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草原性蝶類における遺伝的多様性の減少メカニズム:標本DNAを用いた複数種比較解析

草原性蝶類における遺伝的多様性の減少メカニズム:標本DNAを用いた複数種比較解析
草原蝴蝶遗传多样性减少的机制:利用标本DNA对多个物种进行比较分析
批准号:
17J00965
负责人:
中濱 直之
金额:
$3.08万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2017
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2017-04-26 至 2020-03-31

项目摘要

项目成果

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今年度は引き続き日本各地の大学や博物館で昆虫標本サンプルの収集を実施した。訪問した研究機関は、三重県立総合博物館、神奈川県立生命の星地球博物館、東京農業大学であり、いずれも標本サンプルの提供を受けた。しかしながら、マイクロサテライト解析には1種1地点あたりおよそ20個体のサンプルが必要であり、特に普通種の標本においては十分なサンプル数を確保することができなかった。今後もマイクロサテライト解析による本研究の遂行に十分なサンプル数の収集の目途が立たなかったことから、より少数のサンプルでも可能なMIG-seq法の実施を検討した。本手法はゲノムを縮約して大量の(数百~数千座)一塩基多型(SNP)を解析する、2015年に開発された手法である。本手法は植物標本において30年ほど前のサンプルでは解析可能であることが示されていたものの、昆虫標本に対してどの程度有効であるかといった知見はこれまで不明であった。そこで、MIG-seq法における昆虫標本サンプルの有用性を評価した。コマルハナバチ(膜翅目)、ナガサキアゲハ(鱗翅目)、ギンヤンマ(蜻蛉目)、ヨコヅナサシガメ (半翅目)の4種 (1980年代から2010年代までに採集された標本サンプル) についてMIG-seq法による解析を実施した。その結果、コマルハナバチとナガサキアゲハ、ギンヤンマについては1980年代以前は多くの標本で十分な数の一塩基多型を得ることができなかったものの、1990年代以降の標本からは十分な数の一塩基多型を得ることができた。一方で、ヨコヅナサシガメについて、解析が成功した標本は2010年代のごく一部に限られた。
期刊论文(29)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间: 2018
期刊:
影响因子: --
作者: [牛久由夏, 石川直子, 中濱直之, 倉島治, 陶山佳久, 伊藤元己, 中濱直之, 中濵直之]
通讯作者: 中濵直之
絶滅危惧IB類アゼオトギリの水田畦集団と河川敷集団の遺伝構造と環境応答性
濒危物种Azeotogiri稻田田埂和河床种群的遗传结构和环境响应
DOI: --
发表时间: 2017
期刊:
影响因子: --
作者: [吉岡俊人, 古田誉裕, 岸駿佑, 水口亜樹, 赤井賢成, 藤晋一, 中濵直之, 蓮浦義之, 堀内洋二, 古市貴之, 石井正人, 松島宏]
通讯作者: 松島宏
DOI: 10.1007/s10682-018-9965-0
发表时间: 2018-11
期刊: Evolutionary Ecology
影响因子: 1.9
作者: [Kurumi Arima;D. Kyogoku;N. Nakahama;K. Suetsugu;M. Ohtani;Chiyo Ishii;H. Terauchi;Y. Terauchi]
通讯作者: Kurumi Arima;D. Kyogoku;N. Nakahama;K. Suetsugu;M. Ohtani;Chiyo Ishii;H. Terauchi;Y. Terauchi
ニュージーランドのキク科 Celmisia 属における MIG-seq を用いた系統解析
使用 MIG-seq 对新西兰菊科 Celmisia 属进行系统发育分析
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [牛久由夏, 石川直子, 中濱直之, 倉島治, 陶山佳久, 伊藤元己]
通讯作者: 伊藤元己
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    ペットや園芸として人気の高い昆虫および植物における遺伝的撹乱の実態解明
    • 批准号:
      23K13969
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额:
      $2.91万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      中濱 直之
    • 依托单位:
    博物館標本の遺伝情報に基づいた絶滅危惧種の保全単位の設定
    • 批准号:
      19K15856
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额:
      $2.66万
    • 财政年份:
      2019
    • 负责人:
      中濱 直之
    • 依托单位:
    ゲノム情報と標本に基づく草原性絶滅危惧蝶類の保全遺伝学的研究
    • 批准号:
      15J00908
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.22万
    • 财政年份:
      2015
    • 负责人:
      中濱 直之
    • 依托单位:
    海外基金