Investigation of molecular mechanisms for constitutive IRF4 expression in T-cell malignancies

T细胞恶性肿瘤中IRF4组成型表达的分子机制研究

• 批准号: 21H02775
• 负责人: 中川 雅夫
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02775/
• 关键词: 成人T細胞性白血病リンパ腫; CRIPSR; T細胞性リンパ腫; ATLL; IRF4; T細胞性腫瘍; CRISPR

目的１）成人T細胞性白血病リンパ腫におけるIRF4の恒常的高発現が維持される分子メカニズムの解明とその制御方法の開発化合物ライブラリーによるIRF4蛋白発現スクリーニング: IRF4発現変化の検出系として、フローサイトメーターを用いたHigh throughput screening (HTS)の系を確立、北大化合物ライブラリー（約3000個の既存薬を搭載）の中から、成人T細胞性白血病リンパ腫患者由来細胞株のIRF4発現低下をもたらす候補化合物を同定した。検証実験を行い、いくつかの化合物ににおいて確認が得られた。機能的エンハンサー解析:成人T細胞性白血病リンパ腫細胞株と臨床検体のATACseqデータを解析した。IRF4遺伝子座周辺のopen chromatin領域を解析したところ症例間に共通する領域は見出されなかった。このことは、特定の機能的エンハンサー領域は存在せず、IRF4発現のメカニズムは症例間でheterogeneityが存在することを明らかにした。目的２）T細胞性腫瘍全体におけるIRF4恒常的発現異常の分布と頻度組織マイクロアレイ作成：北日本血液研究会(http://www.njhsg.com)と連携し、T細胞性腫瘍の組織マイクロアレイを作成した。IRF4および、その関連遺伝子であるBATF3の免疫組織染色を行ったところ、成人T細胞性白血病リンパ腫に置いては他のT細胞性腫瘍病型と比較して陽性頻度が高いことを見出した。目的３）IRF4発現制御の疲弊CAR-T細胞への応用IRF4発現を低下させる化合物は細胞障害性が強く、CCR4-CAR-T細胞の細胞疲弊を抑制するには不向きと考えられた。この対応として、IRF4の機能を抑制する分子をCARと同時にT細胞に導入する方針とし、実験を進めた。

Objective 1) To maintain the constant high level of IRF4 protein expression in adult T-cell leukemia and to develop new compounds for the treatment of T-cell leukemia: IRF4 detection system was established and candidate compounds were identified for IRF4 detection in adult T cell leukemia patient-derived cell lines. The test was conducted in the middle of the test, and the compound was confirmed to have been obtained. Functional analysis: adult T cell leukemia cell lines and clinical models of ATACseq analysis IRF4 open chromatin domain analysis This is the first time that a specific function exists in the domain of IRF4, and the heterogeneity exists in the domain of IRF4. Objective 2) The distribution and frequency of abnormal appearance of IRF4 in T cell tumors were organized by North Japan Blood Research Association (www.njhsg.com). IRF-4 and BATF-3 were detected by immunohistochemical staining. The positive rate of adult T cell leukemia was higher than that of other T cell leukemia. Objective 3) To investigate the effect of IRF4 on the inhibition of cell exhaustion of CCR4-CAR-T cells. The function of IRF4 is inhibited by CAR.

项目成果

北海道大学大学院医学研究院 血液内科学教室 リンパ系腫瘍グループ

北海道大学医学研究科血液科淋巴肿瘤组

血液内科 第84巻第3号 未分化大細胞リンパ腫の病態と治療の考え方

血液学第84卷第3期间变性大细胞淋巴瘤的病理学和治疗理念

• 发表时间: 2021
• 作者: 長山 聡;岡本 拓也;八尾 良司;中川 雅夫
• 通讯作者: 中川 雅夫

Gilteritinib enhances graft-versus-leukemia effects against FLT3-ITD mutant leukemia after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation

• DOI: 10.1038/s41409-022-01619-4
• 发表时间: 2022-02-28
• 期刊: BONE MARROW TRANSPLANTATION
• 影响因子: 4.8
• 作者: Zhang, Zixuan;Hasegawa, Yuta;Teshima, Takanori
• 通讯作者: Teshima, Takanori

Genome-wide CRISPR screens identify CD48 defining susceptibility to NK cytotoxicity in peripheral T-cell lymphomas.

• DOI: 10.1182/blood.2022015646
• 发表时间: 2022-11-03
• 期刊: BLOOD
• 影响因子: 20.3
• 作者: Chiba, Masahiro;Shimono, Joji;Ishio, Takashi;Takei, Norio;Kasahara, Kohei;Ogasawara, Reiki;Ara, Takahide;Goto, Hideki;Izumiyama, Koh;Otsuguro, Satoko;Perera, Liyanage P.;Hasegawa, Hiroo;Maeda, Michiyuki;Hashino, Satoshi;Maenaka, Katsumi;Teshima, Takanori;Waldmann, Thomas A.;Yang, Yibin;Nakagawa, Masao
• 通讯作者: Nakagawa, Masao

Whole-genome CRISPR library screens identify CD48 as an essential molecule in adult T-cell leukemia/lymphoma for defining susceptibility to natural killer cell-mediated cytotoxicity

全基因组 CRISPR 文库筛选将 CD48 鉴定为成人 T 细胞白血病/淋巴瘤的重要分子，用于确定对自然杀伤细胞介导的细胞毒性的易感性

• 发表时间: 2021
• 作者: Masahiro Chiba;Joji Shimono;Takashi Ishio;Hideki Goto;Satoshi Hashino;Takanori Teshima;Masao Nakagawa
• 通讯作者: Masao Nakagawa