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Construction of preemptive medicine for rheumatoid arthritis based on proteomics and artificial intelligence of a medical examination cohort

基于体检队列蛋白质组学和人工智能的类风湿性关节炎抢先治疗构建

基本信息

批准号：
20K20617
负责人：
大山要
金额：
$ 16.56万
依托单位：
Nagasaki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-07-30 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K20617/
关键词：
健診コホート免疫複合体人工知能関節リウマチ先制医療

项目摘要

離島コホートの血清検体に含まれる免疫複合体抗原の一斉同定結果（2021年度解析分を含む）をもとに、RA超早期から出現する抗原の特定を試みた。最終的に56名の離島コホート64検体を解析した。なお、全検体が抗シトルリン化ペプチド抗体陽性であった。過去に解析した早期RA、全身性エリテマトーデス、強皮症、シェーグレン症候群で検出された免疫複合体抗原を比較対照とした（Ann Rheum Dis 2012；Clin Biochem 2015；Clin Exp Immunol 2021；J Autoimmun 2023）。離島コホートでは447種類の免疫複合体抗原が同定された。このうち、比較対照群で検出されず、離島コホートのみで検出される免疫複合体抗原が2種類特定できた。この免疫複合体抗原は早期RAでも検出されなかったため、抗シトルリン化ペプチド抗体陽性ではあるが、症状が現れる（早期RA）前の超早期RAに特徴的なものと考えられた。さらに、シトルリン化タンパク質に絞った免疫複合体抗原解析についても同様の比較を行い、超早期RAに特徴的または特異的なシトルリン化配列（ペプチド）の特定を継続中である。他方、上記の解析で得たMSスペクトル、MS/MSスペクトルのシグナル強度を利用してラベルフリー定量を行った。個々の免疫複合体抗原の量を示すデータであり、疾患／免疫複合体抗原／量に基づく特徴付けを人工知能解析で進めている。また、架橋質量分析法を応用して、自己抗原化における異常本体である抗原決定基（エピトープ）を特定する方法を開発した（投稿論文英文校正中）。この手法を用いて、上記の特徴的な免疫複合体抗原のエピトープ特定を開始した。

The results of the same determination of the Ryoshima Islands Serum Test System Containing Immune Complex Antigen (2021 Analytical Score), and the ultra-early onset of RA and the specific test of the antigen. The final analysis of に56名の岛コホート64検体を. Nata, the whole body is positive for anti-Structural antibodies. In the past, we analyzed early RA, systemic Erythromycin, hygroderma, and Erythromycin syndrome, and compared them with immune complex antigens (Ann Rheum Dis 2012; Clin Biochem 2015; Clin Exp Immunol 2021; J Autoimmun 2023). Immune complex antigens of 447 species in Ryoshima Island.このうち, Comparative 対毾群で検出されず, Ryoshima コホートのみで検出されるimmune complex antigen が2 species-specific できた.このimmune complex antigen は early RA でも検出されなかったため, anti-シトルリンペプチド antibody A positive test, a symptom that is not present (early RA), a special test of super early RA in front of the test.さらに、シトルリン化タンパク性に twistったImmune complex antigen analysis についても同様のComparison を行い, the special なシトルリン arrangement (ペプチド) of the special または of ultra-early RA. In other words, the above-mentioned analysis and analysis, MS/MS スペクトルのシグナルstrength and utilization of quantification method. The amount of individual immune complex antigens is shown, and the diseases/immune complex antigens/quantity of immune complex antigens can be analyzed using artificial intelligence.また, bridging mass analysis method を応用して, self-antigenation における abnormal ontology である epitope (エピトープ) をspecific する method を开発した (the submitted paper is being corrected in English). The technique starts with the specific immune complex antigen listed above.