Dynamics of RNA-protein complex in homologous chromosome pairing
同源染色体配对中RNA-蛋白质复合物的动力学
基本信息
- 批准号:19K06503
- 负责人:
- 金额:$ 2.75万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2019
- 资助国家:日本
- 起止时间:2019-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
相同染色体の対合は親世代から承け継いだ相同染色体が互いを見つけて接着する過程で、正常な対合が相同組換えに不可欠である。相同染色体の相互認識と対合の分子機構を解明するのが本研究課題の究極な目的である。これまでの研究で、染色体上に滞留するlncRNAが相同染色体の相互認識の鍵であることが示唆された。lncRNAを染色体に引き留めるには、Smpタンパク質と呼ばれる複数な転写終結因子が必要である。lncRNAとSmpタンパク質が液液相分離によってドロップレットを形成する。異種類のlncRNAを持つドロップレットが互いに融合できず、同種類のlncRNAを持つドロップレットのみ互いに融合し結果として染色体の対合を促進することから、RNAが対合の特異性を決めることが示唆された。RNA配列とタンパク質の種類によって、どのようにドロップレットの性質が変わるかを解析するために、試験管内にドロップレットを再構成することを試みた。その結果、Smpタンパク質のうち、Seb1タンパク質単独でも相分離し、試験管内にドロップレットを形成できることが分かった。Seb1タンパク質にRNAを10nM程度加えると、Seb1ドロップレットの形成が大きく促進されて、しかもRNAがドロップレットに濃縮される。Seb1-RNAドロップレットをFARP (光褪色後蛍光回復法)で解析すると、異なるRNA種類を含むドロップレットが異なるFRAPプロファイルを示すことから、RNAの種類によってドロップレットの物理化学性質を決定されることが分かった。さらに、同じRNAを含むドロップレット同士がお互い融合しやすい傾向を示すことから、相同染色体相互認識のメカニズムが転写されるRNAとSeb1などSmpタンパク質から作られる染色体上のドロップレットが大きいな役割を果たすことがほぼ確実になった。現在発表論文を執筆中。
The same chromosome pairing is not allowed to occur in the same generation. Understanding the molecular mechanism of homologous chromosomes is the ultimate goal of this study. This study is aimed at identifying the key to mutual recognition of the same chromosome by lncRNA on chromosomes. lncRNA is a complex termination factor. lncRNA and Smp are the main components of liquid phase separation. IncRNAs of different species are fused to each other, while those of the same species are fused to each other. As a result, chromosome alignment is promoted, and the specificity of RNA alignment is determined. RNA alignment and quality of the species, the nature of the species, the analysis of the species, and the reconstruction of the species in the tube. The results of the test are as follows: 1. The quality of the test tube is separated from the quality of the test tube. Seb1 RNA was concentrated at 10nM to promote the formation of Seb1 RNA. Seb1-RNA is analyzed by FRAP (Fading Recovery after Photobleaching), and the RNA species are determined by FRAP. In addition, the same RNA contains the same chromosome, and the same chromosome has the same tendency to fuse with each other. In addition, the same chromosome has the same tendency to recognize each other. Now I am writing my thesis.
项目成果
期刊论文数量(17)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Histone H2A insufficiency causes chromosomal segregation defects due to anaphase chromosome bridge formation at rDNA repeats in fission yeast.
组蛋白 H2A 不足会因裂殖酵母中 rDNA 重复序列处形成后期染色体桥而导致染色体分离缺陷。
- DOI:10.1038/s41598-019-43633-5
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:4.6
- 作者:Yamamoto TG;Ding DQ;Nagahama Y;Chikashige Y;Haraguchi T;Hiraoka Y.
- 通讯作者:Hiraoka Y.
相同染色体ペアリングにおける 液相分離の役割
液相分离在同源染色体配对中的作用
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:井手 賢司;木澤 謙司 ;北西 健一 ;海野 昌喜;丁大橋
- 通讯作者:丁大橋
The Linear Element is a Stable Structure Along the Chromosome Axis in Fission Yeast.
线性元件是裂殖酵母中沿染色体轴的稳定结构。
- DOI:10.1101/2020.07.03.185785
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ding DQ;Matsuda A;Okamasa K;Hiraoka Y.
- 通讯作者:Hiraoka Y.
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丁 大橋其他文献
「 ゴ ミ・未利用」を「有用資源」へ─地域資源の魅力・再発見─
变“垃圾/闲置”为“有用资源”─重新发现当地资源的吸引力─
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- 影响因子:0
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八木寿梓
Anon-coding RNA-dependent meiotic homologous chromosome pairing site in fission yeast
裂殖酵母中非编码RNA依赖的减数分裂同源染色体配对位点
- DOI:
- 发表时间:
2011 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
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丁 大橋
分裂酵母染色体核内配置マップの作成
裂殖酵母染色体核位置图的创建
- DOI:
- 发表时间:
2019 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
近重 裕次;松田 厚志;荒神 尚子;福田 紀子;佐伯 恵里;岡正 華澄;丁 大橋;森 知栄;原口 徳子;平岡 泰 - 通讯作者:
平岡 泰
独占仮説を調べる -隣接する湖におけるミジンコ個体群の遺伝構造の比較から-
垄断假说的探讨——从邻近湖泊水蚤种群遗传结构的比较来看——
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Matsuda H;Abrams PA;熊谷仁志,牧野渡,占部城太郎;Takashi SAITOH;丁 大橋;熊谷仁志*,牧野渡,( 占部城太郎 ) - 通讯作者:
熊谷仁志*,牧野渡,( 占部城太郎 )
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