Comprehensive understanding of the enhancer cluster regulating the expression of Indian hedgehog in the skeletal system
Comprehensive understanding of the enhancer cluster regulating the expression of Indian hedgehog in the skeletal system
批准号:
21H03142
负责人:
大庭 伸介
金额:
$10.98万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2021-04-01 至 2025-03-31
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前年度までに取得した、Ihh遺伝子の上流およそ80 kbにわたって存在する5つのエンハンサー候補領域(エンハンサーA~E)について生理的・病的状態におけるエンハンサー活性の検証を行った。(1)各エンハンサーによってルシフェラーゼ遺伝子の発現が誘導されるレポーターコンストラクトを作製し、マウス初代軟骨細胞やマウス・ヒト軟骨系細胞株(ATDC5、SW1353)に導入してレポーター発現を指標にエンハンサー活性を検討した。その結果、複数の領域についてエンハンサー活性を確認した。いくつかの領域については、タンデムコンストラクトにおいてコピー数依存性に活性の上昇を認めた。(2)各エンハンサーによってlacZ遺伝子の発現が誘導されるレポーターを導入したトランスジェニックマウスを作出した。X-gal染色によってレポーター発現を検出し、エンハンサー活性とその組織特異性を検討した。その結果、エンハンサーAおよびCで骨組織特異的な活性を認めた。エンハンサーAは骨発生過程の中期より活性を示し、長管骨におけるその活性化領域はIhh mRNA発現領域とほぼ一致していた。一方、エンハンサーCは骨発生過程の初期に活性を示した。エンハンサーAとエンハンサーCについてはレポータートランスジェニックマウスをライン化し、次項の解析に用いた。(3)エンハンサーAを中心に、レポータートランスジェニックマウスの病態モデルにおける活性を検討した。その結果、エンハンサーAのレポータートランスジェニックマウスを用いて変形性膝関節症モデルを作製すると、軟骨組織の変性に一致してエンハンサー活性を認めることが明らかとなった。その他の病態モデル、およびエンハンサーCのレポータートランスジェニックマウスについては検討が進行中である。
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Elucidating gene regulatory meshanisms underlying human skeletal development using human plurioitent stem cell-derived bone tissues and single-cell multiome analysis.
利用人类多能干细胞衍生的骨组织和单细胞多组分析阐明人类骨骼发育的基因调控机制。
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tani S, Okada H, Seki M, Suzuki Y, Saito T, Tanaka S, Chung UI, Hojo H, Ohba S]
通讯作者:
Ohba S
1細胞多層解析を用いたヒト骨発生における遺伝子制御ネットワークの解明.
使用单细胞多层分析阐明人类骨骼发育中的基因调控网络。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[谷彰一郎, 岡田寛之, 齋藤琢, 田中栄, 鄭雄一, 北條宏徳, 大庭伸介]
通讯作者:
大庭伸介
Elucidating Gene Regulatory Networks Underlying Human Skeletal Development by Integrating a Model of Human Endochondral Bones and Single-cell Multiomics
通过整合人类软骨内骨模型和单细胞多组学来阐明人类骨骼发育背后的基因调控网络
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shoichiro Tani, Hiroyuki Okada, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Taku Saito, Sakae Tanaka, Ung-il Chung, Hironori Hojo and Shinsuke Ohba]
通讯作者:
Hironori Hojo and Shinsuke Ohba
Elucidating gene regulatory meshanisms underlying human skeletal development by integrating single-cell dynamics of chromatin accessibility and gene expression.
通过整合染色质可及性和基因表达的单细胞动力学,阐明人类骨骼发育的基因调控机制。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tani S, Okada H, Seki M, Suzuki Y, Saito T, Tanaka S, Chung UI, Hojo H, Ohba S]
通讯作者:
Ohba S
南カリフォルニア大学/コネチカット大学(米国)
南加州大学/康涅狄格大学(美国)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 14 条
骨格系のインディアンヘッジホッグ発現を司るエンハンサークラスターの包括的理解
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批准号:23K21494
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2024
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负责人:大庭 伸介
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依托单位:
ヘッジホッグシグナルによる骨格系細胞運命決定におけるエピゲノム・転写ダイナミクス(国際共同研究強化)
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批准号:15KK0335
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项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research)
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资助金额:$9.32万
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财政年份:2015
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负责人:大庭 伸介
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依托单位:
海外基金