RNA高次構造ダイナミクスを介した植物環境応答システムの解明
RNA高次構造ダイナミクスを介した植物環境応答システムの解明
批准号:
20K21415
负责人:
大谷 美沙都
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-07-30 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究では、植物のロバストな細胞形質発現を可能にする環境応答システムとして「RNA高次構造ダイナミクス」に着目し、温度依存的なRNA高次構造ダイナミクス情報の新規取得、さらには、植物における「RNAサーモメーター」の同定を目指して解析を行っている。2021年度の22℃、28℃の温度条件で育てたシロイヌナズナ芽生えに関するトランスクリプトームデータの比較解析の結果、温度依存的にオーキシン関連遺伝子のmRNA代謝が大きく変化することが明らかとなっていた。一方で、シロイヌナズナpre-mRNAスプライシング関連変異体の解析から、芽生えの成長は温度(16℃、22℃、28℃)とサイトカイニンの両方に依存することがわかった。そこで、サイトカイニン、温度の両条件を変化させた条件でトランスクリプトーム解析を行った結果、新たに温度とサイトカイニンに依存したオーキシン関連遺伝子の発現変動が検出された。以上はmRNAプロセシング制御に対する温度と植物ホルモンの複雑な相互作用性を示唆しており、予想外ながらも非常に興味深い成果であった。
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Importance of Nonsense-mediated mRNA Decay in Auxin Signaling during in vitro Organogenesis and Development in Plants
无义介导的 mRNA 衰变在植物体外器官发生和发育过程中生长素信号传导中的重要性
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Chiam Nyet-Cheng, 藤村 朋世, 佐野 亮輔, 出村 拓, 大谷 美沙都]
通讯作者:
大谷 美沙都
DOI:
10.14952/seikagaku.2022.940861
发表时间:
2022
期刊:
生化学
影响因子:
--
作者:
[高柳なつ, 大谷美沙都]
通讯作者:
大谷美沙都
Roles for mRNA quality control in the organ regeneration of plants
mRNA 质量控制在植物器官再生中的作用
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山口夏実, 有吉眞理子, 深川竜郎, Misato Ohtani]
通讯作者:
Misato Ohtani
栄養条件依存的な植物成長制御にはマイナータイプスプライシングが関与する
次要型剪接参与营养依赖性植物生长控制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[石橋鴻大, 荒江星拓, 吉積毅, 栗原志夫, 黒森崇, 松井南, 大谷美沙都]
通讯作者:
大谷美沙都
How to transcribe and modify what kinds of snRNAs: Metabolic regulation of snRNAs is a key to environment-appropriate control of plant development
如何转录和修饰什么样的snRNA:snRNA的代谢调控是环境适宜控制植物发育的关键
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Ayumi Masui, Keisuke Yuzu, Keiichi Yamaguchi, Yuji Goto, Yasushi Kawata, and Eri Chatani, 藤田恭之, Ohtani M]
通讯作者:
Ohtani M
共 13 条
NAC転写因子VNS群が駆動する植物細胞の機能分化の分子機構
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批准号:23K27189
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.32万
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财政年份:2024
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负责人:大谷 美沙都
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依托单位:
Molecular mechanisms of functional differentiation of plant cells driven by the VNS group of NAC transcription factors
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批准号:23H02496
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.06万
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财政年份:2023
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负责人:大谷 美沙都
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依托单位:
Elucidation of primary cell wall dynamics to regulate water conductivity of xylem vessel cells
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批准号:20H03271
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.4万
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财政年份:2020
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负责人:大谷 美沙都
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依托单位:
植物におけるmRNA前駆体スプライシング制御機構とその生理的意義の解明
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批准号:18870028
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
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资助金额:$1.57万
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财政年份:2006
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负责人:大谷 美沙都
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依托单位:
脱分化と分裂組織形成に関わる遺伝子SRD2の解析
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批准号:02J08536
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2002
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负责人:大谷 美沙都
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依托单位:
海外基金