雌に多型のあるアオモンイトトンボにおける雄擬態の遺伝的基盤とその進化機構

アオモンイトトンボにおいてdoublesex（dsx）遺伝子のRNAiを行ったところ、オスやオス型メスの体色の一部がメス型メスに似た体色を示した。さらにdsxのRNAiによって体色が変化した領域で、昆虫の体色に関わるblackとebony遺伝子の発現量を比較したところ、体色が変化していない領域よりも発現量が増加していた。このことから本種ではdsxがblackやebony遺伝子の発現を制御することで雌多型の体色を制御していることが予想される。dsxのスプライスバリアントを制御する遺伝子を探索するために、ショウジョウバエでそれを担うtra2遺伝子のRNAiを本種で行ったが、体色の変化は見られなかった。本種の雌の型を決定する対立遺伝子を探索するために、全ゲノム配列を用いた解析を行った。沖縄とつくばで採集した野外のオス型雌とメス型雌をそれぞれpoolしてシークエンスしたデータから検出されたアリル頻度を用いて、遺伝的距離を表すFSTや選択の指標であるTajima’ Dを計算した。しかし、雌多型を支配する対立遺伝子は推定されなかった。そのため、次に全ゲノム配列の精度を上げることにした。昨年度までに読んだpaired-endやmate-pairのリードに加え、さらにpaired-endのリードとPacBioのロングリードを読んだ。Platanus2を用いてde novoアセンブリを行ったところ、N50が1.4MbpかつBUSCOが96.5%の高精度ゲノムを作成できた。さらに、アリル頻度解析をするために金沢と福井集団においてpool-seqのデータを追加し、解析を行ったが雌多型を決定する対立遺伝子は発見できなかった。

アオモンイトトンボにおいてdoublesex（dsx）遺伝子のRNAiを行ったところ、オスやオス型メスの体色の一部がメス型メスに似た体色を示した。さらにdsxのRNAiによって体色が変化した領域で、昆虫の体色に関わるblackとebony遺伝子の発現量を比較したところ、体色が変化していない領域よりも発現量が増加していた。このことから本種ではdsxがblackやebony遺伝子の発現を制御することで雌多型の体色を制御していることが予想される。dsxのスプライスバリアントを制御する遺伝子を探索するために、ショウジョウバエでそれを担うtra2遺伝子のRNAiを本種で行ったが、体色の変化は見られなかった。本種の雌の型を決定する対立遺伝子を探索するために、全ゲノム配列を用いた解析を行った。沖縄とつくばで採集した野外のオス型雌とメス型雌をそれぞれpoolしてシークエンスしたデータから検出されたアリル頻度を用いて、遺伝的距離を表すFSTや選択の指標であるTajima’ Dを計算した。しかし、雌多型を支配する対立遺伝子は推定されなかった。そのため、次に全ゲノム配列の精度を上げることにした。昨年度までに読んだpaired-endやmate-pairのリードに加え、さらにpaired-endのリードとPacBioのロングリードを読んだ。Platanus2を用いてde novoアセンブリを行ったところ、N50が1.4MbpかつBUSCOが96.5%の高精度ゲノムを作成できた。さらに、アリル頻度解析をするために金沢と福井集団においてpool-seqのデータを追加し、解析を行ったが雌多型を決定する対立遺伝子は発見できなかった。