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Dynamics of protein-protein interface: Development of analysis methods based on machine learning and MD simulation
蛋白质-蛋白质界面动力学：基于机器学习和MD模拟的分析方法的开发
基本信息
- 批准号：18K05025
- 负责人：
- 金额：$ 2.83万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份：2018
- 资助国家：日本
- 起止时间：2018-04-01 至 2023-03-31
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
项目成果
期刊论文数量（26）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
分子動力学計算を用いた抗原抗体界面に存在する塩橋の安定性を決定する要因の研究
利用分子动力学计算研究决定抗原-抗体界面上存在的盐桥稳定性的因素
- DOI：
- 发表时间：2018
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：岡島亮，山下雄史
- 通讯作者：岡島亮，山下雄史
Properties of the Protein-Protein Interface Revealed by Molecular dynamics Simulations
分子动力学模拟揭示蛋白质-蛋白质界面的性质
- DOI：
- 发表时间：2022
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：渡邊麻衣;B. Sales;渡辺忠孝;Takefumi Yamashita
- 通讯作者：Takefumi Yamashita
Molecular Dynamics Simulation for Biological and Material polymers
生物和材料聚合物的分子动力学模拟
- DOI：
- 发表时间：2022
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Takefumi Yamashita
- 通讯作者：Takefumi Yamashita
抗原-抗体界面における塩橋安定性の理論的解析
抗原抗体界面盐桥稳定性的理论分析
- DOI：
- 发表时间：2020
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：3.R. Kurokawa;R. Komiya;T. Oyoshi;Y. Matsuno;H. Tani;M. Katahira;K. Hitachi;Y. Iwashita;T. Yamashita;K. Kondo;R. Yoneda;Y. Yamaoki;N. Ueda;T. Mashima;N. Kobayashi;T. Nagata;A. Kiyoishi;M. Miyake;F. Kano;M. Murata1;N. Hamad;K. Sasaki;Takefumi Yamashita;Takefumi Yamashita;山下雄史;山下雄史;山下雄史;山下雄史;山下雄史;Takefumi Yamashita;Takefumi Yamashita;山下雄史
- 通讯作者：山下雄史
Multiplicity in Long Noncoding RNA Biomedical Sciences
长非编码 RNA 生物医学科学的多样性
- DOI：10.11648/j.bs.20180402.11
- 发表时间：2018
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：3.R. Kurokawa;R. Komiya;T. Oyoshi;Y. Matsuno;H. Tani;M. Katahira;K. Hitachi;Y. Iwashita;T. Yamashita;K. Kondo;R. Yoneda;Y. Yamaoki;N. Ueda;T. Mashima;N. Kobayashi;T. Nagata;A. Kiyoishi;M. Miyake;F. Kano;M. Murata1;N. Hamad;K. Sasaki
- 通讯作者：K. Sasaki
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Yamashita Takefumi其他文献
Effect of conversion on epoxy resin properties: Combined molecular dynamics simulation and experimental study
转化率对环氧树脂性能的影响：结合分子动力学模拟和实验研究
- DOI：
10.1016/j.polymer.2022.125041 - 发表时间：
2022 - 期刊：
- 影响因子：4.6
- 作者：
Shoji Naoyuki;Sasaki Kohei;Uedono Akira;Taniguchi Yuichi;Hayashi Keiichi;Matsubara Norie;Kobayashi Tetsuya;Yamashita Takefumi - 通讯作者：
Yamashita Takefumi
Affinity Improvement of a Cancer-Targeted Antibody through Alanine-Induced Adjustment of Antigen-Antibody Interface
通过丙氨酸诱导的抗原-抗体界面调整提高癌症靶向抗体的亲和力
- DOI：
10.1016/j.str.2018.11.002 - 发表时间：
2019 - 期刊：
- 影响因子：5.7
- 作者：
Yamashita Takefumi;Mizohata Eiichi;Nagatoishi Satoru;Watanabe Takahiro;Nakakido Makoto;Iwanari Hiroko;Mochizuki Yasuhiro;Nakayama Taisuke;Kado Yuji;Yokota Yuki;Matsumura Hiroyoshi;Kawamura Takeshi;Kodama Tatsuhiko;Hamakubo Takao;Inoue Tsuyoshi;Fujitani Hi - 通讯作者：
Fujitani Hi
An ensemble docking calculation of lysozyme and HyHEL-10: Insight into the binding mechanism
溶菌酶和 HyHEL-10 的整体对接计算：深入了解结合机制
- DOI：
10.1063/1.5012301 - 发表时间：
