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Improving efficiency of sequence databases by applying the NAF format

应用NAF格式提高序列数据库的效率

基本信息

批准号：
20K06612
负责人：
Kryukov Kirill
金额：
$ 2.75万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K06612/
关键词：
Data compression NAF GenomeSync Genome database DNA compression Sequence analysis

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（15）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

ナノポアDNAシークエンサーを用いた迅速な細菌同定法

使用纳米孔DNA测序仪的快速细菌鉴定方法

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
臨床化学
影响因子：
0
作者：
Higaki K;Yamanaka S;Iwata K;Sato Y;Takaya D;Honma T;Tokunaga F;Takahashi H;Sawasaki T;大野　歩,　中川　草,　Kirill Kryukov,　今西　規
通讯作者：
大野　歩,　中川　草,　Kirill Kryukov,　今西　規

Sequence Data Compression. History, methods, best practices, perspectives.

序列数据压缩。

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
高橋宏隆,　重松裕樹，鈴木康嗣;渡辺幸三;鈴木陽一，Subhash G. Vasudevan;澤崎達也;Kirill Kryukov
通讯作者：
Kirill Kryukov

GenomeSync and GSTK: Toolkit for precision analysis of medical metagenome sequence data

GenomeSync 和 GSTK：用于精确分析医学宏基因组序列数据的工具包

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
高橋宏隆,　重松裕樹，鈴木康嗣;渡辺幸三;鈴木陽一，Subhash G. Vasudevan;澤崎達也;Kirill Kryukov;高橋宏隆，山中聡士，桒田翔平，檜垣佳奈，佐藤裕介，深井周也，徳永文稔，澤崎達也。;高橋宏隆;Kirill Kryukov
通讯作者：
Kirill Kryukov

Diagnosis of pleural empyema/parapneumonic effusion by next-generation sequencing

DOI：
10.1080/23744235.2021.1892178
发表时间：
2021-02-18
期刊：
INFECTIOUS DISEASES
影响因子：
5.8
作者：
Shiraishi, Yoshiki;Kryukov, Kirill;Asano, Koichiro
通讯作者：
Asano, Koichiro

Nanopore sequencing data analysis of 16S rRNA genes using GenomeSync-GSTK system

使用GenomeSync-GSTK系统对16S rRNA基因进行纳米孔测序数据分析

DOI：
10.1007/978-1-0716-2996-3_15
发表时间：
2023
期刊：
Methods in Molecular Biology
影响因子：
0
作者：
Kirill Kryukov;Tadashi Imanishi;So Nakagawa
通讯作者：
So Nakagawa

DOI：
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作者：
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Kryukov Kirill其他文献

NBRP細胞性粘菌事業とその利用

NBRP细胞粘菌业务及其利用

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发表时间：
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影响因子：
0
作者：
Tenno Mari;Shiroguchi Katsuyuki;Muroi Sawako;Kawakami Eiryo;Koseki Keita;Kryukov Kirill;Imanishi Tadashi;Ginhoux Florent;Taniuchi Ichiro;上村陽一郎
通讯作者：
上村陽一郎

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DOI：
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影响因子：
0
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Komiya Shinnosuke;Matsuo Yoshiyuki;Nakagawa So;Morimoto Yoshiharu;Kryukov Kirill;Okada Hidetaka;Hirota Kiichi;冨田秀太
通讯作者：
冨田秀太

次世代シーケンサーを用いたアレルギー性気管支肺真菌症の原因真菌解析

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DOI：
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期刊：
影响因子：
0
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通讯作者：
浅野浩一郎

Diverse mosquito-specific flaviviruses in the Bolivian Amazon basin

玻利维亚亚马逊河流域的多种蚊子特异性黄病毒

DOI：
10.1099/jgv.0.001518
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2021
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Journal of General Virology
影响因子：
3.8
作者：
Orba Yasuko;Matsuno Keita;Nakao Ryo;Kryukov Kirill;Saito Yumi;Kawamori Fumihiko;Loza Vega Ariel;Watanabe Tokiko;Maemura Tadashi;Sasaki Michihito;Hall William W.;Hall Roy A.;Pereira Juan Antonio;Nakagawa So;Sawa Hirofumi
通讯作者：
Sawa Hirofumi

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利根川水系中外来鳗鱼的分布状况

DOI：
发表时间：
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期刊：
影响因子：
0
作者：
Tenno Mari;Shiroguchi Katsuyuki;Muroi Sawako;Kawakami Eiryo;Koseki Keita;Kryukov Kirill;Imanishi Tadashi;Ginhoux Florent;Taniuchi Ichiro;上村陽一郎;荒井考磨，板倉光，米田彬史，吉永龍起，海部健三，木村伸吾
通讯作者：
荒井考磨，板倉光，米田彬史，吉永龍起，海部健三，木村伸吾