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単純ヘルペスウイルス新規遺伝子のさらなる再解読とin depth解析

新型单纯疱疹病毒基因的进一步重新解码和深入分析

基本信息

批准号：
20H03492
负责人：
加藤哲久
金额：
$ 11.32万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20H03492/
关键词：
単純ヘルペスウイルス新規遺伝子 decoding 非標準的遺伝子 NanoPore リピート領域 iORF

项目摘要

近年、リボソーム・プロファイリングや大規模mRNA解析の開発により、ヘルペスウイルスがコードする新規遺伝子に注目が集まっている。最近、申請者は、実際に細胞内で「安定発現」する新規遺伝子を効率的に同定可能な「ウイルス遺伝子decoding法」を開発し、単純ヘルペスウイルス1型(HSV-1)にのみコードされ、脳炎発症を司る非標準的翻訳産物を同定した。本研究では、本技術を基盤に、(i) 長年、解析困難であった「HSV-1リピート領域にコードされる遺伝子」のdecoding法の確立とそのin depth機能解析; (ii) 単純ヘルペスウイルス2型(HSV-2)特異的な遺伝子の同定とそのin depth解析等を実施することで、HSVがコードする遺伝情報のさらなる解読を試みている。本年度は、昨年に引き続き、上記(i)および(ii)の解析を継続している。(i)に関しては、昨年度、同定したHSV-1リピート領域にコードされる2種類の新規遺伝子に関して、特異的欠損ウイルスの作出を完了した。さらに、培養細胞系およびマウスモデルにおける増殖あるいは病態発現機構の解析を実施したが、野生型ウイルスと有意な差を見出すことはできなかった。一方、HSV-1リピート領域外にコードされる2種類の新規遺伝子を追加同定したことから、これらの新規遺伝子に関しても、特異的欠損ウイルスを作出し、HSV増殖性・病態発現への影響を解析した。興味深いことに、1種類の新規遺伝子において効率的なHSVの神経病原性の発揮への関与が認められた。(ii)に関しては、現在、新規遺伝子を同定するため、質量解析を実施中である。

In recent years, we have paid close attention to the new regulations of the large-scale model mRNA. Recently, it is possible that the rates of new regulations are the same as those of the applicants and the international community. The decoding method may be used to determine the quality of products that are not up to the standard in the department of inflammatory disease. This study is based on the basic principles of this technology. (I) for many years, it has been difficult to analyze the problems in the field of HSV-1. The decoding method ensures that the in depth machine can be analyzed. (ii) in the case of the special type 2 (HSV-2), there is no difference between the two parts of the system. The in depth analysis and so on are related to the application of the information system, such as the application of the information, the analysis of the HSV, the detection of the information, and the resolution of the information. For this year and last year, we will introduce the following information: (I) the last one (ii), and the last one. (I) in the past year, in accordance with the new regulations in the field of HSV-1 regulations, such as the new regulations, the special requirements have been completed. The pathogeny of the plant was analyzed by the analysis of the mechanism, and the wild type was intentionally used. On the one hand, the new regulations in the field of HSV-1, such as those in the new regulations 2, are appended to the new regulations in the same domain, in the new regulations, in special cases, and in the presence of HSV reproductive disease. There is a deep taste of HSV in the new regulations of the first category. The etiology of the disease is different from that of the disease. (ii) the current, current and new specifications are the same as those in the same standard, and the quantitative analysis is necessary.