2017 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Yamashita Takefumi;Takamatsu Yuichiro - 通讯作者：
Takamatsu Yuichiro
「EUの気候変動エネルギー政策とクリーン・モビリティ」
“欧盟气候变化能源政策和清洁交通”
- DOI：
- 发表时间：
2019 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Yamashita Takefumi;Okajima Ryo;Miyanabe Kazuhiro;Tsumoto Kouhei;Shoji Takada;蓮見 雄 - 通讯作者：
蓮見 雄
Dynamics of nucleosomes and transcription factors studied by molecular simulations
通过分子模拟研究核小体和转录因子的动力学
- DOI：
- 发表时间：
2017 - 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：
Yamashita Takefumi;Okajima Ryo;Miyanabe Kazuhiro;Tsumoto Kouhei;Shoji Takada;蓮見 雄;Shoji Takada - 通讯作者：
Shoji Takada
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{{ truncateString('Yamashita Takefumi', 18)}}的其他基金
Development of Molecular Dynamics Classification Theories for Life Science and Drug Design
生命科学和药物设计分子动力学分类理论的发展
- 批准号：
15KT0103 - 财政年份：2015
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
相似海外基金
CAREER: Blessing of Nonconvexity in Machine Learning - Landscape Analysis and Efficient Algorithms
职业：机器学习中非凸性的祝福 - 景观分析和高效算法
- 批准号：
2337776 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Continuing Grant
RII Track-4:NSF: Physics-Informed Machine Learning with Organ-on-a-Chip Data for an In-Depth Understanding of Disease Progression and Drug Delivery Dynamics
RII Track-4：NSF：利用器官芯片数据进行物理信息机器学习，深入了解疾病进展和药物输送动力学
- 批准号：
2327473 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Standard Grant
CC* Campus Compute: UTEP Cyberinfrastructure for Scientific and Machine Learning Applications
CC* 校园计算：用于科学和机器学习应用的 UTEP 网络基础设施
- 批准号：
2346717 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Standard Grant
Learning to create Intelligent Solutions with Machine Learning and Computer Vision: A Pathway to AI Careers for Diverse High School Students
学习利用机器学习和计算机视觉创建智能解决方案：多元化高中生的人工智能职业之路
- 批准号：
2342574 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Standard Grant
Collaborative Research: Conference: DESC: Type III: Eco Edge - Advancing Sustainable Machine Learning at the Edge
协作研究：会议：DESC：类型 III：生态边缘 - 推进边缘的可持续机器学习
- 批准号：
2342498 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Standard Grant
Excellence in Research:Towards Data and Machine Learning Fairness in Smart Mobility
卓越研究：实现智能移动中的数据和机器学习公平
- 批准号：
2401655 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Standard Grant
I-Corps: Translation potential of using machine learning to predict oxaliplatin chemotherapy benefit in early colon cancer
I-Corps：利用机器学习预测奥沙利铂化疗对早期结肠癌疗效的转化潜力
- 批准号：
2425300 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Standard Grant
機械学習アルゴリズムを用いた敗血症性凝固線溶障害の早期予測モデルの開発
使用机器学习算法开发脓毒性凝血和纤溶性疾病的早期预测模型
- 批准号：
24K12133 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
アニーリングと機械学習の融合による説明可能AI基盤の研究
结合退火和机器学习研究可解释的人工智能基础设施
- 批准号：
24KJ1081 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
CAREER: Mitigating the Lack of Labeled Training Data in Machine Learning Based on Multi-level Optimization
职业：基于多级优化缓解机器学习中标记训练数据的缺乏
- 批准号：
2339216 - 财政年份：2024
- 资助金额：
$ 2.83万 - 项目类别：
Continuing Grant