Biosynthetic Studies on Okadaic Acid

冈田酸的生物合成研究

• 批准号: 24651239
• 负责人: ABE Ikuro
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24651239/
• 关键词: オカダ酸; 生合成; 遺伝子

In this study, we tried to identify a gene cluster involved in the biosynthesis of okadaic acid in the dinoflagellate Prorocentrum hoffmanianum. As a result, we succeeded in the PCR amplifications of two PKS genes from the DNA isolated from P. hoffmanianum, and one PKS gene from the chloroplast DNA separated from P. hoffmanianum by using the degenerate primers based on the conserved sequences of bacterial PKSs. We also successfully detected the peptide sequences of the candidate PKSs by LC-orbitrap MS analyses. This is the first detection of a putative PKS proteins from P. hoffmanianum by the proteomic approach. These results will pave the way to future studies to understand the biosynthesis of the complex secondary metabolites in dinoflagellates.

在本研究中，我们试图确定一个基因簇参与的冈田酸生物合成的甲藻原甲藻霍夫曼manianum。结果表明，根据细菌PKS基因的保守序列设计的简并引物，成功地从霍夫曼瓶霉DNA中扩增出2个PKS基因，从霍夫曼瓶霉叶绿体DNA中扩增出1个PKS基因。我们还成功地检测了候选PKS的肽序列的LC-orbitrap MS分析。这是首次通过蛋白质组学方法从霍氏毕赤酵母中检测到PKS蛋白。这些结果将为进一步研究甲藻中复杂次级代谢产物的生物合成奠定基础。

项目成果

Expanding the catalytic repertoires of biosynthetic enzyme

扩大生物合成酶的催化能力

• 发表时间: 2013
• 作者: Abe;I.
• 通讯作者: I.

Natural products : discourse, diversity and design

• 发表时间: 2014
• 作者: A. Osbourn;R. Goss;G. Carter

LC-MSによる渦鞭毛藻由来ポリケタイド合成酵素の検出

通过 LC-MS 检测甲藻衍生的聚酮合酶

• 发表时间: 2013
• 作者: 淡川孝義;Ioana NTAI;佐竹真幸;Neil KELLEHER;橘和夫;阿部郁朗
• 通讯作者: 阿部郁朗

A bacterial symbiont of Japanese marine sponge Discodermia calyx, produces biologically active metabolites

日本海洋海绵 Discodermia 花萼的细菌共生体，产生生物活性代谢物

• 发表时间: 2013
• 作者: T. Wakimoto;Y. Egami;Y. Nakashima;I. Abe
• 通讯作者: I. Abe

生合成工学による創薬

通过生物合成工程发现药物

• 发表时间: 2014
• 期刊: ファルマシア
• 作者: Ryo Tashita;Syusuke Egoshi;Minoru Ueda;上田実;上田 実;阿部郁朗
• 通讯作者: 阿部郁朗