whole genome and multiomics analysis of hairy cell leukemia japansese variant

毛细胞白血病日本变异的全基因组和多组学分析

基本信息

  • 批准号:
    21H02711
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 11.15万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

希少成熟B細胞腫瘍である、有毛細胞白血病(HCL) には欧米型亜型と、それとは異なる臨床的特徴を持つ、本邦固有の日本型亜型(HCLjv)が存在する。本研究では、HCLjvに対して、申請者らが全ゲノム解析にて発見した病態関連遺伝子変異候補X-Zと標的薬候補について検討し、分子病態や標的治療を開発する事を目的としている。本年度は、1)HCLjvにおけるマルチオミクス情報基盤の構築、において木村がCLLRSG研究と共同で、石井が自施設から、2021年に引き続き、HCLjv+HCLc(n=10)の末梢血腫瘍検体を収集した。これを元に横山が wgs解析を行い、HCLjvにおいてX-Zの3遺伝子が高頻度に認められる事を確認した。2)in vitro機能解析によるHCLjvの分子病態解明では、木村らがドライバー変異を再現したモデル細胞株1line を選定した。当該細胞株を用いて、WBを用いた、ドライバー変異Xの下流のシグナル伝達経路の検討を行い、NFkb経路、Akt経路の活性化を確認した。3)in vivo機能解析 2021年は木村が、患者細胞を免疫不全マウスに移植し、PDX樹立を複数回試みたものの細胞生着が得られなかった。そこで2022年度は、上記細胞株を免疫不全マウスに移植した系の確立を試み、系の確立をなし得た。また、これに横山が並行して、X、Yを再現したコンディショナルノックインマウスの作成する事を試みたが、1 line目は、loxp配列の挿入部位の問題により、予期せずXのloss of functionのphenotypeによる生育不全となってしまった。 2023年はこの組み換えの挿入配列の挿入部位を改良することでX、Yを再現したコンディショナルノックインマウスの樹立を試みる予定である。
Few mature B cells swollen sores で あ る, hairy cell leukemia (HCL) に は omega 亜 と, そ れ と は different な る 徴 of clinical を hold つ, inherent の state Japan 亜 (HCLjv) が す る. This study で は, HCLjv に し seaborne て, applicants ら が full ゲ ノ ム parsing に て 発 see し た pathological masato even heritage 伝 sub - different alternate X Z と mark 薬 alternate に つ い て beg し 検, molecular pathological や mark treatment を 発 す る matter を purpose と し て い る. は, this year 1) HCLjv に お け る マ ル チ オ ミ ク ス intelligence base plate の construct, に お い て kimura が CLLRSG research と で, ishii が since facilities か ら, 2021 に き 続 き, HCLjv + HCLc (n = 10) の endings hematoma sores 検 body を 収 set し た. こ れ を yuan に hengshan が WGS parsing を い, HCLjv に お い て の 3 X - Z heritage 伝 son が high frequency に recognize め ら れ る を sure し た. 2) in vitro functional analytic に よ る HCLjv の molecular pathological interpret で は, kimura ら が ド ラ イ バ ー - different を reappearance し た モ デ ル cell line 1 line を selected し た. When the cells を い て, WB を い た, ド ラ イ バ ー - different X の obscene の シ グ ナ ル 伝 da の 経 road beg を 検 い, NFkb 経 road, Akt 経 road の activeness を confirm し た. 3) in vivo function resolution 2021 は が kimura, incomplete を immune cells in patients with マ ウ ス し に transplantation and symbol set を plural back to try み た も の の cells born with が ら れ な か っ た. そ こ で は, written in 2022 cell lines を immune insufficiency マ ウ ス に transplantation し た の established を try み, is の establish を な し た. ま た, こ れ に hengshan が parallel し て, X, Y, を reappearance し た コ ン デ ィ シ ョ ナ ル ノ ッ ク イ ン マ ウ ス の made す る matter を try み た が, 1 line item は, loxp match column の scions into parts の problem に よ り, to period せ ず X の loss of function <s:1> phenotypeによる incomplete fertility となって まった まった. 2023 は こ み の group in え の scions into the match column の scions into parts modified す を る こ と で X, Y を reappearance し た コ ン デ ィ シ ョ ナ ル ノ ッ ク イ ン マ ウ ス の set を try み る designated で あ る.

