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分裂期染色体の構造解析に基づくヒトゲノムの高次機能の解明

基于有丝分裂染色体的结构分析阐明人类基因组的高级功能

基本信息

批准号：
17770173
负责人：
前島一博
金额：
$ 2.3万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

研究代表者らは、これまで染色体の構造理解を目的として研究を進め、染色体凝縮に必須なTopoIIαとCondensinがいずれも染色体中に軸状に存在すること示した。さらに電子顕微鏡を用いた免疫金染色により、クロマチンがループ状に中心部から放射状にのびており、CondensinとTopoIIαがその根元付近に存在することを明らかにした。研究代表者らはこれらの研究にさらに進めて、透過電子顕微鏡tomographyをもちいた染色体の3次元再構築をおこない、クロマチンorganizationを解析している。TopoIIαは染色体凝縮に必須であり、Condensinとともに染色体軸を形成する。このため、TbpoIIαのヒトゲノム上の結合部位の同定はゲノム構造を知る上でも非常に重要である。またTopoIIαは阻害剤であるVP16を用いることにより、細胞中でゲノムDNA上に共有結合させることができる。このことを利用し、TbpoII阻害剤で処理した染色体DNAをそれぞれ調製し、TopoIIαが共有結合したDNA断片を抗TopoIIα抗体で精製した(Chromatin IP)。このDNA断片を用いて、東工大白髭グループと共同で、ヒトゲノムchip-on-chip解析をおこない、ヒトゲノム上でのTopoIIα結合領域のマッピングをおこなった。ヒトゲノムの約1%をカバーするENCODEチップをもちいた実験では、TbpoIIα結合領域がGpG islandやゲノム上の遺伝子密度と高い相関を持つことを見い出した。

The research representative pointed out that TopoIIα and Condensin were necessary for the structural understanding of chromosomes. The electron microscope was used for immunogold staining. The central part of the electron microscope was radial, and the condenser TopoIIα was close to the root element. The research representatives are engaged in the study of chromosome reconstruction through electron microscopy and analysis of chromosome organization. TopoIIα chromosome condensation must be formed by condensation. It is very important to know the structure of the binding site on the TbpoIIα. TopoIIα is the inhibitor of VP16. It is commonly associated with DNA in cells. The use of TbpoII inhibitors in the treatment of chromosomal DNA fragments, TopoII alpha consensus binding, and anti-TopoII alpha antibody purification (Chromatin IP) The DNA fragments were analyzed by the TopoIIα binding domain. The DNA fragments were analyzed by the TopoIIα binding domain. About 1% of the total number of people in the world who are interested in this topic is ENCODE, TbpoII, and GpG island.