先進的RNAスプライシング解析に基づく神経膠腫の新規治療法開発

基于先进RNA剪接分析开发神经胶质瘤新疗法

• 批准号: 22KJ1043
• 负责人: 栗川 美智子
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ1043/
• 关键词: IDH1変異; スプライシング異常; 神経膠腫

IDH変異のある神経膠腫におけるスプライシング異常が、あるRNA結合タンパク質「X」によって引き起こされる可能性があることを同定した。そのため、神経膠腫細胞であるU87細胞に「X」を過剰発現させ、遺伝子データベース（TCGA）上のデータとIDH1変異株でスプライシング異常が確認された遺伝子の一部について、「X」の過剰発現がスプライシング異常を強めるかどうかを調べた。しかし、「X」の高発現細胞ではスプライシング異常は見られなかった。次に、他の可能性のある遺伝子を探すために、IDH1/2遺伝子変異を導入した細胞でスプライシングに変化が見られる遺伝子を抽出し、その遺伝子郡に共通するDNA配列の配列やタンパク質との結びつきを調べた。その結果、AとGが高頻度にあらわれる配列が同定された。さらに、この配列に結びつく可能性のあるタンパク質の候補を抽出した。U87のIDH1変異株に対して、q値が高い上位4つの候補タンパク質をノックダウンした細胞を作り、スプライシングに変化があるかどうかを検証したが、変化は見られなかった。現在は、IDH変異神経膠腫の生存や増殖において必須な他の遺伝子を探すために、約500種類のRNA結合タンパク質に対するスクリーニングを行うための準備を進めている。

IDH is different from the original one, and the RNA knot is abnormal合タンパク性「X」によって影起こされる possibility があることを同定した.そのため, 神経猌紼秺であるU87 cells に「X」を剰発现させ, 睝子データベース(TCGA)上のデータとIDH1 divergence "The abnormality of the company's でスプライシング abnormality confirmation" " X》の过剰発现がスプライシング abnormal を强めるかどうかを动べた.しかし、「X」の高発 appear cells ではスプライシング abnormality は见られなかった. Second time, his possibility is not the same as the remaining one, IDH1/2 is the same as the remaining one, and the IDH1/2 is the same as the original one.化が见られる缝子を出し、その缝子君に公するDNA 配array の配array やタンパク性との knot びつきを Adjustment べた.そのRESULTS, AとGがHIGH FREQUENCY にあらわれる配arrayが同定された.さらに, このalignment に knot びつく possibility のあるタンパクquality の candidate をdraw した. U87のIDH1変different strainに対して、q値が高い上4つの candidateタンパクqualityをノックダウンしスプライシングに変化があるかどうかを検证したが, 変化は见られなかった. Now は, IDH変剉神経経浌生や Increase procreationにおいて必なhis の生伝子を探すために, about 5 00 kinds of RNA binding materials are available.