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新規ヌクレオソームイメージングを用いた生細胞におけるクロマチンの高次構造の解明

使用新型核小体成像阐明活细胞中染色质的高级结构

基本信息

批准号：
21H02453
负责人：
前島一博
金额：
$ 11.15万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

代表者らはヒト生細胞における200kb程度のクロマチンの集合体が、Hi-C解析をもとにしばしば描かれるクロマチン線維がループ状に束ねられたものではなく、ループを構成する線維がコンパクトな塊(ドメイン)を作っているという仮説を提唱している(Maeshima et al.,Curr.Opin. Cel l. Biol. 2020など)。塊であると転写因子などのタンパク質の局所濃度が増加し、反応の協同性や効率化など、新たな制御が可能となる。本課題では生細胞におけるクロマチンの構造情報を得るために、近接した2つのヌクレオソームを蛍光標識し、その2つの動きを超解像で可視化、追跡する新規システムを確立する。そして、その2つのヌクレオソームの動きの空間相関を解析することでこの仮説を検証する。令和4年度はコンパクトな塊のようなクロマチン集合体仮説の検証をおこなった。令和3年度で確立された手法を用いて、数千個の近接したヌクレオソームペアの動きのデータを蓄積した。統計解析により、どのくらい近接したペアが空間相関を示すか(または示さないか)を明らかにした。その結果、ヌクレオソームの距離が集合体サイズ程度(150 nm)以内で、両者の動きが高い空間相関 (相関係数0.6以上)を持つことが分かった。以上のことから、クロマチンの集合体はコンパクトな塊であることが明らかとなった。

The representative of the group is the 200kb long cluster of cells.(Maeshima et al.) Curr.Opin. Cel l. Biol. 2020など)。The quality of the product increases, the synergy of the product increases, and the control of the product increases. This topic aims to establish a new system for obtaining structural information about living cells, including optical identification, visualization and tracing. 2. Spatial correlation analysis of motion and motion of the system. In the fourth year of the order, the number of blocks and aggregates was increased. In the third year of this year, thousands of new technologies have been established, and thousands of new technologies have been developed. Statistical analysis: spatial correlation analysis The results show that the distance between the two groups is within 150 nm, and the spatial correlation between the two groups is high (correlation coefficient is more than 0.6). The aggregate of