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単純ヘルペスウイルス新規遺伝子のさらなる再解読とin depth解析

新型单纯疱疹病毒基因的进一步重新解码和深入分析

基本信息

批准号：
20H03492
负责人：
加藤哲久
金额：
$ 11.32万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20H03492/
关键词：
単純ヘルペスウイルス新規遺伝子 decoding 非標準的遺伝子 NanoPore リピート領域 iORF

项目摘要

近年、リボソーム・プロファイリングや大規模mRNA解析の開発により、ヘルペスウイルスがコードする新規遺伝子に注目が集まっている。最近、申請者は、実際に細胞内で「安定発現」する新規遺伝子を効率的に同定可能な「ウイルス遺伝子decoding法」を開発し、単純ヘルペスウイルス1型(HSV-1)にのみコードされ、脳炎発症を司る非標準的翻訳産物を同定した。本研究では、本技術を基盤に、(i) 長年、解析困難であった「HSV-1リピート領域にコードされる遺伝子」のdecoding法の確立とそのin depth機能解析; (ii) 単純ヘルペスウイルス2型(HSV-2)特異的な遺伝子の同定とそのin depth解析等を実施することで、HSVがコードする遺伝情報のさらなる解読を試みている。本年度は、昨年に引き続き、上記(i)および(ii)の解析を継続している。(i)に関しては、昨年度、同定したHSV-1リピート領域にコードされる2種類の新規遺伝子に関して、特異的欠損ウイルスの作出を完了した。さらに、培養細胞系およびマウスモデルにおける増殖あるいは病態発現機構の解析を実施したが、野生型ウイルスと有意な差を見出すことはできなかった。一方、HSV-1リピート領域外にコードされる2種類の新規遺伝子を追加同定したことから、これらの新規遺伝子に関しても、特異的欠損ウイルスを作出し、HSV増殖性・病態発現への影響を解析した。興味深いことに、1種類の新規遺伝子において効率的なHSVの神経病原性の発揮への関与が認められた。(ii)に関しては、現在、新規遺伝子を同定するため、質量解析を実施中である。

In recent years, リボソーム · プロファイリングや large-scale mRNA parsing の open 発により, ヘルペスウイルスがコードするに attention が set of new rules but 伝まっている. Recently, applicants は, be interstate に intracellular です "settle 発 now" る new rules but 伝 son をに sharper rates may be な "ウイルス posthumous son 伝 decoding method" を open 発し, 単 pure ヘルペスウイルス type 1 (HSV - 1) にのみコードされ, 脳 inflammation 発を department る non-standard product turn 訳を with fixed した. This study では, this technical を base plate に, (I) the elder, analytic difficulty であった "HSV - 1 リピート field にコードされる heritage 伝" のの decoding method to establish とその in function of the depth resolution; (ii) 単 pure ヘルペスウイルス type 2 (HSV 2) specific な heritage 伝の son be とその in the depth resolution of を be applied することで, HSV がコードする heritage 伝 intelligence のさらなる solution 読を try みている. This year に, last year に, cite に続に, and the above note (i)および(ii) に for analysis を継続ててる. (I) に masato しては, last year, with the constant した HSV - 1 リピート field にコードされる 2 kinds の new rules but 伝 son に masato して, specific owe damage ウイルスの make finished をした. さらに, culture cell lines およびマウスモデルにおける raised colonization あるいは pathological 発 institutions now の parsing を be applied したが, wild type ウイルスと intentionally な poor を see out すことはできなかった. Side, HSV - 1 リピート areas outside にコードされる 2 kinds の new rules but 伝 son を additional be したことから, これらの new rules but 伝 son に masato しても, specific owe damage ウイルスをし, HSV sexual rights colonization, pathological 発 now への effect を resolution した. It is of great interest that <s:1> <s:1> とに, 1 type of <s:1> new regulations leave 伝 the におててて the て efficacy of なHSV is related to the transmission へ <e:1> and が recognition められた. (ii)に relations て, current and new regulations 伝, を, するため, quality analysis を, in practice である.