第一原理分子動力学法の反応経路地図解析と励起ダイナミクスへの展開
第一原理分子動力学法の反応経路地図解析と励起ダイナミクスへの展開
批准号:
18J20856
负责人:
堤 拓朗
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2018
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-04-25 至 2021-03-31
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英文摘要
固有反応座標(IRC)はポテンシャルエネルギー曲面(PES)において反応物、遷移状態構造、生成物を結ぶ最小エネルギー経路であり、IRCに沿った構造変化やエネルギー変化から化学反応に関する直観的描像が得られる。近年、反応経路自動探索法により複数の異性体がIRCで結ばれた反応経路地図が構築され、反応機構解析へと展開されている。しかし、実際の分子系は運動量を持って反応するためダイナミクスの効果も重要である。経験的なパラメータを必要としないab initio分子動力学法は運動量が考慮された動的反応過程を与えるが、膨大な時系列データであるため恣意性なしに反応に関与する情報を抜き出すことは困難であった。PES上のエネルギー的に重要な領域である反応経路地図上で反応ダイナミクスを表現できれば、複雑な動的反応過程を複数のIRCを参照しながら解析可能になる。昨年度までに、多次元データ縮約法(古典的多次元尺度構成法)による化学反応空間の可視化に取り組み、反応ダイナミクスを表現するための舞台を構築してきた。本年度は可視化された反応空間へ動的反応過程を埋め込む方法論を整備し、二分子衝突反応や金5量体の分岐反応、異性化反応へ適用することで、従来の反応ダイナミクス解析では見落とされていたIRCから他のIRCへ乗り移るようなIRC-jump過程を見出した。特に金5量体の分岐反応では、IRC-jumpによって到達可能な生成物領域が決定づけられることを明らかにした。さらに当該年度では、本手法をcis-スチルベンの光化学反応解析へ拡張した。本研究では、基底状態及び励起状態PESにおける重要な座標領域を含む多状態反応空間を構築し、光励起後から基底状態へ失活するまでの動的反応過程を可視化した。これにより、本手法は励起状態ダイナミクスと基底状態への失活ダイナミクスを包括的に議論可能なツールであることが実証された。
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A Report of the Science Experimental Lecture at Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University: pH Measurement Experiment Using Paper Device
冲绳科学技术大学院大学科学实验讲座报告:使用纸装置的pH测量实验
DOI:
10.14943/92750
发表时间:
2020
期刊:
科学技術コミュニケーション
影响因子:
--
作者:
[彦樺, 愉; 雄士, 小松; 優華, 文野; 拓朗, 堤; 雄大, 小川;]
通讯作者:
小川;
How to visualize chemical reaction pathways into 2-dimensional space: methodology and application
如何将化学反应路径可视化到二维空间:方法和应用
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takuro Tsutsumi, Yuriko Ono, Zin Arai, Tetsuya Taketsugu;]
通讯作者:
Tetsuya Taketsugu;
多次元尺度構成法に基づく固有反応座標および反応経路ネットワークの可視化
基于多维尺度的内在反应坐标和反应路径网络可视化
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[堤 拓朗, 小野ゆり子, 荒井 迅, 武次徹也]
通讯作者:
武次徹也
DOI:
10.1021/acs.jctc.0c00018
发表时间:
2020-07-14
期刊:
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION
影响因子:
5.5
作者:
[Tsutsumi, Takuro, Ono, Yuriko, Taketsugu, Tetsuya]
通讯作者:
Taketsugu, Tetsuya
Visualization technique of dynamical reaction pathways: application to non-IRC pathways of SN2 reaction
动态反应途径可视化技术:在SN2反应非IRC途径中的应用
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takuro Tsutsumi, Yuriko Ono, Zin Arai, Tetsuya Taketsugu;]
通讯作者:
Tetsuya Taketsugu;
共 28 条
低次元ポテンシャルエネルギー面に基づく反応動力学解析法の開発と光化学反応への応用
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批准号:22K14640
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2022
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负责人:堤 拓朗
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依托单位:
海外基金