多様な芳香族化合物を取り込む細菌外膜トランスポーターの同定とその物質生産への応用
多様な芳香族化合物を取り込む細菌外膜トランスポーターの同定とその物質生産への応用
批准号:
19J11312
负责人:
藤田 雅也
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-25 至 2021-03-31
中文摘要
プロトカテク酸(PCA)、シリンガ酸(SA)、フェルラ酸(FA)によりそれぞれ転写誘導を受けるTonB-dependent transporter (TBDT)様遺伝子の破壊株について、当該基質の変換能と生育能を測定したが、破壊により変換能と生育能が低下するTBDT様遺伝子は見受けられなかった。リグニン由来芳香族化合物の取り込みに関与するTonB-ExbB-ExbD複合体(Ton複合体)の成分を明らかにするために、まずSYK-6株が有する6つのtonB様遺伝子のうち、遺伝子破壊株を取得できないtonB1と、鉄の取り込みに関与するtonB2を除く、tonB3-6の単独破壊株、および多重破壊株のリグニン由来芳香族化合物(11種類)の変換能と生育能を評価したが、これらの破壊株の変換能、生育能は野生株と同等であった。SYK-6株が3つずつ有するexbB、exbD様遺伝子のうち、exbB2/tolQ、exbD3/tolRは外膜構造の安定化に関与することが示された。遺伝子破壊株が取得できないtonB1-exbB1-exbD1-exbD2(tonB1オペロン遺伝子)については、プラスミドによりSYK-6株で高発現させた場合に、PCA、SA、FAを含む7種類のリグニン由来芳香族化合物の変換能が向上したため、取り込みへの関与が強く示唆された。5,5’-dehydrodivanillateを取り込むTBDTであるDdvTの生化学的な解析を行うために、精製タンパク質の取得を試みた。ddvTをプラスミドで大腸菌BL21(DE3)に導入し発現させたところ、DdvTが封入体を形成したため、尿素を用いたrefoldingによる封入体からの精製を試みた。その結果、size-exclusion chromatographyにより単分散のピークが確認されたため、封入体からDdvTを精製することに成功した。
英文摘要
プロトカテク酸(PCA)、シリンガ酸(SA)、フェルラ酸(FA)によりそれぞれ転写誘導を受けるTonB-dependent transporter (TBDT)様遺伝子の破壊株について、当該基質の変換能と生育能を測定したが、破壊により変換能と生育能が低下するTBDT様遺伝子は見受けられなかった。リグニン由来芳香族化合物の取り込みに関与するTonB-ExbB-ExbD複合体(Ton複合体)の成分を明らかにするために、まずSYK-6株が有する6つのtonB様遺伝子のうち、遺伝子破壊株を取得できないtonB1と、鉄の取り込みに関与するtonB2を除く、tonB3-6の単独破壊株、および多重破壊株のリグニン由来芳香族化合物(11種類)の変換能と生育能を評価したが、これらの破壊株の変換能、生育能は野生株と同等であった。SYK-6株が3つずつ有するexbB、exbD様遺伝子のうち、exbB2/tolQ、exbD3/tolRは外膜構造の安定化に関与することが示された。遺伝子破壊株が取得できないtonB1-exbB1-exbD1-exbD2(tonB1オペロン遺伝子)については、プラスミドによりSYK-6株で高発現させた場合に、PCA、SA、FAを含む7種類のリグニン由来芳香族化合物の変換能が向上したため、取り込みへの関与が強く示唆された。5,5’-dehydrodivanillateを取り込むTBDTであるDdvTの生化学的な解析を行うために、精製タンパク質の取得を試みた。ddvTをプラスミドで大腸菌BL21(DE3)に導入し発現させたところ、DdvTが封入体を形成したため、尿素を用いたrefoldingによる封入体からの精製を試みた。その結果、size-exclusion chromatographyにより単分散のピークが確認されたため、封入体からDdvTを精製することに成功した。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1038/s42003-019-0676-z
发表时间:
2019-11-22
期刊:
COMMUNICATIONS BIOLOGY
影响因子:
5.9
作者:
[Fujita, Masaya, Mori, Kosuke, Masai, Eiji]
通讯作者:
Masai, Eiji
DOI:
10.1038/s41598-020-68984-2
发表时间:
2020-07-22
期刊:
SCIENTIFIC REPORTS
影响因子:
4.6
作者:
[Fujita, Masaya, Sakumoto, Taichi, Masai, Eiji]
通讯作者:
Masai, Eiji
Iron acquisition pathways essential for the catabolism of lignin-derived aromatics in Sphingobium sp. SYK-6
鞘氨醇菌中木质素衍生芳香族化合物的分解代谢所必需的铁获取途径。
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masaya Fujita, Taichi Sakumoto, Kenta Tanatani, Naofumi Kamimura, Eiji Masai]
通讯作者:
Eiji Masai
細菌を用いた植物由来芳香族からの物質生産を実現するための外膜トランスポーター研究
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批准号:22KJ3121
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$3.08万
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财政年份:2023
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负责人:藤田 雅也
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依托单位:
植物由来芳香族からの効率的な有価物生産のための細菌トランスポーターデザイン
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批准号:22K14821
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2022
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负责人:藤田 雅也
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依托单位:
ピロリ菌に直接効果のある物質の簡易調製
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批准号:24550202
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.58万
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财政年份:2012
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负责人:藤田 雅也
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依托单位:
海外基金