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Unraveling heterogeneity of aged hematopoietic stem cells by single-cell RNA sequence analysis
通过单细胞 RNA 序列分析揭示衰老造血干细胞的异质性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    宮城拓也;下地志月;高橋健造;Shuhei Koide
  • 通讯作者:
    Shuhei Koide
令和3年度厚生労働省委託事業がんの全ゲノム解析に関する人材育成推進事業 テキスト4章
2021年度厚生劳动省委托项目癌症全基因组分析人力资源开发推进事业正文第4章
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    合田 光寛;相澤 風花;八木 健太;新村 貴博;櫻田 巧;小川 敦;石澤 有紀;座間味 義人;石澤 啓介;横山和明 清水英悟
  • 通讯作者:
    横山和明 清水英悟
Explainable AI for Estimating Pathogenicity of Genetic Variants Using Large-Scale Knowledge Graphs.
  • DOI:
    10.3390/cancers15041118
  • 发表时间:
    2023-02-09
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
  • 通讯作者:
Anti-inflammatory effects of ruxolitinib on chronic neutrophilic leukemia harboring CSF3R-T618I mutation with bilateral renal abscesses.
  • DOI:
    10.1016/j.lrr.2022.100348
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Sahara, Naohi;Yokoyama, Kazuaki;Matsunaga, Takashi;Kitahara, Shinsuke;Fujii, Tomoki;Kobayashi, Seiichiro;Yusa, Nozomi;Shimizu, Eigo;Imoto, Seiya;Tojo, Arinobu;Ohno, Nobuhiro
  • 通讯作者:
    Ohno, Nobuhiro
Myeloid/Natural Killer (NK) Cell Precursor Acute Leukemia As a Novel Distinctive Leukemia Entity
骨髓/自然杀伤 (NK) 细胞前体急性白血病作为一种新的独特白血病实体
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Akira Nishimura;Kazuaki Yokoyama; Masatoshi Takagi et al.
  • 通讯作者:
    Masatoshi Takagi et al.
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Identification of miRNA targeting Evi1
鉴定靶向 Evi1 的 miRNA
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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    0
  • 作者:
    山本 春菜;横山 和明;呂 軍;大庭 成喜;川俣 豊隆;吉見 昭秀;森下 和広;黒川 峰夫;幸谷 愛
  • 通讯作者:
    幸谷 愛
ABCD1ノックアウト細胞における極長鎖脂肪酸CoAの定量
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    藤原 優子;濱 弘太郎;横山 和明
  • 通讯作者:
    横山 和明
臨床シークエンスにて確定診断に至った慢性好中球性白血病の2例
临床测序证实两例慢性中性粒细胞白血病
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小川 弥穂;横山 和明;塚田 信弘;余語 孝夫3;近藤 幹也;武井 智美;中村 聡介;伊藤 美香;小林 麻子;遊佐 希;山本 茉子;笠島 理加;清水 英悟;山口 類;井元 清哉;宮野 悟;東條 有伸
  • 通讯作者:
    東條 有伸
シングルセルトランスクリプトーム解析の現状と、それに基づく肺線維症治療標的候補分子探索
单细胞转录组分析现状及基于其寻找肺纤维化治疗候选分子
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小川 弥穂;横山 和明;塚田 信弘;余語 孝夫3;近藤 幹也;武井 智美;中村 聡介;伊藤 美香;小林 麻子;遊佐 希;山本 茉子;笠島 理加;清水 英悟;山口 類;井元 清哉;宮野 悟;東條 有伸;七野 成之
  • 通讯作者:
    七野 成之
当院における標準治療不応進行がん患者を対象としたクリニカルシーケンスの検討
我院标准治疗难治性晚期癌症患者临床序列检查
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    土方 康基;横山 和明;山口 貴世志;池上 恒雄;山口 類;井元 清哉;内丸 薫;宮野 悟;四柳 宏;東條 有伸;古川 洋一
  • 通讯作者:
    古川 洋一

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通过对大脑肾上腺脑白质营养不良特有的鞘糖脂的代谢和功能分析来阐明病理生理学
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    $ 11.15万
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    2024
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小笠原固有樹木種の全ゲノム比較による適応遺伝子の探索と進化メカニズムの解明
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    $ 11.15万
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パンゲノムによる遺伝性難病・希少疾患のための全ゲノム構造多様性解析の実現
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    2024
  • 资助金额:
    $ 11.15万
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肺腺癌の発生進展に対する全ゲノム重複(WGD: Whole Genome Doubling)の関与
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    2024
  • 资助金额:
    $ 11.15万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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全球变暖后雪松林业还能生存吗?
  • 批准号:
    24H00527
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 11.15万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
遺伝性網膜疾患患者の全ゲノム解析で同定したスプライス変異と構造変異の機能評価
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    24K12796
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 11.15万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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