Revealing the symbiotic mechanisms from useful metabolites of dinoflagellates in corals

揭示珊瑚中甲藻有用代谢物的共生机制

• 批准号: 20K05798
• 负责人: 將口 栄一
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K05798/
• 关键词: アルファプロテオバクテリア; 褐虫藻; ゲノム; マイコスポリン様アミノ酸; 遺伝子群の水平伝播; サンゴの白化; ビタミン; 二次代謝産物; 共生クロレラ; 共生バクテリア; 遺伝子の水平伝播; サンゴ白化現象; 高温耐性; 高温耐性褐虫藻のゲノム; 遺伝子クラスター; 光エネルギー; バクテリア; 共生; 渦鞭毛藻; クロレラ; 光酵素; 紫外線防御物質

昨年度までに褐虫藻ゲノム間の比較解析により、褐虫藻種間のインターラクションがサンゴの白化現象を分子レベルで解析していく上で重要であるかもしれないことを示唆する結果を得て、論文として報告することができた。一方で、褐虫藻とバクテリアのインターラクションが褐虫藻の増殖に重要であることが示唆されてきているが、サンゴや褐虫藻に共生するバクテリアは、そのほとんどが16S rRNA遺伝子による多様性の解析にとどまってきた。例えば、我々がゲノムを解読してきた褐虫藻4種の中で、白化に耐性のある褐虫藻Durusdinium trenchiiだけが抗生物質の存在下において増殖することができないことなどから、バクテリアとのインターラクションが重要であることが示唆されている。本研究において、サンゴに共生する褐虫藻4種の培養株に共在しているバクテリアの全ゲノム配列を決定し、公的データベースに登録した。その4種に共通のバクテリアは、培養が難しいとされてきたアルファプロテオバクテリアであった。しかしながら本研究ではその単離培養に成功した。4種のバクテリアのゲノムサイズは、2.9~3.9 Mbであった。2800~3800個の遺伝子をコードしており、褐虫藻が合成できないビタミンの合成遺伝子セットをコードしているなど、褐虫藻とのインターラクションに重要と考えられる遺伝子群の存在を明らかにした。バクテリアゲノムにコードされた遺伝子セットから予測される分子レベルのインターラクションを議論し、論文としてまとめた。本研究で得られた結果は、白化しやすいサンゴに共生し、培養の困難な褐虫藻を単離培養し、解析していく上で役に立つ可能性がある。

Yesterday annual ま で に worm in brown algae ゲ ノ ム の comparison between analytic に よ り, brown worms effects between の イ ン タ ー ラ ク シ ョ ン が サ ン ゴ の albino を molecular レ ベ ル で parsing し て い く で important で あ る か も し れ な い こ と を in stopping す る results を て, paper と し て report す る こ と が で き た. Party で, brown algae と バ ク テ リ ア の イ ン タ ー ラ ク シ ョ ン が worm in brown algae の raised colonization に important で あ る こ と が in stopping さ れ て き て い る が, サ ン ゴ や worm in brown algae に symbiotic す る バ ク テ リ ア は, そ の ほ と ん ど が traces of 16 s rRNA 伝 son に よ る multiple others の parsing に と ど ま っ て き た. Example: えば. I 々がゲノムを solve 読 て た た た among the four species of brown algae, で and albino に tolerant ある brown algae Durusdinium Presence of trenchii だ け が antibiotic substances の に お い て raised colonization す る こ と が で き な い こ と な ど か ら, バ ク テ リ ア と の イ ン タ ー ラ ク シ ョ ン が important で あ る こ と が sucking in さ れ て い る. This study に お い て, サ ン ゴ に symbiotic す る worm in brown algae four の cultivation strains に altogether in し て い る バ ク テ リ ア の full ゲ ノ ム column を decided し, male デ ー タ ベ ー ス に login し た. Four common に そ の の バ ク テ リ ア は, cultivate が し い と さ れ て き た ア ル フ ァ プ ロ テ オ バ ク テ リ ア で あ っ た. <s:1> ながら ながら in this study, で そ そ そ 単 単 successfully cultivated に た た. Four types: バ テリア テリア ゲノムサ ゲノムサ ズ ズ テリア, 2.9 to 3.9 Mbであった. 2800 ~ 3800 の posthumous son 伝 を コ ー ド し て お り, brown algae が synthetic で き な い ビ タ ミ ン の synthetic heritage 伝 son セ ッ ト を コ ー ド し て い る な ど, brown algae と の イ ン タ ー ラ ク シ ョ ン に important と exam え ら れ る heritage 伝 subgroup の exist を Ming ら か に し た. バ ク テ リ ア ゲ ノ ム に コ ー ド さ れ た posthumous son 伝 セ ッ ト か ら be さ れ る molecular レ ベ ル の イ ン タ ー ラ ク シ ョ ン を comment し, paper と し て ま と め た. This study で have ら れ た results は, albino し や す い サ ン ゴ に し symbiosis, cultivating の difficult な worm in brown algae を 単 from cultivating し, parsing し て い く つ stands に で service on possibility が あ る.

项目成果

褐虫藻種間における遺伝子水平伝播の可能性

虫黄藻物种之间水平基因转移的可能性

• 发表时间: 2022
• 作者: Hayashi Masafumi;Keyamura Kenji;Yoshida Asami;Ariyoshi Mariko;Akanuma Genki;Hishida Takashi;將口栄一
• 通讯作者: 將口栄一

サンゴ共生渦鞭毛藻間におけるUV吸収物質生合成遺伝子群の水平伝播

珊瑚共生甲藻中紫外线吸收物质生物合成基因的水平传播

• 发表时间: 2022
• 作者: Komine-Abe Ayano;Kondo Naoko;Kubo Shosei;Kawasaki Hisashi;Nishiyama Makoto;Kosono Saori;將口栄一
• 通讯作者: 將口栄一