草原性蝶類における遺伝的多様性の減少メカニズム：標本ＤＮＡを用いた複数種比較解析

草原蝴蝶遗传多样性减少的机制：利用标本DNA对多个物种进行比较分析

• 批准号: 17J00965
• 负责人: 中濱 直之
• 金额: $ 3.08万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2017
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2017-04-26 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17J00965/
• 关键词: 昆虫; 絶滅危惧種; 半自然草原; 標本DNA; マイクロサテライト; MIG-seq; 遺伝的多様性; 標本; マイクロサテライト解析; 草原面積; 遺伝構造

今年度は引き続き日本各地の大学や博物館で昆虫標本サンプルの収集を実施した。訪問した研究機関は、三重県立総合博物館、神奈川県立生命の星地球博物館、東京農業大学であり、いずれも標本サンプルの提供を受けた。しかしながら、マイクロサテライト解析には1種1地点あたりおよそ20個体のサンプルが必要であり、特に普通種の標本においては十分なサンプル数を確保することができなかった。今後もマイクロサテライト解析による本研究の遂行に十分なサンプル数の収集の目途が立たなかったことから、より少数のサンプルでも可能なMIG-seq法の実施を検討した。本手法はゲノムを縮約して大量の(数百～数千座)一塩基多型(SNP)を解析する、2015年に開発された手法である。本手法は植物標本において30年ほど前のサンプルでは解析可能であることが示されていたものの、昆虫標本に対してどの程度有効であるかといった知見はこれまで不明であった。そこで、MIG-seq法における昆虫標本サンプルの有用性を評価した。コマルハナバチ(膜翅目)、ナガサキアゲハ(鱗翅目)、ギンヤンマ(蜻蛉目)、ヨコヅナサシガメ (半翅目)の4種 (1980年代から2010年代までに採集された標本サンプル) についてMIG-seq法による解析を実施した。その結果、コマルハナバチとナガサキアゲハ、ギンヤンマについては1980年代以前は多くの標本で十分な数の一塩基多型を得ることができなかったものの、1990年代以降の標本からは十分な数の一塩基多型を得ることができた。一方で、ヨコヅナサシガメについて、解析が成功した標本は2010年代のごく一部に限られた。

This year, the collection of insects in universities and museums around Japan has been implemented. Visits to research institutes, Mie Prefectural Museum, Kanagawa Prefectural Museum of Life and Earth, Tokyo Agricultural University, Tokyo, Japan The analysis of 1 species, 1 place, 20 individuals, 20 individuals, 20 individuals, 2 In the future, the implementation of the MIG-seq method will be discussed. This method is expected to be developed in 2015 after a large number of SNPs (hundreds to thousands) have been analyzed. This method is used to analyze the plant and insect species before 30 years. Evaluation of the usefulness of the MIG-seq method Four species (Hymenoptera),(Lepidoptera),(Odontoptera) and (Hemiptera) were analyzed by MIG-seq method. The result is that before the 1980s, there were a lot of people who had a lot of money and a lot of people who had a lot of money. Since the 1990s, there have been a lot of people who had a lot of money. A party,

项目成果

外来顕花植物が在来昆虫に与えるインパクトとは何か コメント

外来开花植物对本土昆虫有何影响？

• 发表时间: 2018
• 作者: 牛久由夏;石川直子;中濱直之;倉島治;陶山佳久;伊藤元己;中濱直之;中濵直之
• 通讯作者: 中濵直之

絶滅危惧IB類アゼオトギリの水田畦集団と河川敷集団の遺伝構造と環境応答性

濒危物种Azeotogiri稻田田埂和河床种群的遗传结构和环境响应

• 发表时间: 2017
• 作者: 吉岡俊人;古田誉裕;岸駿佑;水口亜樹;赤井賢成;藤晋一;中濵直之;蓮浦義之;堀内洋二;古市貴之;石井正人;松島宏
• 通讯作者: 松島宏

Mating pattern of a distylous primrose in a natural population: unilateral outcrossing and asymmetric selfing between sexual morphs

• DOI: 10.1007/s10682-018-9965-0
• 发表时间: 2018-11
• 期刊: Evolutionary Ecology
• 影响因子: 1.9
• 作者: Kurumi Arima;D. Kyogoku;N. Nakahama;K. Suetsugu;M. Ohtani;Chiyo Ishii;H. Terauchi;Y. Terauchi

ニュージーランドのキク科 Celmisia 属における MIG-seq を用いた系統解析

使用 MIG-seq 对新西兰菊科 Celmisia 属进行系统发育分析

• 发表时间: 2019
• 作者: 牛久由夏;石川直子;中濱直之;倉島治;陶山佳久;伊藤元己
• 通讯作者: 伊藤元己

Parental analysis of seeds from the wild population suggests overdominance rather than disassortative mating as the evolutionary maintenance mechanism of distyly in Primula kisoana

对野生种群种子的亲本分析表明，报春花报春花的进化维持机制是过度显性而不是不协调交配。

• 发表时间: 2018
• 作者: Arima Kurumi;Kyogoku Daisuke;Nakahama Naoyuki;Suetsugu Kenji;Ohtani Masato;Ishii Chiyo;Terauchi Hiroshi;Terauchi Yumiko;Isagi Yuji
• 通讯作者: Isagi Yuji