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国際間HTLV-1ウイルス遺伝子発現の比較と病原性との関連解明

国际HTLV-1病毒基因表达比较及其与致病性关系的阐明

基本信息

批准号：
18KK0452
负责人：
MIYAZATO PAOLA
金额：
$ 9.98万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18KK0452/
关键词：
HTLV-1感染症 ATL 次世代シークエンス Transcriptome RNAseq DNA-seq RNA-seq

项目摘要

HTLV-1感染患者は九州・沖縄地方で多く認められるが、日本以外にも感染者流行地が存在する。感染流行地が異なるとHTLV-1関連疾患の種類も異なる事が知られている。本研究課題では、海外流行地域（アルゼンチン、オーストラリア）において異なる臨床像を示すHTLV-1感染患者検体を用いて地域性などの環境因子を含む、病原性や疾患指向性の違いを生むメカニズムについて解析した。我々が以前に確立したサンプル濃縮法は、98名の日本人HTLV-1患者から分離された臨床サンプルのプロウイルス配列と組み込み部位の同時同定に有用であることを今回の解析により示し、Cell Reports誌に報告した。また、本解析手法はアルゼンチンの感染患者サンプルにも適用可能であった。HTLV-1遺伝子の発現調節に着目し、HTLV-1 RNAの転写後調節におけるZAPタンパク質の役割を調べた。Capped RNAのRNAseq であるCAGEを行った結果、HTLV-1トランスクリプトの分解が考えられた。ZAPがCG コンテンツの高いRNA転写物を認識し、分解を誘導することはこれまで報告されているが、実際、HTLV-1でも高いCG コンテンツが認められた。また、感染細胞株にZAPをターゲットにした siRNAを導入すると、ZAPの発現低下と共にHTLV-1 p19タンパク質が上清中に増加した。一方で、ZAPの強制発現実験ではp19の減少が観察された。これらの研究成果はRetrovirology誌に報告した。HTLV-1の宿主ゲノムへの組み込みが、非感染細胞では見られない転写産物の新規発現を引き起こし、それが発癌に関与する可能性が考えられている。今回、30症例中19症例でセンス鎖とアンチセンス鎖でウイルス-宿主のキメラ転写産物を検出した。また、臨床サンプルを用いたシングルセルレベルでのRNAseqも行った。

HTLV-1-infected patients were prevalent in Kyushu, local areas and other places outside Japan. In the area where infection is prevalent, patients with HTLV-1 disease and other diseases are aware of the disease. In this study, the subject of this study, the overseas epidemic areas (epidemic areas) and overseas epidemic areas (epidemic areas) were used to show that the patients with HTLV-1 infection were infected with environmental factors in the area and pathogenicity of the disease. In the past, we made sure that 98 Japanese patients with HTLV-1 were separated from each other. At the same time, it was useful to determine the location of the device. This time, we analyzed the presentation and the Cell Reports report. The method of this analysis is to treat the infected patients and use them as possible. The HTLV-1 computer is looking at it. After the HTLV-1 RNA has written it, let's know how to use the ZAP to cut it. The results of the Capped RNA RNAseq and CAGE rows, the results of the HTLV-1 analysis, the breakdown of the data, and the results of the analysis. ZAP, CG, RNA, write, read, decompose, read, report, report The infected cell line, ZAP cell line, infected cell line, siRNA cell line, HTLV-1 p19 cell line, infected cell line, infected On the one hand, ZAP forces you to make sure that you don't have to pay attention to p19. The results of the research, Retrovirology, reports. HTLV-1 host and non-infected cells are not responsible for writing things. New rules can lead to cancer, cancer and other diseases. This time, 19 of the 30 cases were diagnosed as having an infection. The host was told to write something. The bed, the bed, the RNAseq, the bed, the bed