Development of analysis methods for S-polythiolated proteins : Fundamental studies toward S-polythiolated proteomics
S-多硫醇化蛋白质分析方法的开发:S-多硫醇化蛋白质组学的基础研究
基本信息
- 批准号:21H02082
- 负责人:
- 金额:$ 11.15万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
2021年度、高速液体クロマトグラフィー-タンデム型質量分析装置(LC-MS/MS)を用いて、従来解析が困難であったタンパク質中の酸化型活性イオウの解析法、システイン高含有タンパク質の還元型活性イオウの解析法を確立した。酸化型活性イオウ構造を持つタンパク質として、細菌の硫化水素センサータンパク質である大腸菌YgaVを用い、申請者が開発した活性イオウ解析に特化した新規アルキル化試薬 N-iodoacetyl l-tyrosine methyl ester (TME-IAM)を用いて、YgaVタンパク質の活性イオウ構造を解析した。その結果、YgaVタンパク質が硫化水素依存的に分子内テトラスルフィド構造を形成することが明らかになった(Antioxidants 2022)。また、システイン高含有タンパク質としてヒトKeap1を用い、細胞内での活性イオウ構造を解析するための抽出法を開発した。大腸菌内で発現させた組換えヒトKeap1を、抽出と同時にTME-IAMで標識・安定化して、プロテアーゼ消化を行ったのち、消化物をLC-MS/MSを用いて解析した。その結果、151番目のCysが活性イオウ化されていることが明らかになった。2022年度も、LC-MS/MSを用いて、様々なタンパク質(ヒト血清アルブミン、ヒトグリセルアルデヒド-3-リン酸脱水素酵素、インフラマソームの構成要素NLRP3、ヒトインスリン など)の解析を行い、還元型および酸化型活性イオウ構造を同定した。また、酸化型活性イオウ構造を解析する方法として、HPLCで分離した酸化型活性イオウ化ペプチド複合体を、エレクトロスプレーイオン化法でイオン化する際に、イオン化条件を調節することで、酸化型活性イオウ構造が選択的に開裂する方法(ionization dependent Cleavage of PolySulfur :iCPS)法を開発した。
In 2021, high speed liquid crystal mass spectrometer (LC-MS/MS) was used to analyze the acid type activity in the sample, and the high content of the acid type activity in the sample was established. Acid-type active substance structure analysis, application of bacteria sulfide substance analysis, application of applicant to develop active substance analysis, application of new chemical test agent N-iodoacetyl l-tyrosine methyl ester (TME-IAM), analysis of active substance structure analysis of YgaV As a result, the formation of intramolecular structures dependent on sulfur and water elements in YgaV compounds has been investigated (Antioxidants 2022). The extraction method for the analysis of intracellular activity and structure was developed. E. coli development, transformation, extraction, identification, stabilization, digestion, LC-MS/MS analysis As a result, the 151-point Cys are active. In 2022, LC-MS/MS was used to analyze and determine the structure of the enzyme (serum protein, protein A method for analyzing the structure of acidified active compounds by HPLC was developed to isolate acidified active compounds and to adjust the conditions for their neutralization by ionization dependent Cleavage of polysulfide (iCPS).
项目成果
期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
nNOS splice variants regulate NO/ROS redox signaling via 8-nitro-cGMP formation: its potential involvement in Parkinson's disease-like neurotoxicity
nNOS 剪接变体通过 8-硝基-cGMP 形成调节 NO/ROS 氧化还原信号传导:其可能参与帕金森病样神经毒性
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Shingo Kasamatsu;Kumiko Masuda;Hiroyasu Tsutsuki;Tomoaki Ida;Tsuyoshi Takata;Motohiro Nishida;Yasuo Watanabe;Tomohiro Sawa;Takaaki Akaike;Hideshi Ihara
- 通讯作者:Hideshi Ihara
High-Precision Sulfur Metabolomics Innovated by a New Specific Probe for Trapping Reactive Sulfur Species
- DOI:10.1089/ars.2020.8073
- 发表时间:2021-01-04
- 期刊:
- 影响因子:6.6
- 作者:Kasamatsu, Shingo;Ida, Tomoaki;Akaike, Takaaki
- 通讯作者:Akaike, Takaaki
Analysis of polysulfide profile changes in broccoli during germination
西兰花发芽过程中多硫化物谱变化分析
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Takuma Owaki ;Shingo Kasamatsu ;Hideshi Ihara
- 通讯作者:Hideshi Ihara
S-allyl cysteine increases blood flow in NO-dependent and -independent manners
S-烯丙基半胱氨酸以 NO 依赖性和非依赖性方式增加血流量
- DOI:10.24659/gsr.9.3_146
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Takemura S;Ihara H;Nakagawa K;Minamiyama Y
- 通讯作者:Minamiyama Y
A mass spectrometry-based technology for exploration of endogenous persulfides/polysulfides
用于探索内源过硫化物/多硫化物的基于质谱的技术
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Shingo kasamatsu;Hideshi Ihara
- 通讯作者:Hideshi Ihara
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
居原 秀其他文献
アルコールデヒドロゲナーゼ5(ADH5)のニトロソグルタチオン還元酵素(GSNOR)反応の選択的欠損マウスの開発
选择性缺乏乙醇脱氢酶 5 (ADH5) 亚硝基谷胱甘肽还原酶 (GSNOR) 反应的小鼠的发育
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
松永哲郎;笠松真吾;西村 明;井田智章;守田匡伸;居原 秀;下田 翔;西田基宏;本橋ほづみ;赤池孝章 - 通讯作者:
赤池孝章
細胞の酸化ストレスを量る 親電子化合物8-nitro-cGMPの定量を例に見つける、量る、可視化する! 質量分析実験ガイド
使用亲电子化合物 8-硝基-cGMP 的定量检测、测量和可视化测量细胞氧化应激!
