凝集体を介した染色体転座発生メカニズムの解明

阐明聚集体介导的染色体易位机制

• 批准号: 20KK0339
• 负责人: 安原 崇哲
• 金额: $ 8.99万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020 至 2023
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20KK0339/
• 关键词: 染色体転座; 凝集体; 転写; がんゲノム異常

これまでの研究で、遺伝子融合が広範な転写の阻害によって増加するということが判明したことから、「転写活性化領域には染色体転座が発生する潜在的なリスクがある」という仮説を立てた。この仮説を検証するため、まず、がんゲノムデータベースTCGAを用いた解析を行った。遺伝子領域で生じた染色体転座、つまり遺伝子融合を起こした遺伝子のコホートにおける発現分布と、全遺伝子の発現分布を比較したところ、がんサンプルにおいて遺伝子融合を起こした遺伝子の発現は顕著に高発現側に偏っていることが分かった。つまり、転写が活性化している遺伝子は、遺伝子融合を生じやすいという仮説を支持した。さらに、転写伸長阻害下での遺伝子融合頻度の増加に、液－液相分離を介した凝集体が関与していることが示唆されたことから、染色体転座計測系を用いて高発現遺伝子と低発現遺伝子における融合発生頻度の比較を行う実験、FISHと免疫染色を組み合わせて、高発現遺伝子領域の凝集内への局在を検証する実験を行った。その結果、高発現遺伝子は低発現遺伝子に比べて有意に染色体転座の頻度が高いこと、さらに、高発現遺伝子領域は凝集内へと局在しやすいことが判明した。当研究を通して、「なぜ転写領域において染色体転座が起きるのか」また、もし転写領域に染色体転座が本来的に起きやすいとすれば「転写に関連したクロマチンの構造が遺伝子融合を起こしやすい環境を作っているのか」という問い対して、転写機構とゲノム異常の発生の関係性を様々な角度から解析することで、がんゲノム異常が発生するメカニズムの解明を目指す。今年度は当研究の成果をまとめた論文を出版した（Yasuhara et al. Molecular Cell 2022）。さらに、イメージング解析を主体として、転写阻害後に生じる凝集体の性質と、その性質が染色体転座の促進にどのように寄与しているかについて解析を行った。

The purpose of this study is to identify the potential health problems in the field of activation of chromosomes in the field of activity. in this paper, the research and fusion methods are used to determine the potential health problems in the field of activation. Please parse the rows using the parsing TCGA. In the sub-field, the chromosome is located, and the chromosome is fused. In the field, the chromosome is located, the chromosome is fused, and the chromosome is fused. To activate the child, to activate the child, to fuse the child, to give birth to the child, to support the child. Under the conditions of high temperature and elongation, the degree of fusion was increased, liquid-liquid phase separation was used to induce the fusion of condensate, and the chromosome pedestal was used to measure the level of agglutination. the chromosome pedestal test system was used to measure the fusion temperature of high temperature, low temperature and low temperature, and FISH immunostaining was used to detect the fusion temperature. In the field of agglutination, the local office is responsible for the operation of the system. The results show that the temperature of the chromosome is higher than that of the chromosome in the field of agglutination. in the field of agglutination, the location of the chromosome is higher than that of the chromosome. When you study the field of communication, the field of communication, the location of the chromosome, and the original location of the field of chromosomes, the environment is affected by the fusion of the system. The writing machine is responsible for the analysis of the information system, the analysis of the information system, and the analysis of the information system. When the results of the research were published this year (Yasuhara et al. Molecular Cell 2022). In this paper, we analyze the main body, the body, the coagulum, the chromosome, the body, the chromosome, the body, the body and the body.

项目成果

Genome maintenance by RNA-mediated stress responses

RNA介导的应激反应维持基因组

• 发表时间: 2022
• 作者: 二瓶泰雄;Tomiko Yamaguchi;Takaaki Yasuhara
• 通讯作者: Takaaki Yasuhara

染色体転座の発生メカニズムに迫る

探讨染色体易位发生的机制

• 发表时间: 2022
• 作者: Moran-Valencia Marien;Nishi Kento;Akizuki Shinichi;Ida Junichi;Cuevas-Rodriguez German;Cervantes-Aviles Pabel;安原 崇哲
• 通讯作者: 安原 崇哲

RNA を介したゲノム安定性の維持機構

RNA介导的基因组稳定性维持机制

• 发表时间: 2022
• 期刊: 月刊「アグリバイオ」
• 作者: Koyasu N;Hyodo F;Iwasaki R;Iwasaki R; Mori T;Yamaguchi T;Matsuo M;安原 崇哲
• 通讯作者: 安原 崇哲

Active RB causes visible changes in nuclear organization.

• DOI: 10.1083/jcb.202102144
• 发表时间: 2022-03-07
• 期刊: The Journal of cell biology
• 作者: Krishnan B;Yasuhara T;Rumde P;Stanzione M;Lu C;Lee H;Lawrence MS;Zou L;Nieman LT;Sanidas I;Dyson NJ
• 通讯作者: Dyson NJ

リボソームRNAを足場とした液―液相分離によるゲノム制御機構

以核糖体RNA为支架的液-液相分离基因组控制机制

• 发表时间: 2022
• 作者: Hirata Yusuke;Kashiwabara Naoki;Nada Yuki;Inoue Aya;Sato Emiko;Noguchi Takuya;Matsuzawa Atsushi;安原 崇哲
• 通讯作者: 安原 崇哲