Development of a Novel and Simple Stratification Test for Early diagnosis of Dementia and Application to a Drop of Blood Analysis
Development of a Novel and Simple Stratification Test for Early diagnosis of Dementia and Application to a Drop of Blood Analysis
批准号:
20J22464
负责人:
六車 宜央
金额:
$1.98万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-24 至 2023-03-31
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英文摘要
最適化したLC-MS条件を利用することで、構造異性体を含む200種類以上ものカルボン酸代謝物を一斉に測定可能な分析系を構築することが可能であった。また、安定同位体標識誘導体化を用いた内標準法にて作成した検量線では、良好な直線性が得られ、定量も可能であると推測された。しかしながら、標準溶液中またはマトリックス試料中の反応性の違いを考慮する必要があるため、定量にはさらなるバリデーション試験が必要となると考えられた。ワイドターゲットメタボロミクスにより得られた網羅的な代謝物の定量データ(数値)を二次元データ(画像)へ変換し、新たな画像データとして、Pathway-based metabolic code (PBMC)を作成した。このPBMCをAIに学習させ、教師ありのディープラーニングにより、対照群及びアルツハイマー型認知症を識別できるCNNモデルを構築した。構築したCNNモデルをホールドアウト検証法により評価するため、全データセットを訓練データ、検証データ、評価データに分割させた。本モデルは、85%以上の正確性でアルツハイマー型認知症を識別することができ、スクリーニング分類法として有用であると考えられた。さらに、AIのブラックボックス問題を解消するため、AIがどの部分を認識して、識別しているのかを可視化させた結果、PBMC上の様々な代謝物が識別に関与していることが明らかになり、これらを詳しく解析することで、認知症における新たな代謝物バイオマーカー候補化合物を特定できる可能性が示された。また、開発した方法論は認知症に限らず、様々な病態及び生体試料に応用可能であるため、AIを用いた新規の代謝物解析法としての有用性も示唆された。
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安定同位体標識誘導体化LC-MS/MSによる ヒト体液中胆汁酸の網羅解析
使用稳定同位素标记衍生化 LC-MS/MS 综合分析人体体液中的胆汁酸
DOI:
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发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[六車 宜央, 赤津 裕康, 橋詰 良夫, 金田 大太, 宮部 勝之, 井之上 浩一]
通讯作者:
井之上 浩一
ニューラルネットワーク融合LC-MS/MSワイドターゲットメタボロミクスの開発:アルツハイマー型認知症の特徴的な代謝パターン解析
神经网络融合LC-MS/MS宽靶代谢组学的发展:分析阿尔茨海默病的特征代谢模式
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[六車宜央, 井之上 浩一]
通讯作者:
井之上 浩一
DOI:
10.24508/mms.2021.06.002
发表时间:
2021-06
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yoshio Muguruma;Haruhito Tsutsui;Y. Hashizume;H. Akatsu;K. Inoue]
通讯作者:
Yoshio Muguruma;Haruhito Tsutsui;Y. Hashizume;H. Akatsu;K. Inoue
安定同位体標識誘導体化LC-MS/MSによるヒト体液中の胆汁酸代謝解析
使用稳定同位素标记衍生化 LC-MS/MS 分析人体体液中的胆汁酸代谢
DOI:
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发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[六車宜央, 赤津裕康, 橋詰良夫, 金田大太, 宮部勝之, 井之上浩一]
通讯作者:
井之上浩一
安同位体培養法による13C標識アベルメクチンB1a/1bの生合成技術の開発
同位素培养法开发13C标记阿维菌素B1a/1b生物合成技术
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[別府滉大, 六車宜央, 斎藤大地, 高橋未来, 原田修一, 井之上浩一]
通讯作者:
井之上浩一
共 11 条
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面向AI驱动的信息化工程监管与自动化测试平台研发
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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