X線による昆虫飛翔筋内の蛋白分子運動の実空間イメージング
X線による昆虫飛翔筋内の蛋白分子運動の実空間イメージング
批准号:
19K06777
负责人:
岩本 裕之
金额:
$2.75万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-01 至 2024-03-31
关键词:
中文摘要
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英文摘要
2021年度は、モデル構造としてミオシン頭部で修飾されたアクチン繊維(モデルはPDB=Protein Data Baseにある原子座標を利用して作成)を用い、CDI計算が収束するかどうかを調べた。その結果、種々の工夫により、ミオシン頭部修飾アクチン繊維のようなオーバーサンプリング条件を満たさない試料であっても200回程度の繰り返し計算で完全収束し、3次元構造の完全な復元が可能であることが分かった。これは3次元の回折像(試料を360度回転させて記録した2次元回折像のセット)を用いる方法である2022年度は、これに基づいて実際の測定で記録されるような2次元のX線回折像から3次元構造を復元するプログラムを作成し、試験を始めた。これは上記の3次元の回折像を回転平均化したものである。これは3次元回折像より情報が少ないため3次元構造の復元は上記の場合より困難で、プログラムに種々の改良を行いながら試験しているところである。また、2022年度は米国フロリダ大学の共同研究者とともに、本研究課題の試料としているマルハナバチの飛翔筋のミオシン繊維の構造を、クライオ電顕で6Åの解像度で決定した論文を出版することができた。この中で、ミオシン分子のバックボーンのコイルドコイル構造が解像されているほか、フライチンなどのミオシン付属蛋白と考えられる密度も解像されている。ミオシン頭部は乱れているようであり、2021年に実験責任者がIUCRjに出版した結果(ミオシン頭部は乱れておらず、いわゆるInteracting Head Motifの構造をとる)とは異なっている。
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X線回折イメージングはどこまで動物学に応用できるか
X射线衍射成像可以在多大程度上应用于动物学?
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Tomoko Yoshikawa, Ken-ichi Honma, Sato Honma, 岩本裕之]
通讯作者:
岩本裕之
DOI:
10.3390/ijms24010377
发表时间:
2022-12-26
期刊:
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
影响因子:
5.6
作者:
[Li, Jiawei, Rahmani, Hamidreza, Yeganeh, Fatemeh Abbasi, Rastegarpouyani, Hosna, Taylor, Dianne W., Wood, Neil B., Previs, Michael J., Iwamoto, Hiroyuki, Taylor, Kenneth A.]
通讯作者:
Taylor, Kenneth A.
Recent progress in synchrotron radiation X-ray diffraction studies for non-crystalline biological specimens
非晶生物标本同步辐射X射线衍射研究新进展
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mita Masatoshi, Nakamura Keitaro, Tsutsui Kazuyoshi, Katayama Hidekazu, H. Iwamoto]
通讯作者:
H. Iwamoto
Florida State University(米国)
佛罗里达州立大学(美国)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
The 3-D structure of fibrous material is fully restorable from its X-ray diffraction pattern
纤维材料的 3D 结构可通过 X 射线衍射图完全恢复
DOI:
10.1101/2021.02.09.430379
发表时间:
2021
期刊:
bioRxiv
影响因子:
--
作者:
[Iwamoto Hiroyuki]
通讯作者:
Iwamoto Hiroyuki
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