シン・パレオゲノミクスが創る博物館資料群活用の新展開

薄古基因组学博物馆资料使用的新进展

基本信息

  • 批准号:
    21H04358
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 27.04万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-05 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本年度は、昨年度に引き続き、人骨、植物病理標本、菌類標本、絶滅動物、堆積物の寄生虫卵をターゲットにして。それぞれ人骨班、植物標本班、絶滅動物班、堆積物班に分かれて、局所サンプリングの条件検討を進めた。昨年度に、富山県富山市の小竹貝塚出土人骨から局所サンプリングを実施し、12個体中で8個体でゲノム解析が可能な保存状態の良いDNA抽出液を得ており、Nova-seqを用いて追加でゲノムデータの取得を進めた。解析結果から、全ての個体で縄文人特異的なゲノムの特徴を有することが確認された。DNA抽出液のヒトDNA含有率が低い4個体は、arbor bioscience社が提供するRNAプローブのMYbaitsを用いたヒトDNA濃縮法を適用して、保存状態の悪い試料からのゲノムデータの取得を試みた。また、ニホンカワウソのサンプリングでは、肉球およびヒゲの付け根の組織からサンプリングを実施し、人骨同様に保存状態の良いDNA抽出液を得たため、民間のシーケンシング企業にライブラリを送り、大規模ゲノムデータの取得を進めた。菌類標本の分析対象であるスエヒロタケ標本からDNA抽出を行った結果、非常に長いDNAが抽出されたため、既存の低分子をターゲットとしたパレオゲノミクスの研究領域で応用されているライブラリ作成ではライブラリ化が困難であることがわかった。寄生虫卵の分析では、低分子DNAから選択的に全ゲノム増幅するための実験系の検討を進めた。
This year's annual report on human bones, plant pathology, fungi, extinct animals, parasites and eggs must be submitted. The conditions for human bone, plant, extinct animal and accumulation are discussed. Last year, human bones unearthed in Kotakesuka, Toyama Prefecture, were collected from 8 out of 12 individuals and analyzed. DNA extracts from 8 individuals were obtained in good condition. Nova-seq was added to the collection. The analysis results show that the characteristics of all individuals are unique to each other. DNA extract DNA content is low 4 individuals, arbor bioscience company provides RNA extract MYbaits, DNA concentration method is applicable, preservation state of sample is low 5 individuals, arbor bioscience company provides RNA extract MYbaits, DNA concentration method is applicable, preservation state of sample is low 5 individuals, arbor bioscience company provides RNA extract MYbaits, DNA concentration method is applicable. In addition, the excellent support for the organization of meatballs and nuts has been implemented, and good DNA extracts in the same preserved state as human bones have been obtained. Private companies have been able to provide rapid delivery of information, and the acquisition of large-scale virtual data has been advanced. Fungal DNA extraction results, very long DNA extraction, existing low molecular weight DNA extraction results, very high molecular weight DNA extraction results, very high molecular weight DNA extraction results. The analysis of parasite eggs and low molecular weight DNA was carried out in order to improve the quality of the parasite system.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

覚張 隆史其他文献

Trial application of oxygen, carbon and strontium isotope analysis in tooth enamel for identification of past-war victims for discriminating between Papuan, Japanese and US soldiers.
试用牙釉质中的氧、碳和锶同位素分析来识别过去战争受害者,以区分巴布亚、日本和美国士兵。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    染田 英利;覚張 隆史;申 基澈;陀安一郎;斎藤めぐみ;小林靖;米田 穣;石田肇
  • 通讯作者:
    石田肇
Spatiotemporal brain transcriptome architecture in the common marmoset
普通狨猴的时空脑转录组结构
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    染田 英利;覚張 隆史;申 基澈;陀安一郎;Yasuhiro Go
  • 通讯作者:
    Yasuhiro Go
歯の人類学分科会 平成26年度シンポジウム「歯の付着物をめぐって」
牙科人类学小组委员会2014年研讨会“关于牙齿沉积物”
  • DOI:
    10.1537/asj.123.51
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    金澤 英作;小山田 常一;北川 賀一;真鍋 義孝;矢野 航;HENRY Amanda G.;今井 啓雄;江㞍 貞一;山崎 京美;高橋 正志;遠藤 秀紀;米田 穣;覚張 隆史;金子 浩昌
  • 通讯作者:
    金子 浩昌
縄文時代前期末葉の沼沢火山噴火と縄文社会への影響
绳文时代末期沼泽火山喷发及其对绳文社会的影响
人体硬組織の同位体比分析による出身国・地域の新規推定法についての検討-第3報 フィリピンにおける戦没者遺骨鑑定への応用-
基于人体硬组织同位素比值分析的原产国/地区新方法研究-第3部分在菲律宾战死者遗骸鉴定中的应用-
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    染田 英利;覚張 隆史;申 基澈;陀安一郎
  • 通讯作者:
    陀安一郎

覚張 隆史的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('覚張 隆史', 18)}}的其他基金

新たな生物考古学的手法による遺跡出土動物遺存体の生活史復元 文理融合解釈への試み
用生物考古新方法重建废墟出土动物遗骸的生活史:人文与科学融合解读的尝试
  • 批准号:
    13J06545
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
新たな動物考古学的手法による古墳時代および古代における馬の飼育形態の復元
利用新的动物考古学方法重建古坟时代和古代的马业
  • 批准号:
    11J06295
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似海外基金

間質細胞のシングルセル解析による血管免疫芽球性T細胞リンパ腫の病態解明
通过基质细胞的单细胞分析阐明血管免疫母细胞 T 细胞淋巴瘤的病理学
  • 批准号:
    24KJ0514
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
モデル細胞株のシングルセル解析による骨髄異形成症候群の急性白血病化機構の解明
通过模型细胞系的单细胞分析阐明骨髓增生异常综合征中急性白血病的机制
  • 批准号:
    24K10544
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
シングルセル解析に基づく糖尿病性腎臓病の機構解明とヒトへの応用
基于单细胞分析阐明糖尿病肾病的机制及其在人类中的应用
  • 批准号:
    24K19132
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
多階層シングルセル解析を応用した骨再生機構の解明と新規再生療法の基盤構築
利用多级单细胞分析阐明骨再生机制并为新的再生疗法奠定基础
  • 批准号:
    23K21487
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
メルケル細胞癌における空間的シングルセル解析による免疫療法至適微小環境の解明
通过空间单细胞分析阐明默克尔细胞癌免疫治疗的最佳微环境
  • 批准号:
    24K11502
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
シングルセル解析によるケロイド原因細胞の発見と新規治療法の開発
通过单细胞分析发现疤痕疙瘩致病细胞并开发新的治疗方法
  • 批准号:
    23K27757
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
高解像度シングルセル解析技術により明らかにする線維症肺上皮の細胞運命転換機構
高分辨率单细胞分析技术揭示纤维化肺上皮细胞命运变化机制
  • 批准号:
    24K02458
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
体細胞モザイクである線維性骨異形成症のシングルセル解析による病態解明と創薬展開
通过纤维性骨发育不良(一种体细胞嵌合体)的单细胞分析阐明病理学和药物发现的发展
  • 批准号:
    24K02613
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
水疱性類天疱瘡におけるシングルセル解析を用いた抗原特異的B細胞の解析
使用单细胞分析法分析大疱性类天疱疮中的抗原特异性 B 细胞
  • 批准号:
    24K19158
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
窒素固定由来の窒素はどこへいくのか? - シングルセル解析を用いたネットワークの解明
固氮过程中的氮去了哪里? - 使用单细胞分析阐明网络
  • 批准号:
    23K26994
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 27.04万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了