Dynamics of protein-protein interface: Development of analysis methods based on machine learning and MD simulation

蛋白质-蛋白质界面动力学:基于机器学习和MD模拟的分析方法的开发

基本信息

  • 批准号:
    18K05025
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.83万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2018
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2018-04-01 至 2023-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量(26)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
分子動力学計算を用いた抗原抗体界面に存在する塩橋の安定性を決定する要因の研究
利用分子动力学计算研究决定抗原-抗体界面上存在的盐桥稳定性的因素
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    岡島亮,山下雄史
  • 通讯作者:
    岡島亮,山下雄史
Properties of the Protein-Protein Interface Revealed by Molecular dynamics Simulations
分子动力学模拟揭示蛋白质-蛋白质界面的性质
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    渡邊麻衣;B. Sales;渡辺忠孝;Takefumi Yamashita
  • 通讯作者:
    Takefumi Yamashita
Molecular Dynamics Simulation for Biological and Material polymers
生物和材料聚合物的分子动力学模拟
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takefumi Yamashita
  • 通讯作者:
    Takefumi Yamashita
抗原-抗体界面における塩橋安定性の理論的解析
抗原抗体界面盐桥稳定性的理论分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    3.R. Kurokawa;R. Komiya;T. Oyoshi;Y. Matsuno;H. Tani;M. Katahira;K. Hitachi;Y. Iwashita;T. Yamashita;K. Kondo;R. Yoneda;Y. Yamaoki;N. Ueda;T. Mashima;N. Kobayashi;T. Nagata;A. Kiyoishi;M. Miyake;F. Kano;M. Murata1;N. Hamad;K. Sasaki;Takefumi Yamashita;Takefumi Yamashita;山下雄史;山下雄史;山下雄史;山下雄史;山下雄史;Takefumi Yamashita;Takefumi Yamashita;山下雄史
  • 通讯作者:
    山下雄史
Multiplicity in Long Noncoding RNA Biomedical Sciences
长非编码 RNA 生物医学科学的多样性
  • DOI:
    10.11648/j.bs.20180402.11
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    3.R. Kurokawa;R. Komiya;T. Oyoshi;Y. Matsuno;H. Tani;M. Katahira;K. Hitachi;Y. Iwashita;T. Yamashita;K. Kondo;R. Yoneda;Y. Yamaoki;N. Ueda;T. Mashima;N. Kobayashi;T. Nagata;A. Kiyoishi;M. Miyake;F. Kano;M. Murata1;N. Hamad;K. Sasaki
  • 通讯作者:
    K. Sasaki
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Effect of conversion on epoxy resin properties: Combined molecular dynamics simulation and experimental study
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Shoji Naoyuki;Sasaki Kohei;Uedono Akira;Taniguchi Yuichi;Hayashi Keiichi;Matsubara Norie;Kobayashi Tetsuya;Yamashita Takefumi
  • 通讯作者:
    Yamashita Takefumi
Affinity Improvement of a Cancer-Targeted Antibody through Alanine-Induced Adjustment of Antigen-Antibody Interface
通过丙氨酸诱导的抗原-抗体界面调整提高癌症靶向抗体的亲和力
  • DOI:
    10.1016/j.str.2018.11.002
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Yamashita Takefumi;Mizohata Eiichi;Nagatoishi Satoru;Watanabe Takahiro;Nakakido Makoto;Iwanari Hiroko;Mochizuki Yasuhiro;Nakayama Taisuke;Kado Yuji;Yokota Yuki;Matsumura Hiroyoshi;Kawamura Takeshi;Kodama Tatsuhiko;Hamakubo Takao;Inoue Tsuyoshi;Fujitani Hi
  • 通讯作者:
    Fujitani Hi
An ensemble docking calculation of lysozyme and HyHEL-10: Insight into the binding mechanism
溶菌酶和 HyHEL-10 的整体对接计算:深入了解结合机制
  • DOI:
    10.1063/1.5012301
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yamashita Takefumi;Takamatsu Yuichiro
  • 通讯作者:
    Takamatsu Yuichiro
「EUの気候変動エネルギー政策とクリーン・モビリティ」
“欧盟气候变化能源政策和清洁交通”
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yamashita Takefumi;Okajima Ryo;Miyanabe Kazuhiro;Tsumoto Kouhei;Shoji Takada;蓮見 雄
  • 通讯作者:
    蓮見 雄
Dynamics of nucleosomes and transcription factors studied by molecular simulations
通过分子模拟研究核小体和转录因子的动力学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yamashita Takefumi;Okajima Ryo;Miyanabe Kazuhiro;Tsumoto Kouhei;Shoji Takada;蓮見 雄;Shoji Takada
  • 通讯作者:
    Shoji Takada

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    24KJ1081
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  • 资助金额:
    $ 2.83万
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    2339216
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.83万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
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知道了