先進的RNAスプライシング解析に基づく神経膠腫の新規治療法開発

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IDH変異のある神経膠腫におけるスプライシング異常が、あるRNA結合タンパク質「X」によって引き起こされる可能性があることを同定した。そのため、神経膠腫細胞であるU87細胞に「X」を過剰発現させ、遺伝子データベース（TCGA）上のデータとIDH1変異株でスプライシング異常が確認された遺伝子の一部について、「X」の過剰発現がスプライシング異常を強めるかどうかを調べた。しかし、「X」の高発現細胞ではスプライシング異常は見られなかった。次に、他の可能性のある遺伝子を探すために、IDH1/2遺伝子変異を導入した細胞でスプライシングに変化が見られる遺伝子を抽出し、その遺伝子郡に共通するDNA配列の配列やタンパク質との結びつきを調べた。その結果、AとGが高頻度にあらわれる配列が同定された。さらに、この配列に結びつく可能性のあるタンパク質の候補を抽出した。U87のIDH1変異株に対して、q値が高い上位4つの候補タンパク質をノックダウンした細胞を作り、スプライシングに変化があるかどうかを検証したが、変化は見られなかった。現在は、IDH変異神経膠腫の生存や増殖において必須な他の遺伝子を探すために、約500種類のRNA結合タンパク質に対するスクリーニングを行うための準備を進めている。