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Elucidation of the mechanisms regulating Human T cell leukemia virus type 1 gene expression by high-throughput experimental methods

高通量实验方法阐明人T细胞白血病病毒1型基因表达调节机制

基本信息

批准号：
18K08437
负责人：
MIYAZATO PAOLA
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-04-01 至 2020-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

HTLV-1はレトロウイルスであるため、感染後にヒトゲノムに組み込まれる。ウイルス遺伝子の発現は組み込まれた周辺環境により影響を受けるが、プロウイルス配列内にもウイルス遺伝子の発現制御に関わる配列が存在することを我々は明らかにしてきた。本研究課題ではHTLV-1感染細胞株を用いて、プロウイルス内部のエンハンサー配列を同定した。この配列は患者検体でも保たれており、SRF とELK-１転写因子の局在が観察された。HTLV-1遺伝子の発現調節に着目し、HTLV-1 RNAの転写後調節におけるZAPタンパク質の役割を調べた。Capped RNAのRNAseq であるCAGEを行った結果、HTLV-1トランスクリプト転写後の分解が考えられた。ZAPがCG コンテンツの高いRNA転写物を認識し、分解を誘導することはこれまで報告されているが、実際、HTLV-1でも高いCG コンテンツが認められた。感染細胞株にZAPをターゲットにした siRNAを導入すると、ZAPの発現低下と共にHTLV-1 p19タンパク質が上清中に増加した。一方で、ZAPの強制発現実験ではp19の減少が観察された。この研究成果はRetrovirology誌に報告した。我々が以前に確立したサンプル濃縮法は、アルゼンチンを含む各国の無症候性キャリア、HAM / TSPおよびATL患者から分離された臨床サンプルのプロウイルス配列と組み込み部位の同時同定に有用であることを今回示した。HTLV-1の宿主ゲノムへの組み込みが、非感染細胞では見られない転写産物の新規発現を引き起こし、それが発癌に関与する可能性が考えられている。今回解析した30症例中、19症例でセンス鎖とアンチセンス鎖でウイルス-宿主のキメラ転写産物を検出した。また、臨床サンプルを用いたシングルセルレベルでのRNAseqも行った。

HTLV-1 is a highly sensitive and sensitive system. The occurrence of the virus is affected by the surrounding environment, and the occurrence of the virus is affected by the surrounding environment. This study aims to determine the sequence of HTLV-1 infected cell lines. This is the first time that a patient's body has been identified. SRF and ELK-1 have been identified. HTLV-1 gene expression regulation, HTLV-1 RNA post-transcription regulation, ZAP gene expression regulation Capped RNA RNA RNA ZAP is a high level of CG and RNA. It is a high level of CG and RNA. The expression of ZAP in infected cell lines decreased and the expression of HTLV-1 p19 increased. On the other hand, the stress of ZAP was observed in the decrease of p19. The results of this research are reported in Retrovirology Journal. We have previously established the method of concentration, including asymptomatic separation, HAM / TSP separation, and simultaneous determination of sites. The host of HTLV-1 must be composed of different groups, and the discovery of new regulations for the production of novel products in non-infected cells has been initiated, which raises the possibility of a link to cancer development. In this paper, 19 of the 30 cases were analyzed. In addition to the above, we can also use the RNAseq to conduct the research.