whole genome and multiomics analysis of hairy cell leukemia japansese variant

毛细胞白血病日本变异的全基因组和多组学分析

• 批准号: 21H02711
• 负责人: 横山 和明
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02711/
• 关键词: 有毛細胞白血病; 全ゲノム; マルチオミクス; 全ゲノム解析; オミクス解析

希少成熟B細胞腫瘍である、有毛細胞白血病(HCL) には欧米型亜型と、それとは異なる臨床的特徴を持つ、本邦固有の日本型亜型(HCLjv)が存在する。本研究では、HCLjvに対して、申請者らが全ゲノム解析にて発見した病態関連遺伝子変異候補X-Zと標的薬候補について検討し、分子病態や標的治療を開発する事を目的としている。本年度は、1)HCLjvにおけるマルチオミクス情報基盤の構築、において木村がCLLRSG研究と共同で、石井が自施設から、2021年に引き続き、HCLjv+HCLc(n=10)の末梢血腫瘍検体を収集した。これを元に横山が wgs解析を行い、HCLjvにおいてX-Zの３遺伝子が高頻度に認められる事を確認した。2)in vitro機能解析によるHCLjvの分子病態解明では、木村らがドライバー変異を再現したモデル細胞株1line を選定した。当該細胞株を用いて、WBを用いた、ドライバー変異Xの下流のシグナル伝達経路の検討を行い、NFkb経路、Akt経路の活性化を確認した。3)in vivo機能解析　2021年は木村が、患者細胞を免疫不全マウスに移植し、PDX樹立を複数回試みたものの細胞生着が得られなかった。そこで2022年度は、上記細胞株を免疫不全マウスに移植した系の確立を試み、系の確立をなし得た。また、これに横山が並行して、X、Yを再現したコンディショナルノックインマウスの作成する事を試みたが、1 line目は、loxp配列の挿入部位の問題により、予期せずXのloss of functionのphenotypeによる生育不全となってしまった。 2023年はこの組み換えの挿入配列の挿入部位を改良することでX、Yを再現したコンディショナルノックインマウスの樹立を試みる予定である。

Few mature B cells swollen sores で あ る, hairy cell leukemia (HCL) に は omega 亜 と, そ れ と は different な る 徴 of clinical を hold つ, inherent の state Japan 亜 (HCLjv) が す る. This study で は, HCLjv に し seaborne て, applicants ら が full ゲ ノ ム parsing に て 発 see し た pathological masato even heritage 伝 sub - different alternate X Z と mark 薬 alternate に つ い て beg し 検, molecular pathological や mark treatment を 発 す る matter を purpose と し て い る. は, this year 1) HCLjv に お け る マ ル チ オ ミ ク ス intelligence base plate の construct, に お い て kimura が CLLRSG research と で, ishii が since facilities か ら, 2021 に き 続 き, HCLjv + HCLc (n = 10) の endings hematoma sores 検 body を 収 set し た. こ れ を yuan に hengshan が WGS parsing を い, HCLjv に お い て の 3 X - Z heritage 伝 son が high frequency に recognize め ら れ る を sure し た. 2) in vitro functional analytic に よ る HCLjv の molecular pathological interpret で は, kimura ら が ド ラ イ バ ー - different を reappearance し た モ デ ル cell line 1 line を selected し た. When the cells を い て, WB を い た, ド ラ イ バ ー - different X の obscene の シ グ ナ ル 伝 da の 経 road beg を 検 い, NFkb 経 road, Akt 経 road の activeness を confirm し た. 3) in vivo function resolution 2021 は が kimura, incomplete を immune cells in patients with マ ウ ス し に transplantation and symbol set を plural back to try み た も の の cells born with が ら れ な か っ た. そ こ で は, written in 2022 cell lines を immune insufficiency マ ウ ス に transplantation し た の established を try み, is の establish を な し た. ま た, こ れ に hengshan が parallel し て, X, Y, を reappearance し た コ ン デ ィ シ ョ ナ ル ノ ッ ク イ ン マ ウ ス の made す る matter を try み た が, 1 line item は, loxp match column の scions into parts の problem に よ り, to period せ ず X の loss of function <s:1> phenotypeによる incomplete fertility となって まった まった. 2023 は こ み の group in え の scions into the match column の scions into parts modified す を る こ と で X, Y を reappearance し た コ ン デ ィ シ ョ ナ ル ノ ッ ク イ ン マ ウ ス の set を try み る designated で あ る.

项目成果

Unraveling heterogeneity of aged hematopoietic stem cells by single-cell RNA sequence analysis

通过单细胞 RNA 序列分析揭示衰老造血干细胞的异质性

• 发表时间: 2021
• 作者: 宮城拓也;下地志月;高橋健造;Shuhei Koide
• 通讯作者: Shuhei Koide

令和３年度厚生労働省委託事業がんの全ゲノム解析に関する人材育成推進事業 テキスト4章

2021年度厚生劳动省委托项目癌症全基因组分析人力资源开发推进事业正文第4章

• 发表时间: 2021
• 作者: 合田 光寛;相澤 風花;八木 健太;新村 貴博;櫻田 巧;小川 敦;石澤 有紀;座間味 義人;石澤 啓介;横山和明 清水英悟
• 通讯作者: 横山和明 清水英悟

Explainable AI for Estimating Pathogenicity of Genetic Variants Using Large-Scale Knowledge Graphs.

• DOI: 10.3390/cancers15041118
• 发表时间: 2023-02-09
• 期刊: Cancers
• 影响因子: 5.2

Anti-inflammatory effects of ruxolitinib on chronic neutrophilic leukemia harboring CSF3R-T618I mutation with bilateral renal abscesses.

• DOI: 10.1016/j.lrr.2022.100348
• 发表时间: 2022
• 期刊: LEUKEMIA RESEARCH REPORTS
• 作者: Sahara, Naohi;Yokoyama, Kazuaki;Matsunaga, Takashi;Kitahara, Shinsuke;Fujii, Tomoki;Kobayashi, Seiichiro;Yusa, Nozomi;Shimizu, Eigo;Imoto, Seiya;Tojo, Arinobu;Ohno, Nobuhiro
• 通讯作者: Ohno, Nobuhiro

Myeloid/Natural Killer (NK) Cell Precursor Acute Leukemia As a Novel Distinctive Leukemia Entity

骨髓/自然杀伤 (NK) 细胞前体急性白血病作为一种新的独特白血病实体

• 发表时间: 2021
• 作者: Akira Nishimura;Kazuaki Yokoyama; Masatoshi Takagi et al.
• 通讯作者: Masatoshi Takagi et al.