魚類腸管におけるインターロイキン17を介した抗菌分子産生機構の解明
魚類腸管におけるインターロイキン17を介した抗菌分子産生機構の解明
批准号:
19J14996
负责人:
岡村 洋
金额:
$1.09万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-25 至 2021-03-31
中文摘要
IL-17受容体A1 (RA1)遺伝子において、CRISPR-Cas9法を用い遺伝子改変(KO)メダカを作製した。作製した変異メダカ系統は、メダカil17ra1のエクソン1から7にかけておおよそ5.4kbの領域を欠損する系統であり、これにより推定アミノ酸レベルでは、細胞外のリガンド結合ドメインのほとんどを消失する系統である。次にRNA-seqを用いた網羅的なトランスクリプトーム解析を行い、野生型との遺伝子発現パターンを比較した。その結果、IL-17RA1-KOメダカは、腸管前半部における脂質代謝関連遺伝子群の発現が低下しており、クラスター解析の結果、特にメバロン酸代謝に関与する遺伝子群の発現が一様に低下していることが明らかとなった。さらにこの代謝関連遺伝子群の減弱に加え、il17a/f1, il17c, rorcといったIL-17経路関連遺伝子群の発現に関しても有意に減少していた。これらから、魚類IL-17経路が腸管において、免疫関連遺伝子だけでなく代謝関連遺伝子群の発現誘導に対しても関与することが示唆された。さらに、IL-17RA1-KOメダカ腸管前半部及び後半部における16S細菌叢メタゲノム解析を行い、野生型メダカとの細菌叢の比較を行った。Uni-Frac解析の結果、IL-17RA1-KOメダカの腸管前半部では、野生型とは有意に異なる細菌叢の多様性を示した。一方腸管後半部においては、Il-17RA1-KOメダカにおいて日和見感染原因菌であるPlesiomonas shigelloidesの細菌叢組成に占める割合が有意に増加しており、この結果は、前年度実施したIL-17A/F1-KOメダカにおける腸内細菌叢解析と共通した結果である。以上から、IL-17RA1-KOにおいても野生型とは細菌叢が変化しており、il17ra1が腸内細菌叢制御において重要である可能性が示された。
英文摘要
IL-17受容体A1 (RA1)遺伝子において、CRISPR-Cas9法を用い遺伝子改変(KO)メダカを作製した。作製した変異メダカ系統は、メダカil17ra1のエクソン1から7にかけておおよそ5.4kbの領域を欠損する系統であり、これにより推定アミノ酸レベルでは、細胞外のリガンド結合ドメインのほとんどを消失する系統である。次にRNA-seqを用いた網羅的なトランスクリプトーム解析を行い、野生型との遺伝子発現パターンを比較した。その結果、IL-17RA1-KOメダカは、腸管前半部における脂質代謝関連遺伝子群の発現が低下しており、クラスター解析の結果、特にメバロン酸代謝に関与する遺伝子群の発現が一様に低下していることが明らかとなった。さらにこの代謝関連遺伝子群の減弱に加え、il17a/f1, il17c, rorcといったIL-17経路関連遺伝子群の発現に関しても有意に減少していた。これらから、魚類IL-17経路が腸管において、免疫関連遺伝子だけでなく代謝関連遺伝子群の発現誘導に対しても関与することが示唆された。さらに、IL-17RA1-KOメダカ腸管前半部及び後半部における16S細菌叢メタゲノム解析を行い、野生型メダカとの細菌叢の比較を行った。Uni-Frac解析の結果、IL-17RA1-KOメダカの腸管前半部では、野生型とは有意に異なる細菌叢の多様性を示した。一方腸管後半部においては、Il-17RA1-KOメダカにおいて日和見感染原因菌であるPlesiomonas shigelloidesの細菌叢組成に占める割合が有意に増加しており、この結果は、前年度実施したIL-17A/F1-KOメダカにおける腸内細菌叢解析と共通した結果である。以上から、IL-17RA1-KOにおいても野生型とは細菌叢が変化しており、il17ra1が腸内細菌叢制御において重要である可能性が示された。
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Establishment of interleukin 17 receptor A (RA) deficient medaka (Oryzias latipes) using CRISPR-Cas9 system
使用 CRISPR-Cas9 系统建立白介素 17 受体 A (RA) 缺陷青鳉 (Oryzias latipes)
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[菊谷侑平, 佐々木謙一, 岩崎陽平, 渡邉奎, 谷津陽一, 松永三郎, 市川遥, Yo Okamura]
通讯作者:
Yo Okamura
メダカにおけるインターロイキン17受容体A1を介した腸内細菌叢制御機構の解明
阐明青鳉鱼中白细胞介素 17 受体 A1 介导的肠道微生物群控制机制
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[北島大夢, 北野和哉, 櫛田貴弘, 田中賢一郎, 久保尋之, 舩冨卓哉, 向川康博, 岡村洋・宮西 弘(宮崎大農)・木下政人(京都大農) ・河野智哉・酒井正博・引間順一(宮崎大農)]
通讯作者:
岡村洋・宮西 弘(宮崎大農)・木下政人(京都大農) ・河野智哉・酒井正博・引間順一(宮崎大農)
Metagenome analysis of intestinal flora in the IL-17A/F1-knockout medaka
IL-17A/F1 敲除青鳉肠道菌群的宏基因组分析
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kunihiko Shizume, Naoyuki Hatada, Shoko Yasui, Tetsuya Uda, Yo Okamura]
通讯作者:
Yo Okamura
DOI:
10.3389/fimmu.2020.00425
发表时间:
2020-03-17
期刊:
FRONTIERS IN IMMUNOLOGY
影响因子:
7.3
作者:
[Okamura, Yo, Morimoto, Natsuki, Hikima, Jun-ichi]
通讯作者:
Hikima, Jun-ichi
新規免疫賦活剤投与法の開発を目的とした魚類腸管が持つ独自の異物取り込み機構の解明
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批准号:21J00595
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$3.08万
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财政年份:2021
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负责人:岡村 洋
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依托单位:
海外基金