クロマチンの運動性から捉える転写制御のゆらぎとがん細胞の悪性化

从染色质运动和癌细胞恶性转化了解转录控制的波动

• 批准号: 22K19465
• 负责人: 野澤 竜介
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: Japanese Foundation for Cancer Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-06-30 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K19465/
• 关键词: 転写; クロマチン; 超解像イメージング解析; がんのイニシエイション; 転写制御のゆらぎ; クロマチン構造

がん細胞では、ゲノム全体の転写レベルが変動していることが明らかとなっている。転写はプロモーターとエンハンサーとの動的な相互作用によって制御されることが明らかとなってきたが、クロマチンの動態を細胞内でとらえる技術が未だ限られているため、がん細胞において転写制御に関わるクロマチンの振る舞いがいかに変化しているのかについては未だよくわかっていない。そこで本研究では、転写制御クロマチンの動態を、超解像顕微鏡STORMを用いて1分子レベルで観測する技術を開発することを目的とした。令和4年度は、以下の2項目を進め、細胞核内の転写制御クロマチンの集合動態を定量的に解析する手法を確立した。1) プロモーターやエンハンサーといった転写制御クロマチンを構成するヒストンH2A.Zに着目した。細胞核内に局在するH2A.Z分子のXY座標情報をSTORMにより抽出し、Pair-correlation関数を導入することで、H2A.Zのクラスターのサイズやクラスター形成の頻度を評価することができた。また転写阻害処理や脱アセチル化酵素の阻害剤であるTSA処理によって、H2A.Zのクラスター形成の頻度が有意に減少することが見出された。2) ATAC-seqの原理を応用した、オープンクロマチン領域を可視化するATAC-seeとSTORM解析とを組み合わせた「ATAC-STORM法」を検討した。Tn5トランスポゼースと蛍光ラベルしたオリゴDNAを用いて、オープンクロマチンを標識し、1）と同様に、STORMを用いて標的の座標情報を抽出し、Pair-correlation関数によるクラスター解析を試みた。オープンクロマチンのクラスター形成もまた、H2A.Zの挙動と一致して、転写阻害処理やTSA処理により有意に減少した。

All the people in the hospital should write the information about the movement of the children and make sure that they do. The interaction system is used to control the interaction between each other. The system is responsible for the monitoring and control of the operation. I don't know what to do. I don't know. I don't know. I don't know. The purpose of this study is to make and control the dynamic status of the information system, and the super-solution STORM uses the molecular technology of microphone to start the purpose of the experiment. Ling and 4 years, the following 2 items are in progress, and the quantitative analytical methods for the collection of data in the nucleus are established. 1) tell me how to write and make sure that you are looking at the H2A.Z. The intranuclear bureau reports H2A.Z molecules in the XY seat, STORM molecules, Pair-correlation numbers, H2A.Z molecules, and so on. The reason is that the chemical enzyme blocks the TSA, the H2A.Z, the temperature, the temperature, and the temperature. 2) the principle of ATAC-seq can be used in the field of ATAC-see STORM analysis. ATAC-STORM method can be used in the field of analysis. The Tn5 information is different. The DNA uses the same tag, the STORM uses the same tag, the Pair-correlation number reports the extraction, and the Pair-correlation counts the number of messages. You need to know that you need to know that you have a problem, that you have H2A.Z information, that you don't want to pay attention to TSA, that you don't want to pay attention.

项目成果

染色体分配を制御するAurora B反応の形成機構

控制染色体分离的Aurora B反应的形成机制

• 发表时间: 2022
• 作者: Boteva Lora;Nozawa Ryu-Suke;Naughton Catherine;Samejima Kumiko;Earnshaw William C.;Gilbert Nick;野澤竜介;野澤竜介
• 通讯作者: 野澤竜介

染色体分配を制御するAurora B集合体の形成機構

控制染色体分离的Aurora B聚集体的形成机制

• 发表时间: 2022
• 作者: Kitajima Shunsuke;Tani Tetsuo;Springer Benjamin F.;Campisi Marco;Osaki Tatsuya;Haratani Koji;Chen Minyue;Knelson Erik H.;Mahadevan Navin R.;Ritter Jessica;Yoshida Ryohei;Kohler Jens;Ogino Atsuko;Nozawa Ryu-Suke;他14名;野澤竜介;野澤竜介;野澤竜介;野澤竜介;野澤竜介;野澤竜介
• 通讯作者: 野澤竜介

染色体分配を保証するキナーゼ反応場

确保染色体分离的激酶反应场

• 发表时间: 2023
• 作者: Boteva Lora;Nozawa Ryu-Suke;Naughton Catherine;Samejima Kumiko;Earnshaw William C.;Gilbert Nick;野澤竜介
• 通讯作者: 野澤竜介

Aurora B microenvironment: biomolecular assembly ensuring accurate chromosome segregation

Aurora B 微环境：生物分子组装确保染色体精确分离

• 发表时间: 2022
• 作者: Kitajima Shunsuke;Tani Tetsuo;Springer Benjamin F.;Campisi Marco;Osaki Tatsuya;Haratani Koji;Chen Minyue;Knelson Erik H.;Mahadevan Navin R.;Ritter Jessica;Yoshida Ryohei;Kohler Jens;Ogino Atsuko;Nozawa Ryu-Suke;他14名;野澤竜介;野澤竜介;野澤竜介
• 通讯作者: 野澤竜介

MPS1 inhibition primes immunogenicity of KRAS-LKB1 mutant lung cancer.

• DOI: 10.1016/j.ccell.2022.08.015
• 发表时间: 2022-10-10
• 期刊: CANCER CELL
• 影响因子: 50.3
• 作者: Kitajima, Shunsuke;Tani, Tetsuo;Springer, Benjamin F.;Campisi, Marco;Osaki, Tatsuya;Haratani, Koji;Chen, Minyue;Knelson, Erik H.;Mahadevan, Navin R.;Ritter, Jessica;Yoshida, Ryohei;Kohler, Jens;Ogino, Atsuko;Nozawa, Ryu-Suke;Sundararaman, Shriram K.;Thai, Tran C.;Homme, Mizuki;Piel, Brandon;Kivlehan, Sophie;Obua, Bonje N.;Purcell, Connor;Yajima, Mamiko;Barbie, Thanh U.;Lizotte, Patrick H.;Janne, Pasi A.;Paweletz, Cloud P.;Gokhale, Prafulla C.;Barbie, David A.
• 通讯作者: Barbie, David A.