The essential protein Mak16 binds an Fe/S center: Implications for its function in ribosomal assembly

必需蛋白 Mak16 与 Fe/S 中心结合:对其在核糖体组装中的功能的影响

基本信息

  • 批准号:
    389965693
  • 负责人:
  • 金额:
    --
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    德国
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 财政年份:
    2017
  • 资助国家:
    德国
  • 起止时间:
    2016-12-31 至 2022-12-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Mak16 is an essential protein that is required for the maturation of 60S rRNA during assembly of ribosomes. However, its precise molecular role is unknown. Mak16 interacts with other ribosome biogenesis factors and, as we found, with proteins responsible for cytosolic iron-sulfur (Fe/S) protein assembly (CIA machinery). Previously, our study of CIA factors led to the discovery that all eukaryotic DNA polymerases contain Fe/S clusters, which are crucial for the assembly with accessory subunits and DNA replication. Now, our preliminary work demonstrates the presence of an essential Fe/S cluster in eukaryotic Mak16, including human Mak16. In this proposal we want to unravel the role of the Fe/S cluster of Mak16 for its function in ribosomal assembly. We plan structure-function studies of Mak16 proteins in vivo in Saccharomyces cerevisiae and biochemical characterization of Mak16 proteins in vitro. The methods include EPR, Mössbauer and paramagnetic NMR spectroscopy. To address the essentiality of the Fe/S cluster of Mak16 for complex formation with interactions partners, extensive interactome analysis of wild-type and Fe/S-defective Mak16 mutants will be performed using an innovative, non-radioactive, pulse-chase epitope labeling approach. Unique features of Mak16 include similarity to the ribosomal L28e protein family and a highly basic N-terminal domain, suggesting rRNA binding. This issue will be investigated by protein/RNA binding studies using NMR spectroscopy. Our research on Mak16 is pivotal for understanding of the role of Fe/S clusters in ribosome biogenesis at molecular level.
Mak 16是核糖体组装过程中60 S rRNA成熟所需的必需蛋白。然而,其确切的分子作用尚不清楚。Mak 16与其他核糖体生物合成因子相互作用,正如我们发现的那样,与负责细胞溶质铁硫(Fe/S)蛋白组装(CIA机器)的蛋白质相互作用。在此之前,我们对CIA因子的研究发现,所有真核生物的DNA聚合酶都含有Fe/S簇,这些簇对于与辅助亚基的组装和DNA复制至关重要。现在,我们的初步工作表明,在真核生物Mak 16,包括人Mak 16中存在一个必要的Fe/S簇。在这个提议中,我们想解开Mak 16的Fe/S簇在核糖体组装中的作用。我们计划Mak 16蛋白在酿酒酵母体内的结构-功能研究和Mak 16蛋白在体外的生化特性。方法包括EPR,穆斯堡尔和顺磁NMR光谱。为了解决Mak 16的Fe/S簇与相互作用伴侣形成复合物的重要性,将使用创新的非放射性脉冲追踪表位标记方法对野生型和Fe/S缺陷型Mak 16突变体进行广泛的相互作用组分析。Mak 16的独特特征包括与核糖体L28 e蛋白家族的相似性和高度碱性的N-末端结构域,表明rRNA结合。这个问题将通过使用NMR光谱的蛋白质/RNA结合研究来研究。我们对Mak 16的研究对于在分子水平上理解Fe/S簇在核糖体生物发生中的作用具有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Dr. Daili J. A. Netz其他文献

Dr. Daili J. A. Netz的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

相似国自然基金

有翅与无翅蚜虫差异分泌唾液蛋白Cuticular protein在调控植物细胞壁免疫中的功能
  • 批准号:
    32372636
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目
原发性开角型青光眼中SIPA1L1促进小梁网细胞外基质蛋白累积升高眼压的作用机制
  • 批准号:
    82371054
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    49.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目
胆固醇合成蛋白CYP51介导线粒体通透性转换诱发Th17/Treg细胞稳态失衡在舍格伦综合征中的作用机制研究
  • 批准号:
    82370976
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    48.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目
细胞周期蛋白依赖性激酶Cdk1介导卵母细胞第一极体重吸收致三倍体发生的调控机制研究
  • 批准号:
    82371660
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    49.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目
转运蛋白RCP调控巨噬细胞脂肪酸氧化参与系统性红斑狼疮发病的机制研究
  • 批准号:
    82371798
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    49.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目
G蛋白偶联受体GPR110调控Lp-PLA2抑制非酒精性脂肪性肝炎的作用及机制研究
  • 批准号:
    82370865
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    49.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目
蛋白精氨酸甲基化转移酶PRMT5调控PPARG促进巨噬细胞M2极化及其在肿瘤中作用的机制研究
  • 批准号:
    82371738
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    49.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目
紧密连接蛋白PARD3下调介导黏膜上皮屏障破坏激活STAT3/SNAI2通路促进口腔白斑病形成及进展的机制研究
  • 批准号:
    82370954
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    47.00 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Sustaining chicken-meat production with alternative protein sources
利用替代蛋白质来源维持鸡肉生产
  • 批准号:
    LP220100292
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Linkage Projects
New substrates and functions for the DYRK protein kinases
DYRK 蛋白激酶的新底物和功能
  • 批准号:
    2894877
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Studentship
Optimal cell factories for membrane protein production
用于膜蛋白生产的最佳细胞工厂
  • 批准号:
    BB/Y007603/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Research Grant
New substrates and functions for the DYRK protein kinases
DYRK 蛋白激酶的新底物和功能
  • 批准号:
    BB/Y512527/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Training Grant
CAREER: atomistic characterization of protein-polymer conjugates
职业:蛋白质-聚合物缀合物的原子表征
  • 批准号:
    2339330
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Conference: 2024 Protein Processing, Trafficking and Secretion GRC/GRS
会议:2024 蛋白质加工、运输和分泌 GRC/GRS
  • 批准号:
    2419301
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
I-Corps: Translation Potential of a High Throughput Drug Discovery Platform for Protein Degraders
I-Corps:蛋白质降解剂高通量药物发现平台的转化潜力
  • 批准号:
    2419488
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
ミトコンドリアUnCoupling Protein 2による出血性ショック予後改善効果
线粒体解偶联蛋白2对改善失血性休克预后的影响
  • 批准号:
    24K12175
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Intelligent cryo-electron microscopy of G protein-coupled receptors
G 蛋白偶联受体的智能冷冻电子显微镜
  • 批准号:
    23K23818
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
The mechanism of CELF1 upregulation and its role in the pathogenesis of Myotonic Dystrophy Type 1
CELF1上调机制及其在强直性肌营养不良1型发病机制中的作用
  • 批准号:
    10752274
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了