Small proteins implicated in the virulence of the enteric pathogen Yersinia pseudotuberculosis

与肠道病原体假结核耶尔森氏菌毒力有关的小蛋白

基本信息

项目摘要

The enteric pathogen Yersinia pseudotuberculosis has evolved a plethora of different pathogenicity factors, which promote survival and proliferation in its mammalian hosts. Until today, many common and species-specific virulence strategies have been discovered but their coordinated and spatiotemporal expression and function is still not fully understood. Recent discoveries made evident that small proteins exist that might participate in these processes. Our recent ribosome profiling (Ribo-seq)/RNA-Seq of Y. pseudotuberculosis, grown under three different virulence-relevant conditions, revealed 14 expressed short open reading frames (sORFs) for small proteins (21-60 aa) encoded on the Yersinia virulence plasmid. This plasmid encodes a type III secretion system (T3SS) that injects effector proteins (Yops) into host innate immune cells to prevent the elimination of Yersinia by phagocytosis. The identified sORFs fall in three different categories: (i) small protein candidates implicated in the copy number of the Yersinia virulence plasmid, (ii) small proteins affecting the expression of the major transcriptional activator LcrF of the T3SS/Yop machinery, and (iii) small proteins affecting the secretion of the Yop effectors. A subset of the identified candidates, which are predicted to influence one of these different virulence-relevant functions, has been selected, validated and shown to influence the synthesis and/or secretion of the Yop proteins. Based on these results our main tasks in this project are to elucidate their regulation or regulatory mechanisms, their molecular function, interaction partners, cellular localization, and their role in pathogenesis.
肠道病原体假结核耶尔森氏菌已进化出多种不同的致病因子,促进其哺乳动物宿主的生存和增殖。直到今天,许多常见的和物种特异性的毒力策略已经被发现,但它们的协调和时空表达和功能仍未完全了解。最近的发现表明,存在可能参与这些过程的小蛋白质。我们最近对在三种不同毒力相关条件下生长的假结核耶尔森氏菌进行核糖体分析 (Ribo-seq)/RNA-Seq,揭示了耶尔森氏菌毒力质粒上编码的小蛋白 (21-60 aa) 的 14 个表达的短开放阅读框 (sORF)。该质粒编码 III 型分泌系统 (T3SS),该系统将效应蛋白 (Yops) 注入宿主先天免疫细胞中,以防止耶尔森氏菌被吞噬作用消除。已鉴定的 sORF 分为三个不同的类别:(i)与耶尔森氏菌毒力质粒的拷贝数有关的小蛋白候选物,(ii)影响 T3SS/Yop 机制的主要转录激活因子 LcrF 表达的小蛋白,以及(iii)影响 Yop 效应器分泌的小蛋白。已确定的候选物的子集预计会影响这些不同毒力相关功能之一,已被选择、验证并显示会影响 Yop 蛋白的合成和/或分泌。基于这些结果,我们在这个项目中的主要任务是阐明它们的调节或调节机制、它们的分子功能、相互作用伙伴、细胞定位以及它们在发病机制中的作用。

项目成果

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知道了