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Testing the flexibility of dosage compensation by mimicking the initial and turn-over stages of sex chromosomes

通过模拟性染色体的初始阶段和更新阶段来测试剂量补偿的灵活性

基本信息

批准号：
21H02539
负责人：
野澤昌文
金额：
$ 11.07万
依托单位：
Tokyo Metropolitan University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

1. ネオX染色体における即時遺伝子量補償の検証今年度は、昨年度末に行った、鉄イオン2Gyを照射したミランダショウジョウバエ（D. miranda）のオスの繁殖力及びゲノム配列、トランスクリプトーム配列の決定を行った。その結果，照射オスでは繁殖力の低下が見られた。しかし、ゲノム中に大きな欠失は生じていなかった。また、ネオY染色体上のシングルコピー遺伝子には欠失が有意に入りにくいことが分かった。この結果は、ネオX染色体上の遺伝子に即時遺伝子量補償は作用せず、ネオY染色体のシングルコピー遺伝子を消失した個体に有害であった可能性を示唆する。より大きな欠失を得るため、アルゴンイオン50Gyを照射し、解析を進めている。2. 性染色体から常染色体への転換時における遺伝子量補償昨年度に得た、ネオX染色体を持つD. mirandaとその近縁種でネオX染色体に相同な常染色体を持つウスグロショウジョウバエ（D. pseudoobscura）の雑種のRNA-seqデータの解析を進めた。その結果、雑種では不和合によると思われる異常な遺伝子発現パターンが観察されたが、遺伝子クラスタリングによって不和合の影響を受けづらい遺伝子群を抽出したところ、ネオX染色体の遺伝子発現量は有意に低下していた。現在，雑種不和合の影響をより完全に排除してX染色体の常染色体転換を模倣するため、CRISPR-Cas9法を用いてX染色体を2本持つオスの作成を試みている。

1. A study on the compensation of the X chromosome in situ was carried out at the end of this year and last year. miranda) and the reproduction of the species and the determination of the species arrangement. As a result, the fertility of the irradiated plants was reduced. In the middle of the night, the sun rises and the moon rises. The Y chromosome has a number of genes that are missing from the genome. The results indicate the likelihood that the gene on the X chromosome will disappear and that the gene quantity compensation will act on the Y chromosome. 50Gy irradiation, analysis and improvement 2. Sex chromosome change, autosome change, chromosome number change, autosome change, autosome change, autosome Miranda and its relatives have the same autosome as X chromosome. The RNA-seq analysis of pseudoobscura) was carried out. As a result, the amount of abnormal gene expression was detected and the amount of gene expression of X chromosome was intentionally reduced due to the influence of gene expression. Now, the effect of non-alignment is completely excluded, and the CRISPR-Cas9 method is used to try to create the autosomal substitution of X chromosome.