Studies on growth and longevity of fish using wild zebrafish and related species

利用野生斑马鱼和相关物种研究鱼类的生长和寿命

基本信息

批准号：
19KK0161
负责人：
木下滋晴
金额：
$ 11.81万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-10-07 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

魚類は終生的に成長する種が多いが、ゼブラフィッシュでも骨格筋において新しい筋線維の形成が生涯続く。これは哺乳類では一般にみられない特性である。ゼブラフィッシュの稚魚および成魚の骨格筋切片を用いた空間的トランスクリプトミクスのデータ解析を進め、稚魚および成魚の空間的トランスクリプトミクスにおける解析スポットを統合してクラスタリングを行った結果、成魚の筋肉には稚魚の筋肉と遺伝子発現パターンの類似した領域が存在することが示された。当該領域は骨格筋の辺縁および腹部側に分布し、筋形成が活発であると共に、新生筋線維形成のマーカーである幾つかのミオシン重鎖遺伝子が他の領域よりも強く発現していることが明らかになった。これまでの解析からも、IGFBPの発現パターンやmyoDの発現パターンから、魚類特有の筋成長様式である新生筋線維形成において、ゼブラフィッシュの成魚ではある特定の領域が寄与することを明らかにしてきたが、以上の結果は、それをさらに支持するものである。また、研究協力関であるバングラディシュ農業大学およびUva Wellassa University（スリランカ）では、ゼブラフィッシュ近縁種でゼブラフィッシュよりも大型に成長するベンガルダニオ（Devariodevario）およびDevario malabaricusを捕獲し、現在飼育している。Devario malabaricusについては、飼育下での繁殖にも成功したことから、様々な成長段階のサンプルの確保が可能になると期待される。

许多鱼生长终生的物种，但即使斑马鱼也继续在骨骼肌肉中形成新的肌肉纤维。这是哺乳动物中常见的特征。使用青少年和成年斑马鱼的骨骼肌切片进行空间转录组学的数据分析，以及聚类的数据分析是通过整合少年和成年鱼的空间转录组学中的分析点来进行的，这表明成人鱼类肌肉中存在具有相似基因表达模式的肌肉。该区域分布在骨骼肌的边缘和腹侧，并且已经揭示了肌发生是活性的，并且某些肌球蛋白重链基因（它们是新遗传性肌原纤维形成的标志物）的表达更为强烈。先前的分析还表明，由于IGFBP和MYOD的表达模式，某些区域在新遗传肌原纤维形成中有助于成年斑马鱼，这是一种独特的肌肉生长样式，但上述结果进一步支持了这一点。此外，孟加拉国农业大学和UVA Wellsa University（Sri Lanka）的研究伙伴目前正在捕获和培养与Zebrafish密切相关的孟加拉Danio（Devariodevario）（Devariodevario）和Devario Malabaricus，它们比Zebrafish更大。关于Devario Malabaricus，预计在各个生长阶段的样本将在囚禁中成功繁殖，这将是可能的。

项目成果

期刊论文数量（6）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Zebrafish Danio rerio myotomal muscle structure and growth from a spatial transcriptomics perspective

从空间转录组学角度观察斑马鱼斑马鱼肌节肌肉结构和生长

DOI：
10.1016/j.ygeno.2022.110477
发表时间：
2022
期刊：
Genomics
影响因子：
4.4
作者：
Guanting Liu;Takumi Ito;Yusuke Kijima;Kazutoshi Yoshitake;Shuichi Asakawa;Shugo Watabe;Shigeharu Kinoshita
通讯作者：
Shigeharu Kinoshita

Spatial transcriptomic analysis of the trunk muscle in zebrafish

斑马鱼躯干肌肉的空间转录组分析