人骨の鑑定では、性別判定は重要な鑑定事項である。特に、DNA解析による性別判定は、形態人類学的特徴を利用できない試料にも適用でき、有用性が高い。法医DNA型鑑定で取り扱う試料は環境要因や微生物の影響をうけ容易に分解されるため、高度に変性した微量な試料から正確に判定を行うことが求められている。従来の報告では、主にアメロゲニン遺伝子のIntron領域の男女差を用いた判定が行われている。しかし、この領域は多型性が非常に高く、判定領域の遺伝子変異によって正確な判定が行えない事例が存在する。DNA鑑定による性別判定を確実なものとするためには、男女差以外の多型が可能な限り少ない座位を用いる必要がある。そこで、ヒトアメロゲニン遺伝子のExon領域の全長配列について、BLAST:Basic Local Alignment Search Toolを用いた塩基配列の相同性検索を行った。その結果、遺伝的保存性の高いExon 1領域に着目して、性別判定用プライマーセットを開発した。現在広く法医DNA型鑑定に用いられているGlobalFiler PCR Amplification Kit (GF)との比較を行い、正確な性別判定を安定しておこなうために必要なDNA量を検討する。そして、高度に断片化した古人骨試料を用いて本法とGFを用いて、比較実験を行い本法の有用性を検討する。本法はPCR産物の鎖長が短く、高度断片化試料についても適用可能、かつ手技が簡便で迅速、安価であり、法医学及び自然人類学に貢献できると考える。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1016/j.legalmed.2022.102136
发表时间:
2022-08-29
期刊:
LEGAL MEDICINE
影响因子:
1.5
作者:
[Fujimoto,Kana, Fujii,Gento, Adachi,Noboru]
通讯作者:
Adachi,Noboru
新規プライマーセットを用いた高感度性別判定法の開発
使用新引物组开发高灵敏度性别测定方法
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
DNA多型 DNA Polymorphism
影响因子:
--
作者:
[藤本佳那, 藤井元人, 猩々英紀, 角田恒雄, 上木耕一郎, 安達登]
通讯作者:
安達登
Development of a highly sensitive sex determination method using the novel primer set.
使用新型引物组开发高灵敏度性别测定方法。
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[藤本佳那, 小泉舞, 藤井元人, 猩々英紀, 角田恒雄, 井口蘭, 齋藤正夫, 上木耕一郎, 安達登.]
通讯作者:
安達登.
国内基金
海外基金
重组Amelogenin多肽TRAP调节早期牙釉质龋仿生再矿化行为及机制研究
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批准号:U2004108
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项目类别:联合基金项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2020
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负责人:楚金普
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依托单位:
重组Amelogenin和EMPs诱导骨髓基质细胞成骨分化及其调控机制的比较研究
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批准号:81070838
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项目类别:面上项目
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资助金额:35.0万元
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批准年份:2010
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负责人:束蓉
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依托单位:
amelogenin 基因修饰骨髓基质细胞促进牙周再生的实验研究
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批准号:30672315
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项目类别:面上项目
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资助金额:28.0万元
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批准年份:2006
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负责人:束蓉
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依托单位: