選択的スプライシング異常をモデル化・制御可能にするエピゲノム編集技術の開発
選択的スプライシング異常をモデル化・制御可能にするエピゲノム編集技術の開発
批准号:
20J13292
负责人:
國井 厚志
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-24 至 2022-03-31
中文摘要
前年度、4種類のRNA-タンパク質結合システムおよび3種類のタンパク質タグシステムを取り入れ、因子の集積効果を体系的に比較可能なシステム群「EARTHコレクション」を整備し、転写活性化因子の使用において、一部のシステムがmRNAレベルで従来型を上回ることを見出していた。今年度は、標的遺伝子(RANKL、CTCFL、MMP9)のタンパク質レベルでの発現解析(ウェスタンブロット解析および免疫染色)を実施した。細胞株は、前年度に引き続きHEK293T株とMCF-7株を使用した。RANKL遺伝子およびCTCFL遺伝子の活性化では、ウェスタンブロット解析においてはいずれも目的とするシグナルが検出されなかったものの、免疫染色においては、MCF-7株でのRANKL遺伝子、HEK293T株でのCTCFL遺伝子におけるシグナルの増強が確認された。MMP9遺伝子の活性化では、HEK293T、MCF-7の両株でのウェスタンブロット解析において、システム導入によりシグナルが出現し、システム間での強弱は、mRNAレベルでの結果と関連性がみられた。なおMMP9は、細胞外に分泌後、細胞外マトリクス(ECM)を分解する機能を有することから、培養上清からのMMP9の検出も検討したところ、システム導入によって強いシグナルが出現した。免疫染色でも、特にMCF-7株ではシステム導入により明瞭なシグナルが出現した。これらの結果から、EARTHコレクションによって、mRNAだけでなくタンパク質レベルでの発現も誘導されたことが確認された
英文摘要
前年度、4種類のRNA-タンパク質結合システムおよび3種類のタンパク質タグシステムを取り入れ、因子の集積効果を体系的に比較可能なシステム群「EARTHコレクション」を整備し、転写活性化因子の使用において、一部のシステムがmRNAレベルで従来型を上回ることを見出していた。今年度は、標的遺伝子(RANKL、CTCFL、MMP9)のタンパク質レベルでの発現解析(ウェスタンブロット解析および免疫染色)を実施した。細胞株は、前年度に引き続きHEK293T株とMCF-7株を使用した。RANKL遺伝子およびCTCFL遺伝子の活性化では、ウェスタンブロット解析においてはいずれも目的とするシグナルが検出されなかったものの、免疫染色においては、MCF-7株でのRANKL遺伝子、HEK293T株でのCTCFL遺伝子におけるシグナルの増強が確認された。MMP9遺伝子の活性化では、HEK293T、MCF-7の両株でのウェスタンブロット解析において、システム導入によりシグナルが出現し、システム間での強弱は、mRNAレベルでの結果と関連性がみられた。なおMMP9は、細胞外に分泌後、細胞外マトリクス(ECM)を分解する機能を有することから、培養上清からのMMP9の検出も検討したところ、システム導入によって強いシグナルが出現した。免疫染色でも、特にMCF-7株ではシステム導入により明瞭なシグナルが出現した。これらの結果から、EARTHコレクションによって、mRNAだけでなくタンパク質レベルでの発現も誘導されたことが確認された
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多様な因子の集積によるゲノム編集と派生技術の高度化
通过各种因素的积累,基因组编辑和衍生技术的复杂性
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
実験医学
影响因子:
--
作者:
[國井厚志, 山本卓, 佐久間哲史]
通讯作者:
佐久間哲史
Optimization of dCas9-based transcription activator systems using a collection of variously patterned RNA aptamers and protein tags
使用一系列不同模式的 RNA 适体和蛋白质标签优化基于 dCas9 的转录激活子系统
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kunii A, Nakamura S, Yamamoto T, Sakuma T]
通讯作者:
Sakuma T
Highly organized, variously patterned accumulation platforms of transcription activators using Class 1 and Class 2 CRISPR systems
使用 1 类和 2 类 CRISPR 系统的高度组织化、多种模式的转录激活剂积累平台
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kunii A, Nakamura S, Yoshimi K, Mashimo T, Yamamoto T, Sakuma T]
通讯作者:
Sakuma T
DOI:
10.1007/s11626-020-00469-y
发表时间:
2020-05
期刊:
In Vitro Cellular & Developmental Biology - Animal
影响因子:
--
作者:
[Atsushi Kunii;Takashi Yamamoto;Tetsushi Sakuma]
通讯作者:
Atsushi Kunii;Takashi Yamamoto;Tetsushi Sakuma
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