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Study of the mechanism of response to low potassium via modification of mRNA strucutres in plants

通过修饰植物mRNA结构研究低钾响应机制

基本信息

批准号：
18KK0426
负责人：
西田翔
金额：
$ 9.4万
依托单位：
Saga University (2019-2022)Hiroshima University (2018)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019 至 2023
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は、シロイヌナズナ由来の転写因子であるMYB59の機能解析を通して、植物の低カリウム（K）応答における遺伝子発現制御機構を明らかにするとともに、MYB59 mRNAにおけるスプライシング調節を介した低K応答機構の詳細を明らかにすることを目的としている。１．MYB59が発現制御する遺伝子群を探索するために、低K条件下で栽培した野生型植物、MYB59欠損型植物、およびMYB59欠損型植物にMYB59を導入した相補系統植物の根を対象にRNA-Seqを実施した。そして、得られたRNA-Seqデータを解析することで、MYB59の下流にある遺伝子群の同定を試みた。その結果、MYB59の制御下にあることがわかっているK輸送体遺伝子NPF7.3を含めた1,027個の遺伝子がMYB59の下流にあることが予想された。これら遺伝子群の中にはエチレン合成およびROS生産に関わる遺伝子が複数含まれていた。エチレンおよびROSは低K応答シグナル因子として知られており、MYB59は低K応答におけるエチレンおよびROSの合成において必須な役割を果たしている可能性が示唆された。２．1.で同定された遺伝子群の内、MYB59が直接的に転写制御している遺伝子を同定するためにChIP-Seq解析を実施した。得られたシーケンスデータについては、渡航先において共同研究者であるAarts教授の協力のもとで解析を進めた。予備解析結果において、MYB59の転写制御下にある遺伝子として既に知られているNPF7.3が検出されたことが確認できた。今後、さらなる解析を進めることで、MYB59が転写制御する新規遺伝子と低K応答のメカニズムを明らかにする。

In this study, the reason for the cause of this study is that the MYB59 machine can analyze the general information, the plant system (K), the system of the system, the system of the machine, the system of the MYB59 mRNA, the information of the machine, the information of the machine, the response of the organization, the response of the machine, the purpose of the system. 1.MYB59 plants were cultivated under low K conditions, wild-type plants, MYB59-deficient plants and MYB59-deficient plants were introduced into the roots of wild-type plants, wild-type plants and MYB59-deficient plants under low-K conditions. You can use the RNA-Seq to analyze the data, and the subgroups of the MYB59 users are the same as those of the test group. According to the results of the test, the MYB59 system is responsible for monitoring the number of users. The sub-NPF7.3 contains more than 1027 users, MYB59 users, and users who want to use it. The complex number of children in the sub-group of ROS contains a copy of the word "synthetic". You need to know that you need to know that the ROS is low-K and that the MYB59 is low-K, and that the ROS synthesis must be successful. 2.1. In the sub-group, MYB59 directly writes and controls the data in the sub-group. The ChIP-Seq parse is the same as that in the database. The co-researcher, the co-researcher, the professor Aarts, the co-researcher, the professor, the co-researcher, the co-researcher and the co-researcher. After analyzing the results of the analysis, the MYB59 system is written to make sure that you are aware that you are not aware that you are going to make sure that you have received information from your NPF7.3. In the future, you will analyze the progress, and MYB59 will make sure that the new specification is low-K and clear.