正確な生体内ゲノム編集評価システムの開発

精准体内基因组编辑评估系统开发

基本信息

  • 批准号:
    19KK0401
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 9.73万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
  • 财政年份:
    2020
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2020 至 2023
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

汎用性、安全性の高い高効率なゲノム編集ツールは、様々なライフサイエンス分野の基礎研究・応用研究両面に必要不可欠な技術である。国産ゲノム編集技術として開発したCRISPR-Cas3を社会実装できるゲノム編集ツールとして確立するためには、安全性や効率などを正確に評価する必要があるが、CRISPR-Cas3の標的特異性を正確に評価できる解析手法は確立されていない。本課題研究では、スイス連邦工科大学のJacob Corn教授らと共に、CRISPR-Cas3の生体内ゲノム編集における正確な評価システムの開発を目指している。本年度は、2020年から2021年にスイス連邦工科大学に滞在してDNA修復関連因子Mre11の抗体を用いたChip-seq法をCRISPR-Cas3用に改良したものをさらに検証し、オフターゲット候補領域を検出する方法をDISC 3-seqとして確立した。実際にin silico解析で複数のオンターゲットを持つ標的、オフターゲット候補領域の多い標的を敢えて選択することで、DISC 3-seqでこれらのオフターゲットを評価できるか検証した。その結果、いくつかの候補領域で検出が確認され、数値化することに成功した。現在、DISC 3-seqで検出された領域について変異導入効率を詳細に検討し、変異導入効率の相関がみられるかどうかを評価している。
High efficiency of versatility and safety, compilation of basic research and application research, and necessary technologies. CRISPR-Cas3 has been developed in China, and its compilation techniques have been established in China. The analytical methods for CRISPR-Cas3 have been established in China. This project aims to provide guidance for the development of CRISPR-Cas3 in vivo. This year, from 2020 to 2021, the United States University of Technology has established a method for detecting DNA repair related factors by using the Chip-Seq method. In fact, in silico analysis, the number of candidate fields is selected, and DISC 3-seq is evaluated. The result, the candidate field, the detection, the confirmation, the numerical value, the success. Now, DISC 3-seq can detect different import efficiency in different fields.

项目成果

期刊论文数量(41)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Development and applications of CRISPR-Cas3 technology for studying human diseases
CRISPR-Cas3技术在人类疾病研究中的开发与应用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Joe Sakamoto;Eriko Chisada;Pham Van Cuong;Masahiro Nakano;Takeharu Nagai;Hayato Yokoi;Takeshi Kitano;Yasuhiro Kamei;吉見一人
  • 通讯作者:
    吉見一人
国産ゲノム編集技術の開発と新型コロナウイルス診断への応用
国产基因组编辑技术开发及其在新型冠状病毒诊断中的应用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Joe Sakamoto;Yuko Kamikawa;Yasuhiro Kamei;吉見一人
  • 通讯作者:
    吉見一人
Cas3タンパク質を製造する方法
Cas3蛋白的生产方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
タイプI-E CRISPR-Cas3による標的二本鎖DNA切断機構の解明
I-E型CRISPR-Cas3阐明靶标双链DNA切割机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉見 一人;竹下 浩平;古寺 哲幸;渋村 里美;山内 祐子;山本 雅貴;真下知士
  • 通讯作者:
    真下知士
CRISPR-Cas3システムによるゲノム編集-国産ゲノム編集技術の再生医療への挑戦
使用CRISPR-Cas3系统进行基因组编辑——国产基因组编辑技术对再生医学的挑战
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  • 通讯作者:
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  • 作者:
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吉見 一人其他文献

Method for knock-in of dna into target region of mammalian genome, and cell
将DNA敲入哺乳动物基因组目标区域的方法和细胞
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    真下 知士;吉見 一人;金子 武人
  • 通讯作者:
    金子 武人
ヒト骨肉腫細胞における HOTAIR による ALPL のエピジェネティックな制御機構の解析
HOTAIR对人骨肉瘤细胞ALPL的表观遗传调控机制分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三沢彩;瀧澤俊広;吉見 一人;三沢 彩;Kazuto Yoshimi;三沢 彩
  • 通讯作者:
    三沢 彩
ゲノム編集技術をもちいてマウス・ラットのゲノムを操作する
使用基因组编辑技术操纵小鼠和大鼠基因组
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉見一人;今井悠二;田邉彰;真下知士;小出剛;吉見 一人
  • 通讯作者:
    吉見 一人
マウス・ラット受精卵を用いたゲノム改変技術の現状
利用小鼠和大鼠受精卵进行基因组修饰技术的现状
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Su T;Izawa T;Thoms M;Yamashita Y;Cheng J;Berninghausen O;Hartl FU;Inada T;Neupert W;Beckmann R.;吉見 一人
  • 通讯作者:
    吉見 一人
胎盤特異的インプリント遺伝子Sfmbt2内のマイクロRNAクラスターのインプリント消失は体細胞クローンマウスの胎盤異常を引き起こす
胎盘特异性印记基因 Sfmbt2 中 microRNA 簇印记的丢失导致体细胞克隆小鼠胎盘异常
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Misato Nakanishi-Koakutsu;Tadashi Takaki;Kenji Miki;Yoshinori Yoshida;吉見 一人;井上貴美子,越後貫成美,上村悟氏,的場章悟,廣瀬美智子,本多新,三浦健人,羽田政司,百々由希子,長谷川歩未,持田慶司,小倉淳郎
  • 通讯作者:
    井上貴美子,越後貫成美,上村悟氏,的場章悟,廣瀬美智子,本多新,三浦健人,羽田政司,百々由希子,長谷川歩未,持田慶司,小倉淳郎

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  • 通讯作者:
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非天然型CRISPR-Cas3による精密ゲノム操作法開発と生体応用
非天然CRISPR-Cas3精准基因组操作方法开发及生物学应用
  • 批准号:
    24K02010
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 9.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
時空間制御CRISPR-Cas3の開発および生体内ゲノム改変への応用
时空控制CRISPR-Cas3的开发及其在体内基因组修饰中的应用
  • 批准号:
    22K19238
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 9.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
組換えBAC遺伝子導入ラットを用いたAPCタンパク質の炎症抑制ドメインの同定
重组BAC转基因大鼠APC蛋白抗炎结构域的鉴定
  • 批准号:
    11J03639
  • 财政年份:
    2011
  • 资助金额:
    $ 9.73万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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