A basic development of the next-generation special-purpose computer system for molecular dynamics simulations

下一代分子动力学模拟专用计算机系统的基础研制

• 批准号: 19H01107
• 负责人: Taiji Makoto
• 金额: $ 28.62万
• 依托单位: Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19H01107/
• 关键词: 専用計算機; 分子動力学計算; 高性能計算; コデザイン; システムオンチップ; システムLSI; 領域特化型プロセッサ

项目成果

Hardware Acceleration of Tensor-Structured Multilevel Ewald Summation Method on MDGRAPE-4A, a Special-Purpose Computer System for Molecular Dynamics Simulations

• DOI: 10.1145/3458817.3476190
• 发表时间: 2021-11
• 期刊: SC21: International Conference for High Performance Computing, Networking, Storage and Analysis
• 作者: G. Morimoto;Yohei M. Koyama;Hao Zhang;T. Komatsu;Y. Ohno;Keigo Nishida;Itta Ohmura;H. Koyama;M. Taiji

Molecular dynamics study of the dimeric SARS-CoV-2 main protease with 7 HIV inhibitors

二聚体 SARS-CoV-2 主要蛋白酶与 7 种 HIV 抑制剂的分子动力学研究

• 发表时间: 2021
• 作者: Morimoto Gentaro;Koyama Yohei M.;Zhang Hao;Komatsu Teruhisa S.;Ohno Yousuke;Nishida Keigo;Ohmura Itta;Koyama Hiroshi;Taiji Makoto;森本 元太郎;小松 輝久
• 通讯作者: 小松 輝久

RISC-V Dedicated High-Performance Computers for Designing Medicine

用于医学设计的 RISC-V 专用高性能计算机

• 发表时间: 2020
• 作者: Morimoto Gentaro;Koyama Yohei M.;Zhang Hao;Komatsu Teruhisa S.;Ohno Yousuke;Nishida Keigo;Ohmura Itta;Koyama Hiroshi;Taiji Makoto;森本 元太郎;小松 輝久;泰地 真弘人;泰地 真弘人
• 通讯作者: 泰地 真弘人

MDGRAPE-4Aシステムの運用と性能評価

MDGRAPE-4A系统运行和性能评估

• 发表时间: 2019
• 作者: Morimoto Gentaro;Koyama Yohei M.;Zhang Hao;Komatsu Teruhisa S.;Ohno Yousuke;Nishida Keigo;Ohmura Itta;Koyama Hiroshi;Taiji Makoto;森本 元太郎;小松 輝久;泰地 真弘人;泰地 真弘人;泰地 真弘人;泰地 真弘人;森本 元太郎;森本 元太郎
• 通讯作者: 森本 元太郎

医薬を設計するための専用高性能RISC-Vコンピュータ

用于药物设计的专用高性能 RISC-V 计算机

• 发表时间: 2020
• 作者: Morimoto Gentaro;Koyama Yohei M.;Zhang Hao;Komatsu Teruhisa S.;Ohno Yousuke;Nishida Keigo;Ohmura Itta;Koyama Hiroshi;Taiji Makoto;森本 元太郎;小松 輝久;泰地 真弘人
• 通讯作者: 泰地 真弘人