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SAF-A/RNA複合体が作り出す転写制御の場の解明

阐明 SAF-A/RNA 复合物产生的转录控制场

基本信息

批准号：
20H03190
负责人：
野澤竜介
金额：
$ 11.32万
依托单位：
Japanese Foundation for Cancer Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年度までの研究から、RNA分解活性を持つExoribonuclease 2 (XRN2)は、SAF-A/RNA構造体のRNAを分解し、その形成を負に制御することを見出した。さらにXRN2の機能阻害により、核内にRNAが蓄積し、また転写の変動が引き起こされた。これらの観察結果から、適正な転写制御には、XRN2によるSAF-A/RNA構造体を構成するRNAの分解が重要であることが考えられた。これを踏まえて令和4年度は、SAF-A/RNA構造体やXRN2の転写制御への役割を理解することを目指し、XRN2が寄与するRNAの代謝について検討した。1) XRN2によって分解されたRNAが新生RNAに取り込まれるかどうかを検討した。ウリジンのアナログである4SU (4-thio-uridine)を含んだRNAを試験管内で合成し、その4SU-RNAをヒト培養細胞にトランスフェクションした。細胞からRNAを調製し、アクチンやGAPDHといったハウスキーピング遺伝子について解析したところ、XRN2依存的な新生RNAへの4SUの取り込みが確認された。2) XRN2依存的なRNA分解産物の新生RNAへの取り込みについてゲノムワイドに検討した。4SUが取り込まれた新生RNAと、取り込まれていない既存のRNAを、4SUの化学修飾により区別して同定するSLAM-seq (thiol (SH)- Linked Alkylation for the Metabolic Sequencing of RNA)解析を行なった。コントロール細胞では、新生RNAに4SUの取り込みを確認できたが、XRN2をノックダウンした細胞では、有意に4SUの取り込みが減少していた。これらの結果より、SAF-A/RNA構造体を構成するRNAはXRN2を介してリサイクルされることで、適正な転写に寄与していると考えられた。

Last year, we studied the activity of RNA decomposition in Exoribonuclease 2 (XRN2), SAF-A/RNA production, RNA decomposition, formation and control. If you don't have a XRN2 machine, it can block the storage of RNA in the nuclear program, and it will cause you to do so if you don't want to do so. Please check the results, make sure that you are writing and controlling the system, and that the XRN2 system is designed to decompose the RNA into important components. The order of the year and the fourth year of the year, the SAF-A/RNA system, the XRN2 system, the service cutting, the understanding, the XRN2, the RNA, the order, the price, the price. 1) XRN2 decomposition, RNA, freshman RNA, fetch, read, break down, break down, break down. The 4SU (4-thio-uridine) contains the RNA synthesis, the 4SU-RNA synthesis, the cell culture, the cell culture, and the synthesis. The cell, the GAPDH, the cell, the cell, the GAPDH, the cell, the GAPDH, the cell, the cell, the 4SU, the 4SU, the RNAi, the 4SU, the RNAi, the RNAi, the RNAs, the 4SU, the RNAs, the 4SU, the RNAs, the RNAs 2) XRN2-dependent "RNA decomposition". New RNAs are extracted. 4SU is used to analyze the new RNA, the existing RNA, and the 4SU chemistry to determine the same SLAM-seq (thiol (SH)-Linked Alkylation for the Metabolic Sequencing of RNA). The new RNAs 4SU, the freshman RNA4SU, the new According to the results, the SAF-A/RNA system was created into a RNA XRN2 system that was sent to you in the form of a letter, a letter, and a letter.