アジア・アフリカの新興感染症ホットスポット域におけるウイルス進化動態の調査研究

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本申請では、新興感染症ホットスポットの中東（エジプト）と東南アジア（ベトナム）の研究機関と連携し、地域に生息する野生動物と家畜が保有するウイル スを系統的に検知することで、自然界でのウイルスの維持メカニズムを明らかにする。 具体的には、以下の1)～５）研究を実施する。１）エジプトにおける野生動物と家畜が保有するウイルスの同定。２）ベトナムにおける野生動物と家畜が保有 するウイルスの同定。３）各地域に分布するウイルスの進化動態の解明。４）ウイルスの宿主域の変化動態の解明。５）大陸間の情報比較によるグローバルなウイルス伝播の解明本年度についても、COVID-19の継続的な蔓延状況を鑑み、海外渡航を中止せざるを得なかった。一方で、海外カウンターパートと現地の感染症蔓延状況についてWeb会議を継続して実施できたため、次年度（最終年度）に予定する現地調査を効率的に実施する準備が整っている。また国内においても代替的に国立感染症研究所を介して海外で流行するウイルス株の分与を受けて基礎的な研究が可能である。そこで、国立感染症研究所より、SARS-CoV-2のアルファ株、ベータ株、ガンマ株、 カッパー株、デルタ株、オミクロン株の分与を受けて各地域で出現した変異株の比較解析を実施した。特にオミクロン株の病原性解析においては、祖先的な武漢株と比較して、ヒト気道再構築モデルにおいてウイルス複製能の低下が観察された。またIFN応答が減弱しており、免疫誘導能をもつ短鎖viral RNA産生量低下と部分的に関連している可能性が示された。これらの知見は、各地域で出現した変異ウイルスにおいて宿主適応性などに相違が生じ始めていることを示唆した。