エビのゲノムに残された化石ウイルスを復活させる

复活虾基因组中留下的化石病毒

• 批准号: 19J21518
• 负责人: 川戸 智
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: Tokyo University of Marine Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-25 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19J21518/
• 关键词: クルマエビ; WSSV; 内在性ウイルス配列; ニマウイルス科; トランスポゾン; ゲノム; PRDV; PAV; EVE; 内在性ウイルス様配列; シラエビ

本年度は甲殻類の内在性ウイルス配列探索と解析を中心に行った。甲殻類複数種の全ゲノムショットガンシーケンスを行い、甲殻類ゲノム中の内在性ウイルス配列を計22本得た。比較解析の結果、宿主ゲノム中への組み込みはニマウイルス科内で広く生じており、とりわけクルマエビ類の内在性ウイルスからなる系統がニマウイルス科でもっとも初期に分岐したことが分かった。内在性ニマウイルスは、甲殻類ゲノム中の反復領域に選択的に組み込まれており、また宿主から獲得した複数の遺伝子をイントロンを保持したまま保有していた。ニマウイルス科の姉妹群とみられる、陸生甲殻類から見出されたウイルス配列も、クルマエビ類の内在性ウイルスと類似した特徴を示した。このことから、宿主ゲノム中への組み込みはニマウイルス科の祖先から受け継がれた性質であることが示唆された。以上のことを踏まえると、甲殻類ゲノム中の内在性ニマウイルスは、宿主ゲノム中に自らを挿入し、親から子へ垂直伝播することで自己複製を図る、トランスポゾンに似たライフスタイルをとっていると考えられた。

This year's crustacean intrinsic nature of the search and analysis of the center line The total number of crustacean species is 22, and the intrinsic number of crustacean species is 22. Comparing the results of the analysis, the host must be able to distinguish between the initial and the initial stages of the system. Inherent, crustacean, multiple domain selection The characteristics of terrestrial crustaceans are shown in this paper. This is the first time that a person has ever been involved in a relationship with another person. The above mentioned crustaceans have inherent characteristics, such as self-reproduction, self-reproduction and self-reproduction.

项目成果

オオグソクムシ Bathynomus doederleini のミトコンドリアゲノム配列

Bathynomus doederleini 线粒体基因组序列

• 发表时间: 2020
• 作者: 川戸智;野崎玲子;近藤秀裕;廣野育生
• 通讯作者: 廣野育生

クルマエビのドラフトゲノム

虾基因组草图

• 发表时间: 2021
• 作者: Komatsuzaki Ayane;Hoshino Atsushi;Otagaki Shungo;Matsumoto Shogo;Shiratake Katsuhiro;川戸智・西辻光希・有本飛鳥・久田香奈子・川満真由美・野崎玲子・近藤秀裕・新里宙也・大平剛・佐藤矩行・將口栄一・廣野育生
• 通讯作者: 川戸智・西辻光希・有本飛鳥・久田香奈子・川満真由美・野崎玲子・近藤秀裕・新里宙也・大平剛・佐藤矩行・將口栄一・廣野育生

日本産チョウ (ウオジラミ) Argulus japonicusの分子解析

日本蝴蝶的分子分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 川戸智;西辻光希;有本飛鳥;久田香奈子;川満真由美;野崎玲子;近藤秀裕;新里宙也;大平剛;佐藤矩行;將口栄一;廣野育生;川戸智・野崎玲子・横田昌樹・原川明宏・廣野育生・近藤秀裕
• 通讯作者: 川戸智・野崎玲子・横田昌樹・原川明宏・廣野育生・近藤秀裕

Genomic footprints unveil the evolution of obscure crustacean virus family

基因组足迹揭示了不起眼的甲壳类病毒家族的进化

• 发表时间: 2019
• 作者: Soyon Park;Kohki Shimizu;Jocelyn Brown;Koh Aoki;James Westwood;Satoshi Kawato，Reiko Nozaki，Hidehiro Kondo，Ikuo Hirono
• 通讯作者: Satoshi Kawato，Reiko Nozaki，Hidehiro Kondo，Ikuo Hirono

Phylogenetic Analysis with Complete Mitochondrial Genome Sequences of <i>Benedenia seriolae</i> Specimens Derived from Japanese <i>Seriola</i> spp.

日本鰤鱼贝尼登虫</i>标本完整线粒体基因组序列的系统发育分析。

• DOI: 10.3147/jsfp.54.27
• 发表时间: 2019
• 期刊: Fish Pathology
• 影响因子: 0.6
• 作者: Kawato Satoshi;Kobayashi Keigo;Shirakashi Sho;Yanagi Soetsu;Fukuda Yutaka;Yamashita Hirofumi;Nozaki Reiko;Hirono Ikuo;Kondo Hidehiro
• 通讯作者: Kondo Hidehiro