細菌を用いた植物由来芳香族からの物質生産を実現するための外膜トランスポーター研究

外膜转运蛋白研究，利用细菌实现植物芳香族化合物的物质生产

• 批准号: 22KJ3121
• 负责人: 藤田 雅也
• 金额: $ 3.08万
• 依托单位: High Energy Accelerator Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ3121/
• 关键词: リグニン; 細菌外膜; トランスポーター; 外膜トランスポーター

今年度は、300 kVのクライオ電顕を用いて、TonB-dependent transporter (TBDT)の単粒子解析を行った。その結果、5オングストローム程度の構造が得られ、現在高分解能構造の取得に向けて解析中である。得られた構造には、TBDTに特徴的な構造であるベータバレル構造、バレル内部を占有するプラグドメインが確認できた。また、等温滴定型熱量測定により、TBDTとTonBとの相互作用を検出することに成功した。また、変異体の解析により、TBDTのN末端領域の2残基がTonBとの相互作用に必須であることが明らかになった。これらの成果については、2件の国内学会で発表した。

This year, 300 kV power supply, TonB-dependent transmitter (TBDT) and single particle analysis were performed. The results show that the structure of 5 kinds of structures is obtained, and the structure of high decomposition energy is obtained. The structure of TBDT is confirmed by the structure of TBDT. Isothermal titration calorimetry, TBDT and TonB interaction were successfully performed. The interaction between the two residues in the N-terminal domain of TBDT and TonB is necessary. The results of this study were published in the Chinese Academy of Sciences.

项目成果

Functional roles of multiple Ton complex genes in a <i>Sphingobium</i> degrader of lignin-derived aromatic compounds

多个 Ton 复合物基因在木质素衍生芳香族化合物<i>Sphingobium</i>降解剂中的功能作用

• DOI: 10.1101/2021.08.06.455174
• 发表时间: 2021
• 期刊: bioRxiv
• 作者: Fujita Masaya;Yano Shodai;Shibata Koki;Kondo Mizuki;Hishiyama Shojiro;Kamimura Naofumi;Masai Eiji
• 通讯作者: Masai Eiji

Sphingobium sp. SYK-6株の外膜におけるフェニルクマラン型化合物取り込みシステムの解明

鞘氨醇 SYK-6 菌株外膜中苯基香豆素型化合物摄取系统的阐明。

• 发表时间: 2022
• 作者: 藤田 雅也;柴田 昴輝;田辺 幹雄;千田 俊哉;上村 直史;政井 英司
• 通讯作者: 政井 英司

Sphingomonad科細菌の細胞外膜における植物由来芳香族化合物取り込みメカニズムの解明

阐明鞘氨醇单胞菌细胞外膜对植物来源芳香化合物的摄取机制

• 发表时间: 2023
• 作者: 藤田 雅也;柴田 昴輝;菱山 正二郎;田辺 幹雄;千田 俊哉;上村 直史;政井 英司
• 通讯作者: 政井 英司