クルマエビゲノムに眠る大型DNAウイルスが暴走すると何が起こるのか

当沉睡在虾基因组中的大型 DNA 病毒失控时会发生什么？

• 批准号: 22KJ3202
• 负责人: 川戸 智
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases (2023)Fisheries Research and Education Agency (2022)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ3202/
• 关键词: クルマエビ; WSSV; 内在性ウイルス配列; ニマウイルス科

MjeNMVの宿主ゲノム組み込みに関与していると考えられるチロシンリコンビナーゼ (MjeNMV-YR) のクローニングを試みた。MjeNMV-YRは卵巣で微弱に発現しており、イントロンを含んでいた。RACE-PCRにより転写産物の全長配列を得たところ、過半数のクローンは3'末端が終止コドンの前にあった。このことは、転写産物の少なさに加えてtruncateな転写産物が大多数を占めることが、MjeNMVの活性抑制に寄与していることを示唆した。熱ストレスに応答してMjeNMVの遺伝子発現が上昇するか検討するため、クルマエビの高温負荷ストレス実験を行い、精巣および卵巣のRNA-seqを行った。供試個体の一部が斃死するほどの高度なストレスを課したにもかかわらず、実験前後で生殖腺の遺伝子発現に違いはなかった。クルマエビ類ではない十脚甲殻類三種のショットガンシーケンシングを行い、新規の内在性ニマウイルス2種および新たな科に相当すると考えられる内在性大型DNAウイルス計4種を発見した。系統解析の結果、新奇の内在性ニマウイルスのうち一つはPemonivirus属の一員であり、もう一方は新規の属を構成すると考えられた。Pemonivirus属はこれまでクルマエビ類のみから見つかっており、同ウイルス属の宿主域は従来考えられていたよりも広いことが分かった。新たな科を構成する内在性大型DNAウイルスは、公共データベース上の甲殻類のシーケンスデータからも発見され、核酸合成や宿主ゲノムへの組み込みに関わると予想される酵素やper os infectivity factors (PIFs) を中心とする20個程度の遺伝子を共有していた。PIFsやRNAポリメラーゼ遺伝子の存在は、節足動物に感染する大型二本鎖DNAウイルスが属するナルダウイルス綱のレファウイルス目にこれらのウイルスが属することを示唆した。

MjeNMV's host must set up a group to test the relationship between MjeNMV-YR and MjeNMV. MjeNMV-YR has a weak presence. RACE-PCR was used to sequence the full length of the product, and more than half of the products were terminated at the 3'end. However, there are few writing products, and the majority of writing products are truncated. This shows that the inhibition of MjeNMV activity is a major factor. MjeNMV gene expression increases during thermal stress, and RNA-seq increases during thermal stress. A portion of the test subject was found dead, and the height of the gonad was measured before and after the test. Three species of crustaceans were found to be intrinsic to the new species, and four species were found to be intrinsic to the new species The result of system analysis, novelty and immanence of Pemonivirus is that it is a member of Pemonivirus genus and a member of Pemonivirus genus. Pemonivirus belongs to the genus The new family is composed of intrinsic large DNA molecules, public molecules, crustaceans, nucleic acid synthesis, host cells, and enzymes per os infectivity factors (PIFs). The presence of PIFs and RNA fragments in arthropods and the presence of large DNA fragments in arthropods indicate the presence of DNA fragments in arthropods.

项目成果

クルマエビ高成長マーカー候補遺伝子

车马虾高生长标记候选基因

• 发表时间: 2023
• 作者: Takuya Hidaka;Ganesh Namasivayam Pandian;Toshikazu Bando;Hiroshi Sugiyama;Takuya Hidaka;川戸 智・安池元重・米加田 徹・菅谷琢磨
• 通讯作者: 川戸 智・安池元重・米加田 徹・菅谷琢磨