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Revealing the symbiotic mechanisms from useful metabolites of dinoflagellates in corals

揭示珊瑚中甲藻有用代谢物的共生机制

基本信息

批准号：
20K05798
负责人：
將口栄一
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年度までに褐虫藻ゲノム間の比較解析により、褐虫藻種間のインターラクションがサンゴの白化現象を分子レベルで解析していく上で重要であるかもしれないことを示唆する結果を得て、論文として報告することができた。一方で、褐虫藻とバクテリアのインターラクションが褐虫藻の増殖に重要であることが示唆されてきているが、サンゴや褐虫藻に共生するバクテリアは、そのほとんどが16S rRNA遺伝子による多様性の解析にとどまってきた。例えば、我々がゲノムを解読してきた褐虫藻4種の中で、白化に耐性のある褐虫藻Durusdinium trenchiiだけが抗生物質の存在下において増殖することができないことなどから、バクテリアとのインターラクションが重要であることが示唆されている。本研究において、サンゴに共生する褐虫藻4種の培養株に共在しているバクテリアの全ゲノム配列を決定し、公的データベースに登録した。その4種に共通のバクテリアは、培養が難しいとされてきたアルファプロテオバクテリアであった。しかしながら本研究ではその単離培養に成功した。4種のバクテリアのゲノムサイズは、2.9~3.9 Mbであった。2800~3800個の遺伝子をコードしており、褐虫藻が合成できないビタミンの合成遺伝子セットをコードしているなど、褐虫藻とのインターラクションに重要と考えられる遺伝子群の存在を明らかにした。バクテリアゲノムにコードされた遺伝子セットから予測される分子レベルのインターラクションを議論し、論文としてまとめた。本研究で得られた結果は、白化しやすいサンゴに共生し、培養の困難な褐虫藻を単離培養し、解析していく上で役に立つ可能性がある。

Comparative analysis of brown worm algae and brown worm algae species in the previous yearベルでanalyticsしていく上でimportantであるかもしれないことをThe result of the instigation is obtained, and the paper is reported. One side, brown worm algae とバクテリアのインターラクションがBrown worm algae reproduction is important であることがSymbiosis of brown worm algae and brown worm algae 16S Analysis of the polymorphism of rRNA genes is done. Example: えば、我がゲノムをsolved 読してきたBrown worm algae 4 kinds of の中で、Albino-resistant brown worm algae Durusdinium Trenchii is a plant that grows in the presence of antibioticsどから、バクテリアとのインターラクションがImportant であることが时攆されている. In this study, 4 kinds of cultured strains of brown worm algae, including symbiotic brown worm algae and symbiotic brown worm algae, were cultivated together. The るバクテリアの全ゲノムmatching arrangement をdeterminationし, the public データベースに登录した.その4 kinds of common のバクテリアは, cultivate がdifficult しいとされてきたアルファプロテオバクテリアであった. This research is based on the success of this research. 4 kinds of のバクテリアのゲノムサイズは, 2.9~3.9 Mbであった. 2800~3800 pieces of の伝子をコードしおり、Brown worm algae synthetic できないビタミンの合缝子セットをコードしているなど, brown worm algae とのインターラクションにimportant と考えられる伝子群のexistent を明らかにした.バクテリアゲノムにコードされた伝子セットから Predictionされる分としてまとめた. The results of this study are the same, the albino symbiosis is difficult, the brown worm algae are difficult to cultivate, and the possibility of analysis is high.