Establishment of precision medicine by using patient-derived small cell lung cancer organoids

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令和4年度に関して、臨床手術検体や気管支鏡検体、胸水などを用いて、引き続き患者腫瘍の性質を維持したまま培養が可能な3次元培養技術であるオルガノイド培養を用いた、患者由来小細胞肺癌オルガノイドライブラリーの構築を行った。それらの肺癌オルガノイドにおいて、病理組織学的に小細胞肺癌と矛盾しない所見であることや、患者由来臨床組織との相同性が確認できている。樹立したオルガノイドを用いて臨床で用いる薬剤を使用し薬剤感受性試験を行い、実臨床での薬剤の効果とin vitroでの反応性の比較を行った。またオルガノイドより抽出したゲノムDNAを用いて、全エクソームシークエンスにおける遺伝子変異解析や変異シグネチャー解析を行いゲノムレベルでの既報との相同性も確認した。抽出したmRNAを用いてトランスクリプトーム解析を行うことで、既存の小細胞肺癌で知られている転写因子の発現を中心に確認し、解析検討を行った。オルガノイドの培養に用いる培地条件の検討を行い、リガンドへの依存性を定量化し、検証を続けて行った。pooled libraryを用いた CRISPR-Cas9 knock out screening を各サブタイプ毎に検体数を増やして行うことで、それらのオルガノイドがどのような転写因子に依存して増殖しているかの検討を引き続き行い、小細胞肺癌の発癌と固有の転写因子との関連を探索した。今後それらの解析結果を踏まえ、小細胞肺癌の個別化治療に応用可能な新たな知見の発見と臨床応用を目指している。