Elucidating molecular network of Dravet syndrome by genetic approaches

通过遗传学方法阐明 Dravet 综合征的分子网络

• 批准号: 19K17381
• 负责人: 石井 敦士
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Fukuoka International University of Health and Welfare (2022)International University of Health and Welfare (2021)Fukuoka University (2019-2020)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K17381/
• 关键词: てんかん; ドラべ症候群; バリアント; ネットワーク; 遺伝子; 次世代シークエンサー; ドラベ症候群; エクソーム解析; 遺伝子解析; 発達性てんかん性脳症

ドラベ症候群の分子ネットワークを明らかにすることを目的に、500症例の発達性てんかん性脳症症例を解析した。抹消リンパ球より抽出されたゲノムDNAを用いて、てんかん関連の114遺伝子のエクソンを含む領域にプローブを設計しライブラリを作成した。次世代シークエンサーMiseq（イルミナ社）でシークエンスを行い、fastq fileを参照ゲノム配列hg19を使用してバリアントを抽出したvcf fileを作成した。AnnotationはANNOVARを使用し、1000 genome, ExAC, gnomADデータベースで新規バリアントを抽出し、SIFT、 PolyPhen2、CADDスコアで有害性が予測されるバリアントを候補とした。候補バリアントに対して、両親のゲノムDNAでバリアントの有無をPCRサンガー法で確認し、新生バリアントを病的バリアントとした。Na+、K+、Cl-チャネル、GABAA受容体等のイオンチャネル、イオンチャネル内蔵をコードする遺伝子を対象とした。ドラべ症候群337症例、その他の発達性てんかん性脳症163症例の合計500症例で病的バリアントを探索し、121症例（ドラべ症候群95症例、発達性てんかん性脳症26症例）に病的バリアントを同定した。トップ5の遺伝子は、SCN1Aに85症例、SCN8Aに7症例、KCNT1に5症例、KCNQ2に4症例、GABRB2に3症例であった。チャネル種類に分類すると。Na＋チャネルに93症例、K+チャネルに12症例、GABAA受容体に7症例であった。Na＋チャネルが最も多いが、K＋チャネル、GABAA受容体と抑制性のチャネルが続き、抑制性チャネルのバリアントの関与も示唆された。

The molecular markers of the syndrome, the molecular markers, the molecules, the molecular markers, the analysis of 500 cases of sexual symptoms. To erase the equipment, the system, the device, the DNA, the device, the receiver, the device, the device. The next generation is called Miseq. The next generation is called vcf file. The next generation is called vcf file. Annotation "ANNOVAR" uses "1000 genome, ExAC, gnomAD", "new rules", "extraction", "SIFT", "PolyPhen2", "CADD" and "harmfulness". We are expecting to hear from you that you are suffering from DNA disease and that there is no PCR response method to confirm that you are suffering from illness. Na+, K+, Cl- receptor, GABAA acceptor and so on. There were 337 cases of asymptomatic syndrome, 163 cases of sexual disorder, a total of 500 cases, and 121 cases (95 cases, 26 cases) of the disease. There were 85 cases of SCN1A syndrome, 7 cases of SCN8A syndrome, 5 cases of KCNT1 syndrome, 4 cases of KCNQ2 syndrome and 3 cases of GABRB2 syndrome. All kinds of information are classified and classified. There were 93 cases of Na+ syndrome, 12 cases of K + receptor syndrome and 7 cases of GABAA receptor syndrome. Na+ receptor, K+ receptor, GABAA receptor, inhibitive receptor and instigated receptor.

项目成果

KCNA2遺伝子変異に伴うてんかん性脳症の1男児例

KCNA2基因突变导致男孩癫痫性脑病1例

• 发表时间: 2019
• 作者: 重田 英臣;福田 智文;柴原 淳平;五十嵐 亮太;石井 雅宏;楠原 浩一;石井 敦士;廣瀬 伸一
• 通讯作者: 廣瀬 伸一

遊走性焦点発作を伴う乳児てんかんにおける発作抑制期間と発達予後の関連

伴有游走性局灶性发作的婴儿癫痫发作抑制持续时间与发育预后的关系

• 发表时间: 2019
• 作者: 野村 敏大;本橋 裕子;石山 昭彦;竹下 絵里;齋藤 貴志;小牧 宏文;中川 栄二;須貝 研司;才津 浩智;藤田 京志;松本 直通;石井 敦士;廣瀬 伸一;佐々木 征行
• 通讯作者: 佐々木 征行

Regional specificity of KCNQ2 missense variants causing benign or epileptic encephalopathy phenotype.

KCNQ2 错义变异的区域特异性导致良性或癫痫性脑病表型。

• 发表时间: 2019
• 作者: Atsushi Ishii;Ayako Goto;Mami Shibata;Yukiko Ihara;Shinichi Hirose
• 通讯作者: Shinichi Hirose

てんかんの遺伝子研究の進歩

癫痫遗传学研究进展

• 发表时间: 2019
• 作者: Atsushi Ishii;Ayako Goto;Mami Shibata;Yukiko Ihara;Shinichi Hirose;Atsushi Ishii;石井 敦士
• 通讯作者: 石井 敦士

The effectiveness of intravenous benzodiazepine for status epilepticus in Dravet syndrome.

静脉注射苯二氮卓类药物治疗 Dravet 综合征癫痫持续状态的有效性。

• DOI: 10.1016/j.braindev.2022.01.004
• 发表时间: 2022
• 期刊: Brain Dev
• 作者: Kikuchi K;Hamano SI;Matsuura R;Nonoyama H;Daida A;Hirata Y;Koichihara R;Hirano D;Ishii A;Hirose S.
• 通讯作者: Hirose S.