ウイルスを摂動とする病態発現原理のマルチオミクス解析とその包括的理解

利用病毒扰动进行多组学分析并全面了解病理表现原理

• 批准号: 18KK0447
• 负责人: 佐藤 佳
• 金额: $ 9.98万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019 至 2023
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18KK0447/
• 关键词: ウイルス学; システムウイルス学; バイオインフォマティクス

本年度では、終末宿主であるヒトと、自然宿主であるコウモリにおけるウイルス感染免疫応答の違いを、シングルセルRNA-sequencing解析した（Aso et al., bioRxiv, 2023）。また、本研究を通して構築した解析方法を駆使し、新型コロナウイルスに関する研究も実施し、複数の学術論文をcorresponding authorとして発表した。 具体的には、出現が続く新型コロナウイルスの変異株（オミクロンBA.2株, BA.5株, BA.2.75株など)のウイルス学的特性を包括的に解析し、それらを世界に先駆けて解明した。これらの研究成果は、CellやLancet姉妹誌、Cell姉妹誌などに、corresponding authorとして発表した（Yamasoba et al., Cell, 2022; Kimura et al., Cell, 2022; Yamasoba et al., Lancet Infectious Diseases, 2022; Saito et al., Cell Host & Microbe, 2022、他）。円滑な国際共同研究の進展のために、ベトナム・ハノイを訪問し、研究打ち合わせを実施した。しかし、当課題で予定していた、他の渡航と研究打ち合わせは、新型コロナウイルスのパンデミックにより実行できなかった。そのため、オンライン会議を実施することで代替した。

This year's RNA-sequencing analysis was performed in the terminal host, natural host and infected immune response (Aso et al., bioRxiv, 2023）。This study aims to establish analytical methods, research methods related to new research methods, and a number of academic papers corresponding to author and presentation. Specifically, new strains (strain BA.2, strain BA.5, strain BA.2.75) appeared and their scientific characteristics were analyzed. The results of this research are as follows: Cell Lancet, Cell Lancet, Cell Cell, 2022; Kimura et al., Cell, 2022; Yamasoba et al., Lancet Infectious Diseases, 2022; Saito et al., Cell Host & Microbe, 2022. International joint research progress and development When the topic is determined, he will study it and make it a new one. The meeting was held in the evening.

项目成果

The True Nature of Viruses Elucidated by Systems Virology

系统病毒学阐明病毒的真实本质

• DOI: 10.3389/fviro.2021.808865
• 发表时间: 2021
• 期刊: Frontiers in Virology
• 作者: 加藤 健太郎;花松 久寿;古川 潤一;畠山 智充;橘 裕司;Sato Kei
• 通讯作者: Sato Kei

Human-Specific Adaptations in Vpu Conferring Anti-tetherin Activity Are Critical for Efficient Early HIV-1 Replication In Vivo.

• DOI: 10.1016/j.chom.2017.12.009
• 发表时间: 2018-01
• 期刊: Cell host & microbe
• 影响因子: 30.3
• 作者: Eri Yamada;S. Nakaoka;Lukas Klein;Elisabeth Reith;Simon Langer;K. Hopfensperger;S. Iwami;G. Schreiber;F. Kirchhoff;Y. Koyanagi;D. Sauter;Kei Sato

Inherited chromosomally integrated HHV-6 possibly modulates human gene expression

遗传性染色体整合的 HHV-6 可能调节人类基因表达

• DOI: 10.1007/s11262-020-01745-5
• 发表时间: 2020
• 期刊: Virus Genes
• 影响因子: 1.6
• 作者: Kumata Ryuichi;Ito Jumpei;Sato Kei
• 通讯作者: Sato Kei

A role for gorilla APOBEC3G in shaping lentivirus evolution including transmission to humans

大猩猩 APOBEC3G 在塑造慢病毒进化（包括传播给人类）中的作用

• DOI: 10.1371/journal.ppat.1008812
• 发表时间: 2020
• 期刊: PLOS Pathogens
• 影响因子: 6.7
• 作者: Nakano Yusuke;Yamamoto Keisuke;Ueda Mahoko Takahashi;Soper Andrew;Konno Yoriyuki;Kimura Izumi;Uriu Keiya;Kumata Ryuichi;Aso Hirofumi;Misawa Naoko;Nagaoka Shumpei;Shimizu Soma;Mitsumune Keito;Kosugi Yusuke;Juarez-Fernandez Guillermo;Ito Jumpei;...;Koyanagi
• 通讯作者: Koyanagi

SARS-CoV-2 ORF3b Is a Potent Interferon Antagonist Whose Activity Is Increased by a Naturally Occurring Elongation Variant

• DOI: 10.1016/j.celrep.2020.108185
• 发表时间: 2020-09-22
• 期刊: CELL REPORTS
• 影响因子: 8.8
• 作者: Konno, Yoriyuki;Kimura, Izumi;Sato, Kei
• 通讯作者: Sato, Kei