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
澤 智裕;居原 秀;赤池孝章 - 通讯作者:
赤池孝章
ニトロソグルタチオン代謝酵素アルコールデヒドロゲナーゼ5のタンパク質ポリスルフィド化による制御機構
蛋白质多硫化对亚硝基谷胱甘肽代谢酶乙醇脱氢酶5的控制机制
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
井田 智章;西村 明;守田 匡伸;松永 哲郎;澤 智裕;居原 秀;藤井 重元;本橋 ほづみ;赤池 孝章;橋本祐輔,野村隆浩,平川秀忠,玉井清子,谷本弘一,富田治芳;井田 智章,西村 明,守田 匡伸,松永 哲郎,澤 智裕, 居原 秀,藤井 重元,本橋ほづみ,赤池 孝章;橋本祐輔,野村隆浩,谷本弘一,富田治芳;藤井 重元,笠松真吾,Md. Morshedul Alam,井田 智章,守田 匡伸, 居原 秀,西村 明,松永 哲郎,本橋ほづみ,赤池 孝章 - 通讯作者:
藤井 重元,笠松真吾,Md. Morshedul Alam,井田 智章,守田 匡伸, 居原 秀,西村 明,松永 哲郎,本橋ほづみ,赤池 孝章
神経型一酸化窒素合成酵素による一酸化窒素/活性酸素シグナルの調節機構
神经元一氧化氮合酶对一氧化氮/活性氧信号的调节机制
- DOI:
- 发表时间:
2011 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
(國枝 恒兵);笠松 真吾;井田 智章;徳弘 桃子;池田 善和;澤 智裕;赤池 孝章;居原 秀;宝田剛志;居原 秀 - 通讯作者:
居原 秀
Recent advance in reactive sulfur research
活性硫研究最新进展
- DOI:
10.14952/seikagaku.2019.910388 - 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
居原 秀;本橋 ほづみ;赤池 孝章 - 通讯作者:
赤池 孝章
居原 秀的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('居原 秀', 18)}}的其他基金
Development of a method for searching novel reactive sulfur species in foods
食品中新型活性硫物种的寻找方法的开发
- 批准号:
22K19159 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
相似海外基金
網羅的プロテオミクス技術を駆使した強化型腫瘍溶解性ヘルペスウイルスベクターの開発
利用综合蛋白质组学技术开发增强型溶瘤疱疹病毒载体
- 批准号:
24K18989 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
機能プロテオミクスによる早老症で生じる核機能不全の分子基盤の解明
使用功能蛋白质组学阐明早衰引起的核功能障碍的分子基础
- 批准号:
23K26796 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
高密度かつ機能的な定量プロテオミクスによる細胞老化の分子基盤の解明
利用高密度和功能定量蛋白质组学阐明细胞衰老的分子基础
- 批准号:
23K23870 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
先端プロテオミクス技術の開発による自然免疫シグナルの新規制御機構の解明
通过先进蛋白质组学技术的发展阐明先天免疫信号的新调节机制
- 批准号:
23K27171 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
定量プロテオミクスが紐解く新規タンパク質複合体によるHPV陽性癌の新たな病因論
基于定量蛋白质组学揭示的新型蛋白质复合物的 HPV 阳性癌症的新病因学
- 批准号:
23K24547 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
核タンパク質リン酸化プロテオミクスを用いた新規抗癌剤効果予測因子と治療標的の探索
利用核蛋白磷酸蛋白质组学寻找新的抗癌药物疗效预测因子和治疗靶点
- 批准号:
23K21375 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
プロテオミクスによる免疫チェックポイント阻害薬関連抗体同定とバイオマーカー確立
利用蛋白质组学鉴定免疫检查点抑制剂相关抗体并建立生物标志物
- 批准号:
24K19167 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
高深度プロテオミクスによる脳関門種差マップの構築とカンターパート分子の解明
利用深度蛋白质组学构建脑屏障物种差异图并阐明canterpart分子
- 批准号:
24K02195 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
次世代プロテオミクスとグルタミン代謝に着目した胸膜中皮腫に対する新規免疫代謝療法
专注于下一代蛋白质组学和谷氨酰胺代谢的胸膜间皮瘤新型免疫代谢疗法
- 批准号:
24K12023 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
細菌叢解析とプロテオミクスによる人工呼吸患者の気道分泌物増加メカニズムの解明
利用细菌菌群分析和蛋白质组学阐明机械通气患者气道分泌物增加的机制
- 批准号:
24K19499 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists