医師の臨床判断を考慮した実診療データにおける欠測値の新しい推定方法
医師の臨床判断を考慮した実診療データにおける欠測値の新しい推定方法
批准号:
20K21715
负责人:
奥原 義保
金额:
$3.99万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-07-30 至 2024-03-31
中文摘要
蛋白電気泳動波形と生化学・血液検査結果を用いて、2クラス判別ではなく定量的に検査値を推定するため3つの方法を検討した。1.波形のピーク位置とピーク面積を計算、ピークの面積と検査値との相関係数が最も大きいピークをその検査に対応するピークと考え、その面積から検査値を推定する。ある点(移動度)の両側決められた幅の中で、その点が最大値であれば局所的ピークとし、幅の中の要素の値すべてからその点の標準偏差を求め、波形のピーク位置とピーク面積を計算した。2.複数のGauss型波形の存在を仮定しGauss-Newton法により求めたピーク位置とピークの面積を用い、1.と同様の方法で検査値を推定する。3.各点における振幅の値を説明変数、検査値を目的変数とした重回帰モデルにより検査値を推定する。アルブミン,CRP,HDL,LDL,AST,コリンエステラーゼ,PLT,HbA1c,BUNを対象に評価した結果、重回帰分析が最も良いモデルであったが、自由度で調整した決定係数が最も大きかったアルブミンでも0.8187であり、ASTの -0.02202などモデルの評価が低い検査もあり、十分な性能とは言い難かった。このため、検査結果の定量的推定については保留し、昨年度進めた勾配ブースティング決定木(GBDT)による2クラス分類の予測モデルを用い、蛋白泳動は測定されたが生化学・血液検査に欠測がある場合の検査値を推定、欠測している検査の推定値が基準値内に存在する割合が生化学・血液検査がオーダーされた場合と違いがあるか評価した。その結果、WBCの3.2(基準値内に存在する割合の比)からALBの1.11、ASTの0.53などが混在し、「臨床医が異常有りと推論しなかったのでオーダーしなかった。」という仮説が単純には成り立っていないことが示された。原因として、ルーチン的に行う検査の存在などが考えられる。
英文摘要
蛋白電気泳動波形と生化学・血液検査結果を用いて、2クラス判別ではなく定量的に検査値を推定するため3つの方法を検討した。1.波形のピーク位置とピーク面積を計算、ピークの面積と検査値との相関係数が最も大きいピークをその検査に対応するピークと考え、その面積から検査値を推定する。ある点(移動度)の両側決められた幅の中で、その点が最大値であれば局所的ピークとし、幅の中の要素の値すべてからその点の標準偏差を求め、波形のピーク位置とピーク面積を計算した。2.複数のGauss型波形の存在を仮定しGauss-Newton法により求めたピーク位置とピークの面積を用い、1.と同様の方法で検査値を推定する。3.各点における振幅の値を説明変数、検査値を目的変数とした重回帰モデルにより検査値を推定する。アルブミン,CRP,HDL,LDL,AST,コリンエステラーゼ,PLT,HbA1c,BUNを対象に評価した結果、重回帰分析が最も良いモデルであったが、自由度で調整した決定係数が最も大きかったアルブミンでも0.8187であり、ASTの -0.02202などモデルの評価が低い検査もあり、十分な性能とは言い難かった。このため、検査結果の定量的推定については保留し、昨年度進めた勾配ブースティング決定木(GBDT)による2クラス分類の予測モデルを用い、蛋白泳動は測定されたが生化学・血液検査に欠測がある場合の検査値を推定、欠測している検査の推定値が基準値内に存在する割合が生化学・血液検査がオーダーされた場合と違いがあるか評価した。その結果、WBCの3.2(基準値内に存在する割合の比)からALBの1.11、ASTの0.53などが混在し、「臨床医が異常有りと推論しなかったのでオーダーしなかった。」という仮説が単純には成り立っていないことが示された。原因として、ルーチン的に行う検査の存在などが考えられる。
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
蛋白分画検査の波形情報を使用した血液検査の欠測値補間の試み
尝试使用蛋白质分离测试中的波形信息来插入血液测试中的缺失值
DOI:
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发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[兵頭勇己, 久原太助, 檜山麻里子, 安井繁宏, 畠山豊, 奥原義保]
通讯作者:
奥原義保
RWDに基づく臨床推論過程の定式化と集団知としての臨床推論システムの実現
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批准号:21H03164
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.56万
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财政年份:2021
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负责人:奥原 義保
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依托单位: