Epigenomic analysis of gastrointestinal cancer stroma

胃肠癌基质的表观基因组分析

• 批准号: 23659400
• 负责人: SHINOMURA Yasuhisa
• 金额: $ 2.33万
• 依托单位: Sapporo Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23659400/
• 关键词: 胃癌; 癌間質; エピジェネティクス; メチル化; 癌幹細胞

We aimed to analyze epigenome alterations in gastrointestinal cancer cells,cancerstroma and background non-cancerous mucosa. By performing Methylated CpG Amplification (MCA)-microarray analysis and bisulfite-pyrosequencing analysis, we detected methylationof tumor-related genes, such as SFRP1 and miR-34b/c, in gastric cancer cells as well as cancer stroma. Moreover, we identified aberrant methylation of a candidate cancer-related gene, RASGRF1, in both gastric cancer cells and background non-cancerous mucosa. We also found that methylationof RASGRF1 could be a potential biomarker to assess gastric cancer risk.

我们旨在分析胃肠道癌细胞、癌间质和背景非癌粘膜中的表观基因组改变。通过甲基化CpG扩增（MCA）-微阵列分析和亚硫酸氢盐-焦磷酸测序分析，我们检测了肿瘤相关基因如SFRP 1和miR-34 b/c在胃癌细胞以及癌间质中的甲基化。此外，我们确定了一个候选癌症相关基因RASGRF 1的异常甲基化，在胃癌细胞和背景非癌粘膜。我们还发现RASGRF 1甲基化可能是评估胃癌风险的潜在生物标志物。

项目成果

Genome-wide analysis of DNA methylation identifies novel cancer-related genes in hepatocellular carcinoma

• DOI: 10.1007/s13277-012-0378-3
• 发表时间: 2012-03
• 期刊: Tumor Biology
• 作者: M. Shitani;S. Sasaki;N. Akutsu;H. Takagi;Hiromu Suzuki;M. Nojima;Hiroyuki Yamamoto;T. Tokino

胃癌におけるエピジェジェティックな遺伝子異常の網羅的解析

胃癌表观遗传学异常的综合分析

• 发表时间: 2011
• 作者: T Ando;H Aizaki;M Sugiyama;M Mizokami;M Kuroda;T Wakita;Nishina et al;Tetsu Oura;高丸博之,鈴木拓,山本英一郎,丸山玲緒,神前正幸,新沼猛,青木由佳,澤田武,豊田実,篠村恭久
• 通讯作者: 高丸博之,鈴木拓,山本英一郎,丸山玲緒,神前正幸,新沼猛,青木由佳,澤田武,豊田実,篠村恭久

microRNA-34b/cの異常メチル化は胃癌の異時性多発リスクに関与する

microRNA-34b/c的异常甲基化与胃癌的异时多重风险有关

• 发表时间: 2012
• 作者: Satoh K;Fukumoto Y;Sugimura K;Miura Y;Nochioka K;Aoki T;Tatebe S;Yamamoto S;Shimizu T;Nakamura K;Ito H;Shimokawa H;鈴木亮,山本英一郎,鈴木拓,野島正寛,丸山玲緒,能正勝彦,山本博幸,甲斐正広,山野泰穂,菅井有,今井浩三,篠村恭久
• 通讯作者: 鈴木亮,山本英一郎,鈴木拓,野島正寛,丸山玲緒,能正勝彦,山本博幸,甲斐正広,山野泰穂,菅井有,今井浩三,篠村恭久

消化管間質腫瘍におけるmicroRNA発現プロファイル解析

胃肠道间质瘤中MicroRNA表达谱分析

• 发表时间: 2011
• 作者: Shaker M;Yokoyama Y;Mori S;Tsujimoto M;Kawaguchi N;Kiyono T;Nakano T;Matsuura N;Genda T;中野裕康;新沼猛,鈴木拓,野島正寛,高丸博之,能正勝彦,山本博幸,豊田実,篠村恭久
• 通讯作者: 新沼猛,鈴木拓,野島正寛,高丸博之,能正勝彦,山本博幸,豊田実,篠村恭久

miR-34b/cの異常メチル化は胃癌の異時性多発リスクに関与する

miR-34b/c 的异常甲基化与胃癌的异时多重风险有关

• 发表时间: 2012
• 作者: Nonaka K;Onizuka S;Ishibashi H;Uto Y;Hori H;Nakayama T;Matsuura N;Kanematsu T;Fujioka H;T Wakita;Nishina et al;鈴木 亮
• 通讯作者: 鈴木 亮