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トゲウオにおける種分化メカニズムの解明

阐明刺鱼的物种形成机制

基本信息

批准号：
22KJ3096
负责人：
奥出絃太
金额：
$ 3.08万
依托单位：
National Institute of Genetics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2023
资助国家：
日本
起止时间：
2023-03-08 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、現在生殖隔離が成立しつつあるイトヨとニホンイトヨとの間で、雑種個体・戻し交配個体・野外交雑帯個体などを用いることで、様々な角度から雑種異常の原因遺伝子と原因変異を同定し、候補遺伝子の機能解析や他集団・他種との比較解析により、生殖隔離によりもたらされる種分化のメカニズムを考察する。3年計画の2年目である2022年度には、2021年度に1ヶ月おきに組織サンプリングを実施した、イトヨとニホンイトヨの雑種（精巣は異常）とイトヨおよびニホンイトヨの純系（精巣は正常）の精巣からRNAを抽出し、RNAseq法を用いた網羅的な遺伝子の発現解析を実施した。その結果、イトヨとニホンイトヨの雑種の異常な精巣では、精子形成の進行している時期に、純系の正常な精巣と比較して、いくつかの精子形成に重要な遺伝子の発現が低下していることが明らかになった。また、網羅的な遺伝子の比較解析から、雑種精巣で特異的に発現上昇・発現低下している遺伝子群も同定した。また、2021年度に作出した、ニホンイトヨのメスと様々な地域集団のイトヨや他のトゲウオ科魚類のオスとの雑種に関して、婚姻色を呈した性成熟後に精巣の様子を観察したところ、オス親としてどの地域集団のイトヨを用いた場合においても、ニホンイトヨのメスとイトヨのオスの雑種の精巣は異常になることが明らかになった。さらに、2021年度に作出したF1雑種のメスを用いて、成熟卵にイトヨのオスの精子をかけ合わることにより、雑種異常のQTL解析のための戻し交配個体を作出した。加えて、先進ゲノム支援の協力を得て、精巣異常となる雑種および正常な純系からそれぞれ精巣を摘出し、シングルセルRNAseq解析を実施し、シーケンスを得た。

In this study, we established the reproductive isolation between the present and future generations, and investigated the reproductive isolation between the species and mating individuals, and between the species and mating individuals and wild individuals. In 2022 and January 2021, the 2nd year of the 3-year plan, the organization of the virus was carried out, and the virus was isolated from the pure line (normal). RNA extraction and RNAseq analysis were carried out. As a result, the abnormal sperm production of sperm in pure lines is lower than that in normal sperm production. A comparative analysis of the characteristics of the netted species, the characteristics of the species, and the characteristics of the species. In the year of 2021, we made a decision on the selection of fish species from different species of fish species, and the selection of fish species from different species of fish species from different species of fish species. In 2021, QTL analysis of F1 hybrids was performed, and mature eggs and sperm were analyzed. The analysis of RNAseq is carried out in the following ways: to improve the quality of RNAseq analysis, to improve the quality of RNAseq analysis.