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Development of multiple classification and comparison methods of cells based on information criteria and their applications to Cell Atlas

Development of multiple classification and comparison methods of cells based on information criteria and their applications to Cell Atlas
基于信息标准的细胞多种分类和比较方法的开发及其在Cell Atlas中的应用
批准号：
19K22894
负责人：
MATSUDA Hideo
金额：
$4.16万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2019-06-28 至 2022-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K22894/
关键词：
クラスタリング細胞系譜推定細胞アトラス1細胞RNAシーケンシング解析バイオインフォマティクス細胞系譜解析1細胞RNAシーケンス解析遺伝子発現解析1細胞RNAシーケンス1細胞トランスクリプトーム解析

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A Method for Detection of Markers for Epithelial-Mesenchymal Transition based on Single Cell Transcriptomic Data
DOI： 10.1145/3510427.3510436
发表时间： 2022-01
期刊： Proceedings of the 2022 12th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
影响因子： --
作者： [Kosho Murayama;H. Matsuda]
通讯作者： Kosho Murayama;H. Matsuda
Identification of Lineage Markers for T Cell Immune Dysregulation in Sarcoidosis using Single-Cell RNA-seq
使用单细胞 RNA-seq 鉴定结节病 T 细胞免疫失调的谱系标记
DOI： --
发表时间： 2022
期刊： International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
影响因子： --
作者： [Akihiro Nomura, Hideo Matsuda]
通讯作者： Hideo Matsuda
Cell trajectory inference for mouse stem cell differentiation using cell type information from single-cell RNA-seq data
使用单细胞 RNA-seq 数据中的细胞类型信息推断小鼠干细胞分化的细胞轨迹
DOI： --
发表时间： 2021
期刊：
影响因子： --
作者： [Yutaka Izeki, Mona Mizutome, Junko Yoshida, Shigeto Seno, Kyoji Horie, Hideo Matsuda]
通讯作者： Hideo Matsuda
Development of cell diversity analysis method based on gene regulatory prediction by Bayesian network
  • 批准号：
    18H04124
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额：
    $22.63万
  • 财政年份：
    2018
  • 负责人：
    MATSUDA Hideo
  • 依托单位：
    Osaka University
Comprehensive and Systematic Analysis of Cell Migration Dynamics by Real-Time Bioimaging
  • 批准号：
    16K12525
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.25万
  • 财政年份：
    2016
  • 负责人：
    MATSUDA Hideo
  • 依托单位：
    Osaka University
Dynamic analysis for living cell environment by 4D imaging
  • 批准号：
    24651229
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.58万
  • 财政年份：
    2012
  • 负责人：
    MATSUDA Hideo
  • 依托单位：
    Osaka University
Development of Gene Regulatory Network Analysis Methods for Revealing Cell Differentiation Processes
  • 批准号：
    22310125
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额：
    $11.98万
  • 财政年份：
    2010
  • 负责人：
    MATSUDA Hideo
  • 依托单位：
    Osaka University