未培養微小真核生物群の生態・機能解明による活性汚泥食物環モデルの再構築

阐明未培养微真核生物的生态和功能重建活性污泥食物循环模型

基本信息

  • 批准号:
    21H01460
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 11.15万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

日本各地から採取した合計276の下水処理汚泥サンプル中の原核生物および真核生物の群集構造をアンプリコンシーケンス解析により明らかにした。原核生物は16S rRNA遺伝子のV3-V4領域を、真核生物は18S rRNAのV9領域を対象とした。シーケンシングはイルミナ社のMiSeq、解析にはQIIME2を用いた。主座標分析において、原核生物の群集構造は処理プロセスあるいは処理場の違いによりその類似性が異なる傾向が見られたが、真核生物の方は見られなかった。標的とする微小真核生物群のサンプル中における存在割合(真核生物を100%とした時)は、多いときで90%を超えるのに対し、検出されないサンプルもあった。標的とする微小真核生物のポピュレーションダイナミクスに季節的な傾向や処理場や処理プロセスによる影響は見られておらず、優占化する環境因子は未解明である。ただこれはアンプリコンシーケンス解析による真核生物中の割合であり、サンプル全体に占める割合とは異なるため、定量PCRなどによる解析を行うことが必要であると考えられた。ネットワーク解析では、これまで検討した中では、特定のグループとの関連性はoperational taxonomic unitレベルでは見られていない。今後は対象を原核生物との関連性に広げて行く予定である。一部着目に値するサンプルについて定量PCRを行い、標的とする微小真核生物の存在率が高いと思われるサンプルについてメタゲノム解析を開始した。
A total of 276 sewage treatment sludge samples from various parts of Japan were collected and analyzed for the cluster structure of prokaryotes and eukaryotes. Prokaryotes have 16S rRNA genes in the V3-V4 domain, while eukaryotes have 18S rRNA genes in the V9 domain. MiSeq, QIIME2, QIIME2, QIIME3, QIIME4, QIIME5, QIIME6, QIIME7, QIIME8, QIIME9, QIIME9, Q Principal coordinate analysis, prokaryote cluster structure, treatment field, similarity tendency, eukaryote structure The target micro-eukaryote population is divided into two groups (eukaryotes are 100% and 90% respectively). The environmental factors affecting the growth and development of microeukaryotes are still unknown. The analysis of eukaryotic cells is necessary. The relationship between a specific taxonomic unit and a specific taxonomic unit is discussed in detail. In the future, the relationship between prokaryotes and animals will be determined. The presence of microeukaryotes in quantitative PCR was high in some species, and the analysis of microeukaryotes began.

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Strategy for Metagenomic Analysis of Patescibacteria in Activated Sludge
活性污泥中 Patescibacteria 宏基因组分析策略
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    〇Shuka Kagemasa;Kyohei kuroda;Ryosuke Nakai;Yu-You Li;Kengo Kubota
  • 通讯作者:
    Kengo Kubota
Microbial community and the core microbiome of activated sludge treating sewage in Japan
日本活性污泥处理污水的微生物群落和核心微生物组
薬剤製造廃水処理における微生物群集構造の変遷
制药废水处理中微生物群落结构的变化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    泉偲緒里;江口拓;安本さいか;李玉友;佐藤幹子;久保田健吾
  • 通讯作者:
    久保田健吾
活性汚泥中に存在しているPatescibacteriaの多様性と代謝特性
活性污泥中Patescibacteria的多样性和代谢特征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    景政柊蘭;黒田恭平;中井亮佑;李玉友;久保田健吾
  • 通讯作者:
    久保田健吾
サイズ分画とメタゲノムによる活性汚泥中のPatescibacteriaの機能解析
使用尺寸分级和宏基因组学对活性污泥中的 Patescibacteria 进行功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    景政 柊蘭;黒田 恭平;中井 亮佑;李 玉友;久保田 健吾
  • 通讯作者:
    久保田 健吾
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  • 资助金额:
    $ 11.15万
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    Standard Grant
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